Predicted mutation
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RA	1	1,195,052	T→C	intergenic (+371/+206)	unknown → / ← unknown	[NiFe] hydrogenase metallocenter assembly protein HypE/hypothetical protein

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*	1	1,195,052	0	T	C	100.0%	97.3 / NA	34	intergenic (+371/+206)	unknown/unknown	[NiFe] hydrogenase metallocenter assembly protein HypE/hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (10/24);  total (10/24)

TAGAAAAAAAGCGGCTAAATTTAAAAATGTGCAATTTAACCACTTAATTTAAGAAATTTAAAGAAAGGCTTTAAAAAGTGTTTAAAAATCGTTTAAAGCCCGTTTAAATAAGGTTTTTCCCGATGTGTACGACTTGCCCGATGATTTGCAGGTTTTCCGCCTCTTGTTGGGTTAAATGGATCGGTGG‑‑‑‑GCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAAGCCATCCCAGTTGATTTTAACGCGTTTAACCCATACGCTGGCGCCATTTTGCACTAAGTAAATCTTATCGCCTTTAATCTCTTTCTTTAATAAATCTATTAAAGGCTAATGCTG  >  1/1194812‑1195141                                                                                                                                                                                                                                                     |                                                                                          aaagttagttttagaaaaaaagtggctaaaatctaaaaagggcggttttagccacttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAAcc                                                                                     <  1:131576‑M2/60‑1 (MQ=255) aaagttagttttagaaaaaaagtggctaaaatctaaaaagggcggttttagccacttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAAcc                                                                                     <  1:869468‑M2/60‑1 (MQ=255) 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                                                      cttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggttgttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCATacgctggcgccgttctgtac                                                              <  1:542837‑M2/83‑10 (MQ=255)                                                         taattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGcttaacccatacgctggcgccgttctgtaccaaatagatt                                                    >  1:355366‑M2/136‑209 (MQ=255)                                                              gtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCa                                                                                   >  1:64992‑M2/131‑192 (MQ=255)                                                                                    aaaaaaCGTTTAAAGCCCGTTTAAATAAGGTTTTTCCCGATGTGCACGACTTGCCCGATGATTTGCAGGTTTTCGGCTTCAGCTTGGGTTAGTTGGATTGGTGGATATTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCATACGCTGGCGCCGTTCTGTACCAAATAGATTTTATCGCCTTTAATCTCTTTCTTTGATAAATccactaatatctgatcgcc  <  1:410584/251‑19 (MQ=255)                                                                                                           aaTAAGGTTTTTCCCGATGTGCACGACTTGCCCGATGATTTGCAGGTTTTCGGCTTCAGCTTGGGTTAGTTGGATTGGTGGATATTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCATACGCTGGCGCCGTTCTGTACCAAATAGATTTTATCGCCTTTAAtc                                     <  1:755770/193‑1 (MQ=255)                                                                                                                             gtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCATACGCTGgcgc                                                                        >  1:437355‑M2/68‑140 (MQ=255) 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                                                                                                                            gtgcaCGACTTGCCCGATGATTTGCAGGTTTTCGGCTTCAGCTTGGGTTAGTTGGATTGGTGGATATTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCATACGCTGGCGCCGTTCTGTACCAAATAGATTTTATCGCCTTTAATCTCTTTCTTTGATAAATccactaatatctga       >  1:597917/5‑192 (MQ=255)                                                                                                                                  cgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtgggtatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCATACGCTggcgccgttc                                                                   >  1:313664‑M2/63‑136 (MQ=255) 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                                                                                                                                                                                                                                                    |                                                                                          TAGAAAAAAAGCGGCTAAATTTAAAAATGTGCAATTTAACCACTTAATTTAAGAAATTTAAAGAAAGGCTTTAAAAAGTGTTTAAAAATCGTTTAAAGCCCGTTTAAATAAGGTTTTTCCCGATGTGTACGACTTGCCCGATGATTTGCAGGTTTTCCGCCTCTTGTTGGGTTAAATGGATCGGTGG‑‑‑‑GCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAAGCCATCCCAGTTGATTTTAACGCGTTTAACCCATACGCTGGCGCCATTTTGCACTAAGTAAATCTTATCGCCTTTAATCTCTTTCTTTAATAAATCTATTAAAGGCTAATGCTG  >  1/1194812‑1195141

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑