| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,321,668 | T→C | V32V (GTT→GTC) | unknown → | Putative ABC transporter of substrate X, permease subunit I |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,321,668 | 0 | T | C | 100.0% | 216.9 / NA | 74 | V32V (GTT→GTC) | unknown | Putative ABC transporter of substrate X, permease subunit I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (41/33); total (41/33) | |||||||||||
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gTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGt > 1:202257/1‑238 (MQ=255) gTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGACTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTgg > 1:454460/1‑251 (MQ=255) cTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGa < 1:386564/51‑1 (MQ=255) cTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGgtg < 1:548375/100‑1 (MQ=255) cTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCAc > 1:892675/1‑225 (MQ=255) 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cTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGGCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGt > 1:633399/1‑235 (MQ=255) atatTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCtattat > 1:330574/1‑160 (MQ=255) | TTTATGGGCAATATCACAGAAGTGCAGGGCATGGTGCAACGGGACGGCGAAGAGAAAAAATTACGTTTGCAATTAACGAAATGCCCGAATTTGAGCGATACGCTGACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTTGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTG > 1/1321421‑1321908 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |