| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,224,448 | T→G | S286A (TCC→GCC) | unknown → | Electron transport complex protein RnfD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,224,448 | 0 | T | G | 100.0% | 276.1 / NA | 95 | S286A (TCC→GCC) | unknown | Electron transport complex protein RnfD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (46/49); total (46/49) | |||||||||||
CGATGTGGCATTTTACGATTTGGTGAAATTACCAATTTTTACGCAAAATGGCTGGGACCTTGCGCAAGGGTGGTGGCAAATTAACGTGGCGTTTCTTATCGGTGGTGTATTCTTAATTCTAAAAAAAATCATTCACTGGCAAATCCCTACAGCCATGTTAGGCAGTTTTGCGTTGTTAGATTTACTGACCGAATTATTCGGCAACGGCGCGCAATTAAGCTTACCGGCGCAGTTAATGAGCGGCTCCATGATGTTCGGCGCATTCTTTATCGCCACCGATCCGGTCACAGCTTCCATCACGCCGCGCGGCAAATTGGTGTTCGGTGCGTTGGTAGGAAGCTTGTTGTATTTAATCCGTTTTTATGGCAACTATCCTGACGGTGTCGCCTTCGCGATTTTACTCAGCAACATTTGCGTGCCGTTAATTGATCACTATACCCGCCCGCGGGTTGCCGGTCATCGGAGGTAAGAGAGTATGCAAACCATTAAAG > 1/1224204‑1224694 | cGATGTGGCATTTTACGATTTGGTGAAATTACCAATTTTTACGCAAAATGGCTGGGACCTTGCGCAAGGGTGGTGGCAAATTAACGTGGCGTTTCTTATCGGTGGTGTATTCTTAATTCTAAAAAAAATCATTCACTGGCAAATCCCTACAGCCATGTTAGGCAGTTTTGCGTTGTTAGATTTACTGACCGAATTATTCGGCAACGGCGCGCAATTAAGCTTACCGGCGCAGTTAATGAGCGGCGCCatga < 1:674866/251‑1 (MQ=255)cGATGTGGCATTTTACGATTTGGTGAAATTACCAATTTTTACGCAAAATGGCTGGGACCTTGCGCAAGGGTGGTGGCAAATTAACGTGGCGTTTCTTATCGGTGGTGTATTCTTAATTCTAAAAAAAATCATTCACTGGCAAATCCCTACAGCCATGTTAGGCAGTTTTGCGTTGTTAGATTTACTGACCGAATTATTCGGCAACGGCGCGCAATTAAGCTTACCGGCGCAGTTAATGAGCGGCGCCatga < 1:8027/251‑1 (MQ=255) tgGCATTTTACGATTTGGTGAAATTACCAATTTTTACGCAAAATGGCTGGGACCTTGCGCAAGGGTGGTGGCAAATTAACGTGGCGTTTCTTATCGGTGGTGTATTCTTAATTCTAAAAAAAATCATTCACTGGCAAATCCCTACAGCCATGTTAGGCAGTTTTGCGTTGTTAGATTTACTGACCGAATTATTCGGCAACGGCGCGCAATTAAGCTTACCGGCGCAGTTAATGAGCGGCGCCATGATGTTc < 1:13842/251‑1 (MQ=255) gCATTTTACGATTTGGTGAAATTACCAATTTTTACGCAAAATGGCTGGGACCTTGCGCAAGGGTGGTGGCAAATTAACGTGGCGTTTCTTATCGGTGGTGTATTCTTAATTCTAAAAAAAATCATTCACTGGCAAATCCCTACAGCCATGTTAGGCAGTTTTGCGTTGTTAGATTTACTGACCGAATTATTCGGCAACGGCGCGCAATTAAGCTTACCGGCGCAGTTAATGAGCGGCGCCATGATGTTCgg > 1:675934/1‑251 (MQ=255) 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ttattCGGCAACGGCGCGCAATTAAGCTTACCGGCGCAGTTAATGAGCGGCGCCATGATGTTCGGCGCATTCTTTATCGCCACCGATCCGGTCACAGCTTCCATCACGCCGCGCGGCAAATTGGTGTTCGGTGCGTTGGTAGGAAGCTTGTTGTATTTAATCCGTTTTTATGGCAACTATCCTGACGGTGTCGCCTTCGCGATTTTACTCAGCAACATTTGCGTGCCGTTAATTGATCACTATAcccgcc > 1:510369/1‑250 (MQ=255) ttattCGGCAACGGCGCGCAATTAAGCTTACCGGCGCAGTTAATGAGCGGCGCCATGATGTTCGGCGCATTCTTTATCGCCACCGATCCGGTCACAGCTTCCATCACGCCGCGCGGCAAATTGGTGTTCGGTGCGTTGGTAGGAAGCTTGTTGTATTTAATCCGTTTTTATGGCAACTATCCTGACGGTGTCGCCTTCGCGATTTTACTCAGCAACATTTGCGTGCCGTTAATTGATCACTATAcc > 1:323254/1‑246 (MQ=255) attCGGCAACGGCGCGCAATTAAGCTTACCGGCGCAGTTAATGAGCGGCGCCATGATGTTCGGCGCATTCTTTATCGCCACCGATCCGGTCACAGCTTCCATCACGCCGCGCGGCAAATTGGTGTTCGGTGCGTTGGTAGGAAGCTTGTTGTATTTAATCCGTTTTTATGGCAACTATCCTGACGGTGTCGCCTTCGCGATTTTACTc > 1:352737/1‑208 (MQ=255) 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CGATGTGGCATTTTACGATTTGGTGAAATTACCAATTTTTACGCAAAATGGCTGGGACCTTGCGCAAGGGTGGTGGCAAATTAACGTGGCGTTTCTTATCGGTGGTGTATTCTTAATTCTAAAAAAAATCATTCACTGGCAAATCCCTACAGCCATGTTAGGCAGTTTTGCGTTGTTAGATTTACTGACCGAATTATTCGGCAACGGCGCGCAATTAAGCTTACCGGCGCAGTTAATGAGCGGCTCCATGATGTTCGGCGCATTCTTTATCGCCACCGATCCGGTCACAGCTTCCATCACGCCGCGCGGCAAATTGGTGTTCGGTGCGTTGGTAGGAAGCTTGTTGTATTTAATCCGTTTTTATGGCAACTATCCTGACGGTGTCGCCTTCGCGATTTTACTCAGCAACATTTGCGTGCCGTTAATTGATCACTATACCCGCCCGCGGGTTGCCGGTCATCGGAGGTAAGAGAGTATGCAAACCATTAAAG > 1/1224204‑1224694 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |