| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,164,208 | T→G | V197G (GTC→GGC) | unknown → | Ribosomal protein S6‑‑L‑glutamate ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,164,208 | 0 | T | G | 100.0% | 279.3 / NA | 95 | V197G (GTC→GGC) | unknown | Ribosomal protein S6‑‑L‑glutamate ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (47/48); total (47/48) | |||||||||||
GTGTTGCGGTGCCGGATTCTTTGCTCGCCGGCATTGAAGTCAATGCTAATCATGCGGTGCAACACATCGGCGCGCCAACCATTTTGAAAACCTTGAGCGGTTCTCAGGGCATCGGCGTGATTCTGGCGGAGCGAACAAAAAGTGCGGTCAGTATTTTGGAAACTTTAAAACAAGCGGACGTGCCGGTGTTGTTGCAGGAATTTGTGGCAGAAGCCGACGGCACGGATGTACGCTGTTTTGTGATTGTCGGACGGGTGGTTGCCGCCATGCAACGGGTCGGGCAAAACGGTGAATTTCGCGCCAATTGTCATCGTGGCGCGACAGCAGAAAAAGTGGTGTTGACCGAACAGGAAAAGCAAATCGCCTTGCGTGCGACCAACGCGCTCGGCTTAGATGTTGCCGGTGTGGATTTGATTCGCTCGGCGAAAGGCCCGTTGGTGTTGGAAGTGAATGCCAGCCCGGGGCTTGAAATGATTGAGAAAAC > 1/1163962‑1164445 | gtgtTGCGGTGCCGGATTCTTTGCTCGCCGGCATTGAAGTCAATGCTAATCATGCGGTGCAACACATCGGCGCGCCAACCATTTTGAAAACCTTGAGCGGTTCTCAGGGCATCGGCGTGATTCTGGCGGAGCGAACAAAAAGTGCGGTCAGTATTTTGGAAACTTTAAAACAAGCGGACGTGCCGGTGTTGTTGCAGGAATTTGTGGCAGAAGCCGACGGCACGGATGTACGCTGTTTTGTGATTGGCGGa > 1:638944/1‑251 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |