| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,260,882 | T→C | intergenic (+11/+87) | unknown → / ← unknown | Biotin synthase (EC 2.8.1.6)/Outer membrane stress sensor protease DegQ, serine protease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,260,882 | 0 | T | C | 100.0% | 292.3 / NA | 96 | intergenic (+11/+87) | unknown/unknown | Biotin synthase (EC 2.8.1.6)/Outer membrane stress sensor protease DegQ, serine protease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (45/51); total (45/51) | |||||||||||
CACCATCGCCGTGGCGCGTATCACCATGCCGAACAGCTATGTGCGCTTATCCGCCGGTCGCCAGGGCATGAGCGAAGAAATGCAGGCAATGTGCTTCATGGCAGGCGCTAATTCCATTTTCTACGGCGACAAACTCCTCGTCACCGGCAACCCGGAAGAAGACGGCGACCGTCTGCTGATGGAAAAACTCGATTTAGAACCGGAGACGGAAGAGAATAAGTATTTGCGTTAATGGTGGATTCTTTTGAAGGGCATGTGAAGTACTAAGCCCTTATAGGGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTATTTTTATTGCAGATTATTGCACCAGTAAATAGAAGTTACTATCGCCACGAATAATGTTCAAGGCAACGGCAGACGGTTTTTTATCTAACTCTTTGCGCAGTTGTCCGAGATTTTCTATTTTCTGGCGATTGATTCCGATAATCACATCACCGGTTTTTAAACCACGTTGTT > 1/1260640‑1261126 | cACCATCGCCGTGGCGCGTATCACCATGCCGAACAGCTATGTGCGCTTATCCGCCGGTCGCCAGGGCATGAGCGAAGAAATGCAGGCAATGTGCTTCATGGCAGGCGCTAATTCCATTTTCTACGGCGACAAACTCCTCGTCACCGGCAACCCGGAAGAAGACGGCGACCGTCTGCTGATGGAAAAACTCGATTTAGAACCGGAGACGGAAGAGAATAAGTATTTGCGTTAATGGTGGATTCCTTTGAAgg > 1:189481/1‑251 (MQ=255)cACCATCGCCGTGGCGCGTATCACCATGCCGAACAGCTATGTGCGCTTATCCGCCGGTCGCCAGGGCATGAGCGAAGAAATGCAGGCAATGTGCTTCATGGCAGGCGCTAATTCCATTTTCTACGGCGACAAACTCCTCGTCACCGGCAACCCGGAAGAAGACGGCGACCGTCTGCTGATGGAAAAACTCGATTTAGAACCGGAGACGGAAGAGAATAAGTATTTGCGTTAATGGTGGATTCCTTTGAAg < 1:10882/250‑1 (MQ=255)cACCATCGCCGTGGCGCGTATCACCATGCCGAACAGCTATGTGCGCTTATCCGCCGGTCGCCAGGGCATGAGCGAAGAAATGCAGGCAATGTGCTTCATGGCAGGCGCTAATTCCATTTTCTACGGCGACAAACTCCTCGTCACCGGCAACCCGGAAGAAGACGGCGACCGTCTGCTGATGGAAAAACTCGATTTAGAACCGGAGACGGAAGAGAATAAGTATTTGCGTTAATGGTGGATTCCTTTGAAg < 1:207500/250‑1 (MQ=255)cACCATCGCCGTGGCGCGTATCACCATGCCGAACAGCTATGTGCGCTTATCCGCCGGTCGCCAGGGCATGAGCGAAGAAATGCAGGCAATGTGCTTCATGGCAGGCGCTAATTCCATTTTCTACGGCGACAAACTCCTCGTCACCGGCAACCCGGAAGAAGACGGCGACCGTCTGCTGATGGAAAAACTCGATTTAGAACCGGAGACGGAAGAGAATAAGTATTTGCGTTAATGGTGGATTCCTTTGAAg < 1:458865/250‑1 (MQ=255) aCCATCGCCGTGGCGCGTATCACCATGCCGAACAGCTATGTGCGCTTATCCGCCGGTCGCCAGGGCATGAGCGAAGAAATGCAGGCAATGTGCTTCATGGCAGGCGCTAATTCCATTTTCTACGGCGACAAACTCCTCGTCACCGGCAACCCGGAAGAAGACGGCGACCGTCTGCTGATGGAAAAACTCGATTTAGAACCGGAGACGGAAGAGAATAAGTATTTGCGTTAATGGTGGATTCCTTTGAAggg < 1:262301/251‑1 (MQ=255) ccGTGGCGCGTATCACCATGCCGAACAGCTATGTGCGCTTATCCGCCGGTCGCCAGGGCATGAGCGAAGAAATGCAGGCAATGTGCTTCATGGCAGGCGCTAATTCCATTTTCTACGGCGACAAACTCCTCGTCACCGGCAACCCGGAAGAAGACGGCGACCGTCTGCTGATGTAAAAACTCGATTTAGAACCGGAGACGGAAGAGAATAAGTATTTGCGTTAATGGTGGATTCCTTTGAAGGGCATGTGa > 1:739746/1‑251 (MQ=255) ccGTGGCGCGTATCACCATGCCGAACAGCTATGTGCGCTTATCCGCCGGTCGCCAGGGCATGAGCGAAGAAATGCAGGCAATGTGCTTCATGGCAGGCGCTAATTCCATTTTCTACGGCGACAAACTCCTCGTCACCGGCAACCCGGAAGAAGACGGCGACCGTCTGCTGATGGAAAAACTCGATTTAGAACCGGAGACGGAAGAGAATAAGTATTTGCGTTAATGGTGGATTCCTTTGAAGGGCATGTGa < 1:885236/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |