| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,333,818 | T→G | N6K (AAT→AAG) | unknown → | Poly(A) polymerase (EC 2.7.7.19) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,333,818 | 0 | T | G | 100.0% | 177.6 / NA | 62 | N6K (AAT→AAG) | unknown | Poly(A) polymerase (EC 2.7.7.19) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (31/31); total (31/31) | |||||||||||
TATTAAACGTTTAGAAGCGCGCCCAACCGCCGATCTTTGTATCGATTGCAAAACCCTGGCGGAAATTCGCGAAAAACAAATGGTGGGTTAATCCTGCTAATTCATTGATAAAAGTGCGGTCAAAAAACACATTATTTTTCGACCGCACTTTCACTTTATTTTTGTGATAAATGGAGATGTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAATAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGTTCAAGGTTCCTCCCGCAACAAAAAAAACACGCATAAAAAAGAATTCAAACACAGTATTAAAGCCTCAATGCACGGCATTACGCCGCGCATGATCAATCGCCATGCGTTGACCGTGGTGGAAAAATTACAACGCCAAGGCTATGAAGCCTATGTGGTCGGCGG > 1/1333594‑1334063 | tATTAAACGTTTAGAAGCGCGCCAAACCGCCGATCTTTGTATCGATTGCAAAACCCTGGCGGAAATTCGCGAAAAACAAATGGTGGGTTAATCCTGCTAATTCATTGATAAAAGTGCGGTCAAAAAACACATTATTTTTCGACCGCACTTTCACTTTATTTTTGTGATAAATGGAGATGTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGt < 1:782850/251‑1 (MQ=255) gttaaGAAGCGCCCCCAACCGCCGATCTTTGTATCGATTGCAAAACCCTGGCGGAAATTCGCGAAAAACAAATGGTGGGTTAATCCTGCTAATTCATTGATAAAAGTGCGGTCAAAAAACACATTATTTTTCGACCGCACTTTCACTTTATTTTTGTGATAAATGGAGATGTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTc < 1:384567/224‑1 (MQ=255) gTTTAGAAGCGCGCCCAACCGCCGATCTTTGTATCGATTGCAAAACCCTGGCGGAAATTCGCGAAAAACAAATGGTGGGTTAATCCTGCTAATTCATTGATAAAAGTGCGGTCAAAAAACACATTATTTTTCGACCGCACTTTCACTTTATTTTTGTGATAAATGGAGATGTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGt > 1:42377/1‑249 (MQ=255) aaCCGCCGATCTTTGTATCGATTGCAAAACCCTGGCGGAAATTCGCGAAAAACAAATGGTGGGTTAATCCTGCTAATTCATTGATAAAAGTGCGGTCAAAAAACACATTATTTTTCGACCGCACTTTCACTTTATTTTTGTGATAAATGGAGATGTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATc < 1:694556/251‑1 (MQ=255) aTCTTTGTATCGATTGCAAAACCCTGGCGGAAATTCGCGAAAAACAAATGGTGGGTTAATCCTGCTAATTCATTGATAAAAGTGCGGTCAAAAAACACATTATTTTTCGACCGCACTTTCACTTTATTTTTGTGATAAATGGAGATGTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTg < 1:285321/251‑1 (MQ=255) tCTTTGTATCGATTGCAAAACCCTGGCGGAAATTCGCGAAAAACAAATGGTGGGTTAATCCTGCTAATTCATTGATAAAAGTGCGGTCAAAAAACACATTATTTTTCGACCGCACTTTCACTTTATTTTTGTGATAAATGGAGATGTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGa > 1:570459/1‑251 (MQ=255) ttGCAAAACCCTGGCGGAAATTCGCGAAAAACAAATGGTGGGTTAATCCTGCTAATTCATTGATAAAAGTGCGGTCAAAAAACACATTATTTTTCGACCGCACTTTCACTTTATTTTTGTGATAAATGGAGATGTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTg > 1:118427/1‑238 (MQ=255) aTTCGCGAAAAACAAATGGTGGGTTAATCCTGCTAATTCATTGATAAAAGTGCGGTCAAAAAACACATTATTTTTCGACCGCACTTTCACTTTATTTTTGTGATAAATGGAGATGTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAGCCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAAcaaggttcaaggt < 1:213858/251‑1 (MQ=255) aTTCGCGAAAAACAAATGGTGGGTTAATCCTGCTAATTCATTGATAAAAGTGCGGTCAAAAAACACATTATTTTTCGACCGCACTTTCACTTTATTTTTGTGATAAATGGAGATGTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAAcaaggttcaaggt < 1:729858/251‑1 (MQ=255) aTTCGCGAAAAACAAATGGTGGGTTAATCCTGCTAATTCATTGATAAAAGTGCGGTCAAAAAACACATTATTTTTCGACCGCACTTTCACTTTATTTTTGTGATAAATGGAGATGTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAAcaaggttcaaggt < 1:399118/251‑1 (MQ=255) ggTTAATCCTGCTAATTCATTGATAAAAGTGCGGTCAAAAAACACATTATTTTTCGACCGCACTTTCACTTTATTTTTGTGATAAATGGAGATGTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGTTCAAGGTtcctcc > 1:561612/1‑236 (MQ=255) 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gTCAAAAAACACATTATTTTTCGACCGCACTTTCACTTTATTTTTGTGATAAATGGAGATGTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGTTCAAGGTTCCTCCCGCAACAAAAAAAACACGCATAAAAAAGAATTCAAACACAGTATTaa < 1:67056/250‑1 (MQ=255) tCAAAAAACACATTATTTTTCGACCGCACTTTCACTTTATTTTTGTGATAAATGGAGATGTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGTTCAAGGTTCCTCCCGCAACAAAAAAAACACGCATAAAAAAGAATTCAAACACAGTATTAAAg < 1:714471/251‑1 (MQ=255) tCAAAAAACACATTATTTTTCGACCGCACTTTCACTTTATTTTTGTGATAAATGGAGATGTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGTTCAAGGTTCCT‑CCGCAACAAAAAAAACACGCATAAAAAAGAATTCAAACACAGTATTAAAGc < 1:697330/251‑1 (MQ=255) ataatgtgttttttGACCGCACTTTCACTTTATTTTTGTGATAAATGGAGATGTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGTTCAAGGTTCCTCCCGCAACAAAAAAAACACGAATAAAAAAGAATTCAAACACAGTATTAAAGCCTCAAt > 1:612260/9‑251 (MQ=255) aCCGCACTTTCACTTTATTTTTGTGATAAATGGAGATGTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGTTCAAGGTTCCTCCCGCAACAAAAAAAACACGCATAAAAAAGAATTCAAACACAGTATTAAAGCCTCAATGCACGGCATTAcgc < 1:578754/250‑1 (MQ=255) ctttATTTTTGTGATAAATGGAGATGTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGATCAAGGTTCCTCCCGCAACAAAAAAAACACGCATAAAAAAGAATTCAAACACAGTATTAAAGCCTCAATGCACGGCATTACGCCGCGCATGATCaa > 1:678851/1‑251 (MQ=255) 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gTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGTTCAAGGTTCCTCCCGCAACAAAAAAAACACGCATAAAAAAg < 1:258041/171‑1 (MQ=255) gTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGTTCAAGGTTCCTCCCGCAACAAAAAAAACACGCATAAAAAAGAATTCAAACACAGTATTaa > 1:306127/1‑190 (MQ=255) gTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGTTCAAGGTTCCTCCCGCAACAAAAAAAACACGCATAAAAAAGAATTCAAACACAGTATTAAAg < 1:240614/192‑1 (MQ=255) gTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGTTCAAGGTTCCTCCCGCAACAAAAAAAACACGCATAAAAAAGAATTCAAACACAGTATTAAAGCCTCAATGCACGGCATTAcgc > 1:533750/1‑213 (MQ=255) 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cTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGTTCAAGGTTCCTCCCGCAACAAAAAAAACACGCATAAAAAAGAATTCAAACACAGTATTAAAGc < 1:774421/186‑1 (MQ=255) ttACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGTTCAAGGTTCCTCCCGCAACAAAAAAAACACGCATAAAAAAGAATTCAAacac < 1:558656/173‑1 (MQ=255) aCCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGTTCAAGGTTCCTCCCGCAACAAAAAAAACACGCATAAAAAAGAATTCAAACACAGTATTAAAGCCTCAATGCACGGCATTACGCCGCGCATGATCAATCGCCATGCGTTGACCGTGGTGGaaaaa < 1:768734/243‑1 (MQ=255) ccTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGTTCAAGGTTCCTCCCGCAACAAAAAAAACACGCATAAAAAAGAATTCAAACACAGTATTAAAGCCTCAATGCACGGCATTACGCCGCGCATGATCAATCGCCATGCGTTGACCGTGGTGGAAAAATTACAACg > 1:573160/1‑250 (MQ=255) atatTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAAcc > 1:434178/1‑41 (MQ=255) atatTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGTTCAAGGTTCCTCCCGCAACAAAAAAAACACGCATAAAAAAGAATTCAAACACAGTATTAAAGc > 1:427613/1‑178 (MQ=255) atatTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGTTCAAGGTTCCTCCCGCAACAAAAAAAACACGCATAAAAAAGAATTCAAACACAGTATTAAAGCCTCAATGCACGGCATTAcgc < 1:369692/198‑1 (MQ=255) atatTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGTTCAAGGTTCCTCCCGCAACAAAAAAAACACGCATAAAAAAGAATTCAAACACAGTATTAAAGCCTCAATGCACGGCATTAcgc < 1:884846/198‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGTTCAAGGTTCCTCCCGCAACAAAAAAAACACGCATAAAAAAGAATTCAAACACAGTATTAAAGCCTCAATGCACGGCATTACGCCGCGCATGATCAATCGCCATGCGTTGACCGTGGTGGAAAAATTACAACGCCAAGGc < 1:288079/251‑1 (MQ=255) aGAAAACGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGTTCAAGGTTCCTCCCGCAACAAAAAAAACACGCATAAAAAAGAATTCAAACACAGTATTaa > 1:150141/1‑154 (MQ=255) aCGAAGAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGTTCAAGGTTCCTCCCGCAACAAAAAAAACACGCATAAAAAAGAATTCAAACACAGTATTAAAGCCTCAATGCACGGCATTACGCCGCGCATGATCAATCGCCATGCGTTGACCGTGGTGGAAAAATTACAACGCCAAGGCTATGAAGCCTATGTGGTcggcgg < 1:234282/251‑1 (MQ=255) | TATTAAACGTTTAGAAGCGCGCCCAACCGCCGATCTTTGTATCGATTGCAAAACCCTGGCGGAAATTCGCGAAAAACAAATGGTGGGTTAATCCTGCTAATTCATTGATAAAAGTGCGGTCAAAAAACACATTATTTTTCGACCGCACTTTCACTTTATTTTTGTGATAAATGGAGATGTATTATCTTTACCTATATTAAAAATCTTTTGAGCAAGAAAACGAATAACAAAACCTCCGCTCAAAATGAAGTTAAAGTCTCGCCTAAAAAACAATCCGTTATTGAATCTGAACCTGTAAAAAACAAGGTTCAAGGTTCCTCCCGCAACAAAAAAAACACGCATAAAAAAGAATTCAAACACAGTATTAAAGCCTCAATGCACGGCATTACGCCGCGCATGATCAATCGCCATGCGTTGACCGTGGTGGAAAAATTACAACGCCAAGGCTATGAAGCCTATGTGGTCGGCGG > 1/1333594‑1334063 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |