| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,226,189 | G→A | intergenic (+112/‑35) | unknown → / → unknown | Electron transport complex protein RnfE/Endonuclease III (EC 4.2.99.18) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,226,189 | 0 | G | A | 100.0% | 139.3 / NA | 49 | intergenic (+112/‑35) | unknown/unknown | Electron transport complex protein RnfE/Endonuclease III (EC 4.2.99.18) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (25/24); total (25/24) | |||||||||||
CGATTGGGCTAAATTCATGCGGATTGAATTTTTCCACAATGACAGTAATCTGTTACTTGCGATTTTGCCTCCCGGCGCATTTATTGGTTTAGCTTTGTTGTTAGCCTTAAAAAATGTAATAGATACAAAAAAGTAGTTTAAAAGAAATAATGCTCAGATAATTTATCCTCATATAATTTGTCTGAGCGACTTTGAATTCTTAGGAAAATTCTAACCAAGCTCAGATAAGCAAATTAGCTTGGTGTGTGTTTTTTGCACAAGCAAAAAAGTAAAAGGAAGTTTATGAATAAAGAAAAAAGAATTGAAATCCTAAAACGCCTACGCGCTGCTAATCCGCACCCAACGACGGAACTGAATTTCAGTTCCCCTTTTGAATTGTTAATTGCGGTGATTCTATCGGCACAAGCCACCGACAAAGGCGTGAACAAGGCGACGGACAAACTGTTTCCCGTCGCCAATACCCCACAAACGATTTTGGCGTTAGGTGTGGAT > 1/1225942‑1226433 | cGATTGGGCTAAATTCATGCGGATTGAATTTTTCCACAATGACAGTAATCTGTTACTTGCGATTTTGCCTCCCGGCGCATTTATTGGTTTAGCTTTGTTGTTAGCCTTAAAAAATGTAATAGATACAAAAAAGTAGTTTAAAAGAAATAATGCTCAGATAATTTATCCTCATATAATTTGTCTGAGCGACTTTGAATTCTTAGGAAAATTCTAACCAAGCTCAGATAAGCAAATTAGCTTGGTGTGTAttt < 1:643316/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |