| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,322,022 | T→C | D150D (GAT→GAC) | unknown → | Putative ABC transporter of substrate X, permease subunit I |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,322,022 | 0 | T | C | 98.7% | 206.5 / NA | 74 | D150D (GAT→GAC) | unknown | Putative ABC transporter of substrate X, permease subunit I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (42/31); total (42/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.32e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGATGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCGCTGACACTCGGTGCCGTGCAGGTTTCCTTTATTTTGATTTTCATCGGCGCGCTGGGCGATTTTGCCTTTTACAGTATTGCCGG > 1/1321777‑1322267 | tATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAAtt < 1:227625/251‑1 (MQ=255) gtgtCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTgggg > 1:835645/1‑248 (MQ=255) tgtCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTgcggcg < 1:870319/249‑1 (MQ=255) atCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGc < 1:846008/213‑1 (MQ=255) cGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCtt < 1:766799/251‑1 (MQ=255) ggCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTg > 1:495229/1‑251 (MQ=255) cTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGcc < 1:137360/251‑1 (MQ=255) cTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGcc < 1:313784/251‑1 (MQ=255) ccccATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAAtg > 1:316925/1‑226 (MQ=255) ccccATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCcttaa > 1:62255/1‑251 (MQ=255) ccATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCcttaatc < 1:856327/251‑1 (MQ=255) ccATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCcttaat > 1:277086/1‑250 (MQ=255) cATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCcttaatct < 1:136472/251‑1 (MQ=255) ccATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGcc < 1:111496/239‑1 (MQ=255) ccATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCcttaatc < 1:732734/245‑1 (MQ=255) gCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATcggc > 1:886141/1‑244 (MQ=255) gTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGAGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTa > 1:396375/1‑251 (MQ=255) aaaaCTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCGCGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAGCCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAAtt < 1:97260/251‑1 (MQ=255) tCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGAttt < 1:143513/250‑1 (MQ=255) cTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCaaa > 1:115968/1‑180 (MQ=255) cTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTTATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTa > 1:636819/1‑248 (MQ=255) cTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTa > 1:197422/1‑248 (MQ=255) cTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTa > 1:318700/1‑248 (MQ=255) cTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTa > 1:781786/1‑248 (MQ=255) attatCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTACATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTc > 1:407052/1‑193 (MQ=255) attatCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGa > 1:101970/1‑251 (MQ=255) attatCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGa > 1:27233/1‑251 (MQ=255) attatCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGa > 1:439258/1‑251 (MQ=255) ttatCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGAt < 1:673249/251‑1 (MQ=255) tatCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGAt < 1:620532/250‑1 (MQ=255) atCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGc < 1:693954/251‑1 (MQ=255) aCCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGc < 1:114029/251‑1 (MQ=255) ccATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCg > 1:385796/1‑251 (MQ=255) ccATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCg > 1:525862/1‑251 (MQ=255) aTCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCgg > 1:189292/1‑250 (MQ=255) cTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTaa > 1:645707/1‑224 (MQ=255) ttACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCaaa > 1:11597/1‑251 (MQ=255) tACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCcttaatcttaat < 1:404277/199‑1 (MQ=255) tACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTAc < 1:548385/234‑1 (MQ=255) tACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGAAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAAt > 1:445054/1‑251 (MQ=255) gCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAgg > 1:24412/1‑251 (MQ=255) cTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGacac < 1:769243/250‑1 (MQ=255) cTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGacac > 1:182090/1‑250 (MQ=255) cTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGacac < 1:195077/250‑1 (MQ=255) cGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCaa < 1:599186/251‑1 (MQ=255) ggATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCaaa < 1:782509/142‑1 (MQ=255) ggTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGttt > 1:791308/1‑250 (MQ=255) ccgccTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTa < 1:885635/250‑1 (MQ=255) ccgccTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTAt > 1:839739/1‑251 (MQ=255) gccTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTAtgt > 1:116230/1‑251 (MQ=255) ttGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCg > 1:325417/1‑251 (MQ=255) cATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGATGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCGCTGacac < 1:431981/251‑1 (MQ=255) cATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCGCTGacac < 1:216475/251‑1 (MQ=255) gATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCGCTGACACTCg > 1:92227/1‑251 (MQ=255) tCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCGCTGACACTCGGTGCCGTGc < 1:887027/251‑1 (MQ=255) cGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCGCTGACACTCGGTGCCGTGCAgg > 1:344586/1‑251 (MQ=255) ttttAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCGCTGACACTCGGTGCCGTGCAGGTTTc > 1:485078/1‑250 (MQ=255) gTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCGCTGACACTc > 1:373384/1‑222 (MQ=255) gTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCGCTGACACTCGGTGCCGTGCAGGTTTCCTTTATTTTGAt > 1:486139/1‑251 (MQ=255) ttatttaGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCGCTGACACTCGGTGCCGTGCAGGTTTCCTTTATTTTGATTTTCATCg > 1:843958/1‑251 (MQ=255) gatttaGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCGCTGACACTCGGTGCCGTGCAGGTTTCCTTTATTTTGATTTTCATCgg > 1:291674/2‑251 (MQ=255) tCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGa < 1:479625/186‑1 (MQ=255) tCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCGCTGACACTCGGTGCCGTGCAGGTTTCCTTTATTTTGATTTTCATCGGCGCGCTggg > 1:133359/1‑250 (MQ=255) gggATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGaaa > 1:874739/1‑68 (MQ=255) gATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCGCTGACACTCGGTGCCGTGCAGGTTTCCTTTATTTTGATTTTCATCGGCGCGCTGGGCGAttt > 1:698871/1‑251 (MQ=255) gCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAAc > 1:356262/1‑161 (MQ=255) gCCGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCGCTGACACTCGGTGCCGTGCAGGTTTCCTTTATTTTGATTTTCATCGGCGCGCTGGGCGATTTTGc > 1:463344/1‑249 (MQ=255) ccGAAAACCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCGCTGACACTCGGTGCCGTGCAGGTTTCCTTTATTTTGATTTTCATCGGCGCGCTGGGCGATTTTGCCt < 1:10497/250‑1 (MQ=255) aaaCCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCGCTGACACTCGGTGCCGTGCAGGTTTCCTTTATTTTGATTTTCATCGGCGCGCTGGGCGATTTTGCCTTTTAc < 1:767269/251‑1 (MQ=255) aaaCCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCGCTGACACTCGGTGCCGTGCAGGTTTCCTTTATTTTGATTTTCATCGGCGCGCTGGGCGATTTTGCCTTTTAc < 1:641069/251‑1 (MQ=255) aCCCTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCGCTGACACTCGGTGCCGTGCAGGTTTCCTTTATTTTGATTTTCATCGGCGCGCTGGGCGATTTTGCCTTTTACAg > 1:689755/1‑251 (MQ=255) cTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCGCTGACACTCGGTGCCGTGCAGGTTTCCTTTATTTTGATTTTCATCGGCGCGCTGGGCGATTTTGCCTTTTACAGTAt < 1:728533/251‑1 (MQ=255) cTGCAAAACGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCGCTGACACTCGGTGCCGTGCAGGTTTCCTTTATTTTGATTTTCATCGGCGCGCTGGGCGATTTTGCCTTTTACAGTAt > 1:443850/1‑251 (MQ=255) aaCGACGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCGCTGACACTCGGTGCCGTGCAGGTTTCCTTTATTTTGATTTTCATCGGCGCGCTGGGCGATTTTGCCTTTTACAGTATTGCCgg < 1:47522/251‑1 (MQ=255) | TATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTGCCGGGATTGGTCGCCGCCTTCCTGTTTGTCAACATGATTTCCTATCACGGCATTTTAAATGAAGTCTTTGTTTATTTAGGCATCTGGGATGAGCCGAAAACCCTGCAAAACGATGAATTCGGCTGGGGCGTGGTGATTTTGCAAATGTGGAAAAATATTCCTTTTGCCTTAATCTTAATCGGCGGCGCGGTAAATTCGTTAAAAACCGATTTACTGGATGCAGCGGCAAATTTAGGTTCGACACCATGGCAACGGTTTCATTATGTGATTTTCCCGCTGACACTCGGTGCCGTGCAGGTTTCCTTTATTTTGATTTTCATCGGCGCGCTGGGCGATTTTGCCTTTTACAGTATTGCCGG > 1/1321777‑1322267 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |