| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,238,483 | A→G | L121L (CTT→CTC) | unknown ← | Formate dehydrogenase formation protein FdhE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,238,483 | 0 | A | G | 100.0% | 231.2 / NA | 81 | L121L (CTT→CTC) | unknown | Formate dehydrogenase formation protein FdhE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (44/37); total (44/37) | |||||||||||
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ccAGCCATTCGATGGTGGCGAGCGTTTGATCGTTGGCGGAAGGTCTTAATTTCGCCAAAAGTGCGGTCAATAATTCGCGCCAAATGGGATCCCGTTGCCGGCTTTTAACGTCTAAAGGCTTATTTCCCAATTGTTCGGCAGAGAGTGCCTGTAAACGCGGATCCTGCGGAATCGGCATGGTTTCCAAGAGTTCCAGCTGCGCATCTGCGATAGCGGCGGCGAACAGCAAATAATTGGCGAGCGGGTGATCt < 1:458663/251‑1 (MQ=255) ggCCATTCGATGGTTGCGAGCGTTTGATCGTTGGCGGAATGTCTTAATTTCGCCAAAAGTGCGGTCAATAATTCGCGCCAAATGGGATCCCGTTGCCGGCTTTTAACGTCTAAAGGCCTATTTCCCAATTGTTCGGc < 1:127302/136‑1 (MQ=255) cATTCGATGGTGGCGAGCGTTTGATCGTTGGCGGAAGGTCTTAATTTCGCCAAAAGTGCGGTCAATAATTCGCGCCAAATGGGATCCCGTTGCCGGCTTTTAACGTCTAAAGGCTTATTTCCCAATTGTTCGGCAGAGAGTGCCTGTAAACGCGGATCCTGCGGAATCGGCATGGTTTCCAAGAGTTCCAGCTGCGCATCTGCGATAGCGGCGGCGAACAGCAAATAATTGGCGAGCGGGTGATCTTgcgc < 1:416828/251‑1 (MQ=255) aTTCGATGGTGGCGAGCGTTTGATCGTTGGCGGAAGGTCTTAATTTCGCCAAAAGTGCGGTCAATAATTCGCGCCAAATGGGATCCCGTTGCCGGCTTTTAACGTCTAAAGGCTTATTTCCCAATTGTTCGGCAGAGAGTGCCTGTAAACGCGGATCCTGCGGAATCGGCATGGTTTCCAAGAGTTCCAGCTGCGCATCTGCGATAGCGGCGGCGAACAGCAAATAATTGGCGAGCGGGTGATCTTgcgc < 1:439752/250‑1 (MQ=255) 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GAAATGAATCATGCTGGCGGTCGGCGCAGAGCTGCAAACAGGGCAGATGTGCAGGTTTTCGGTGCTTTCCTGTTTGGCGTTGTAGGGAATCTGTTGGACTAATTGCAACCAATATAAAGAAAGCGCCGCCCACACGAACACCGCTTTGTCGCTGGAAATCACCGCAAATTCCTGTGCTAAAACCTTATCGGCAAGATTTTCCAATTCGCTGTCTGCCGCTTTTTCCAGCCATTCGATGGTGGCAAGCGTTTGATCGTTGGCGGAAGGTTTTAATTTCGCCAAAAGTGCGGTCAATAATTCGCGCCAAATGGGATCCCGTTGCCGGCTTTTAACGTCTAAAGGCTTATTTCCCAATTGTTCGGCAGAGAGTGCCTGTAAACGCGGATCCTGCGGAATCGGCATGGTTTCCAAGAGTTCCAGCTGCGCATCTGCGATAGCGGCGGCGAACAGCAAATAATTGGCGAGCGGGTGATCTTGCGCCAATTCT > 1/1238240‑1238726 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |