| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,313,697 | G→T | intergenic (‑174/‑119) | unknown ← / → unknown | Sugar fermentation stimulation protein SfsA/NAD(P) transhydrogenase N‑domain of subunit alpha (EC 1.6.1.2) / NAD(P) transhydrogenase C‑domain of subunit alpha (EC 1.6.1.2) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,313,697 | 0 | G | T | 100.0% | 99.9 / NA | 36 | intergenic (‑174/‑119) | unknown/unknown | Sugar fermentation stimulation protein SfsA/NAD(P) transhydrogenase N‑domain of subunit alpha (EC 1.6.1.2) / NAD(P) transhydrogenase C‑domain of subunit alpha (EC 1.6.1.2) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (21/15); total (21/15) | |||||||||||
GAATTAAGGTTGCGGATTGGAGAGATGGTAATTGCATAGTGTTGACCTTTGAACAATAAAGTGCGGTTGATTTTTTAAGTGTTTTTAGCACACCAAAGTTAAATAGTGGAAAACGATTAGTGCGCTAAAATAGCAAAGTTAGTAGTGAATTTCTAA‑TTTTTTTGCATAAATGAAGTATTGTAATAGGGATTACATATCAAAGAAAAAGCTGAAAAAATTTTTTTACTTTTTCCTCATCAATGATAGAGTTAGTTACAGTTTGGCTGTTTTAGAATAGTCACTTGGGGGGTAATTTTACCCGGATTATTAATCAATCAAAGGGAATCATTATGTTAATTGGTGTACCTAGAGAACTACTTGATAATGAAAGTCGCGTGGCGGCAACGCCGAAGACGGTTCAGCAAATTTTGAAGCTTGGCTTTGAGGTGATTGTTGAACATGATGC > 1/1313487‑1313931 | gaATTAAGGTTGCGGATTGGAGAGATGGTAATTGCATAGTGTTGACCTTTGAACAATAAAGTGCGGTTGATTTTTTAAGTGTTTTTAGCACACCAAAGTTAAATAGTGGAAAACGATTAGTGCGCTAAAATAGCAAAGTTAGTAGTGAATTTCTAA‑TTTTTTTGCATAAATGAAGTATTGTAATAGGGATTACATATCAAAGAAAAAGCTTAAAAAATTTTTTTACTTTTTCCTCATCAATGATAGagtta > 1:880483/1‑251 (MQ=255) aaTTAAGGTTGCGGATTGGAGAGATGGTAATTGCATAGTGTTGACCTTTGAACAATAAAGTGCGGTTGATTTTTTAAGTGTTTTTAGCACACCAAAGTTAAATAGTGGAAAACGATTAGTGCGCTAAAATAGCAAAGTTAGTAGTGAATTTCTAA‑TTTTTTTGCATAAATGAAGTATTGTAATAGGGATTACATATCAAAGAAAAAGCTTAAAAAATTTTTTTACTTTTTCCTCATCAATGATagag < 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(MQ=255) tGCGCTAAAATAGCAAAGTTAGTAGTGAATTTCTAA‑TTTTTTTGCATAAATGAAGTATTGTAATAGGGATTACATATCAAAGAAAAAGCTTAAAAAATTTTTTTACTTTTTCCTCATCAATGATAGAGTTAGTTACAGTTTGGCTGTTTTAGAATAGTCACTTGGGGGGTAATTTTACCCGGATTATTAATCAATCAAAGGGAATCATTATGTTAATTGGTGTACCTAGAGAACTACTTGATAATGAAAGt < 1:394276/251‑1 (MQ=255) gTTAGTAGTGAATTTCTAA‑TTTTTTTGCATAAATGAAGTATTGTAATAGGGATTACATATCAAAGAAAAAGCTTAAAAAATTTTTTTACTTTTTCCTCATCAATGATAGAGTTAGTTACAGTTTGGCTGTTTTAGaa < 1:568006/137‑1 (MQ=255) gTATTGTAATCGGGATTACATATCAAAGAAAAAGCTTAAAAAATTTTTTTACTTTTTCCTCATCAATGATAGAGTTAGTTACAGTTTGGCTGTTTTAGAATAGTCACTTGGGGGGTAATTTTACCCGGATTATTAATCAATCAAAGGGAATCATTATGTTAATTGGTGTACCTAGAGAACTACTTGATAATGAAAGTCGCGTGGCGGCAACGCCGAAGACGGTTCAGCAAATTTTGAAGCTTGGCTTTGAg > 1:714360/1‑251 (MQ=255) gTATTGTAATAGGGATTACATATCAAAGAAAAAGCTTAAAAAATTTTTTTACTTTTTCCTCATCAATGATAGAGTTAGTTACAGTTTGGCTGTTTTAGAATAGTCACTTGGGGGGTAATTTTACCCGGATTATTAATCAATCAAAGGGAATCATTATGTTAATTGGTGTACCTAGAGAACTACTTGATAATGAAAGTCGCGTGGCGGCAACGCCGAAGACGGTTCAGCAAATTTTGAAGCTTGGCTTTGAg > 1:399584/1‑251 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |