| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,127,540 | G→A | G155S (GGC→AGC) | unknown → | Maltoporin (maltose/maltodextrin high‑affinity receptor, phage lambda receptor protein) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,127,540 | 0 | G | A | 100.0% | 248.0 / NA | 86 | G155S (GGC→AGC) | unknown | Maltoporin (maltose/maltodextrin high‑affinity receptor, phage lambda receptor protein) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (43/43); total (43/43) | |||||||||||
AAGGCAACAAACGCTTCTATTTCGACAGCTTAATTGCCTATGGTGGTAATTTGCATAAAGGCGACTGGACCGAAACCAGCCCGGCAGTGCGTGAATTAAATGTGAAATTTGAAAACTTCGCTGACAGCTTACCGGGCGCCAC‑ATTATGGGCAGGTAAACGTTTCTACCAACGTCATGACGTACACATGAACGACTTCTACTACTGGGATATTTCCGGTCCGGGTGCGGGGGTTGAAGGCATTGATTTGGGTTTTGGTAAATTATCTCTTGCGGTAACCCGTAATACAGAAGCAGGCGGTGCATTTAGCTACTACTATGATCGCGCAAATAAAAGATGGGATACTACCCGTAAAGTACAAAAAGATGTTTACAACGATGTATTCGATGTTCGTTTAGCTGAAGTTCAAGTTAGCGAAAACGGTAAATTAGAATTCGGTTTTGATTACGCCCGATCTCATAAAAAAGACGATGCCCGCTATG > 1/1127304‑1127783 | aagGCAACAAACGCTTCTATTTCGACAGCTTAATTGCCTATGGTGGTAATTTGCATAAAGGCGACTGGACCGAAACCAGCCCGGCAGTGCGTGAATTAAATGTGAAATTTGAAAACTTCGCTGACAGCTTACCGGGCGCCAC‑ATTATGGGCAGGTAAACGTTTCTACCAACGTCATGACGTACACATGAACGACTTCTACTACTGGGATATTTCCGGTCCGGGTGCGGGGGTTGAAAGCATTGATTTggg < 1:627039/250‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) aCGTACACATGAACGACTTCTACTACTGGGATATTTCCGGTCCGGGTGCGGGGGTTGAAAGCATTGATTTGGGTTTTGGTAAATTATCTCTTGCGGTAACCCGTAATACAGAAGCAGGCGGTGCATTTAGCTACTACTATGATCGCGCAAATAAAAGATGGGATACTACCCATAAAGTACAAAAAGATGTTTACAACGATGTATTCGATGTTCGTTTAGCTGAAGTTCAAGTTAGCGAAAACGGTAAATTa > 1:568572/1‑251 (MQ=255) cGTACACATGAACGACTTCTACTACTGGGATATTTCCGGTCCGGGTGCGGGGGTTGAAAGCATTGATTTGGGTTTTGGTAAATTATCTCTTGCGGTAACCCGTAATACAGAAGCAGGCGGTGCATTTAGCTACTACTATGATCGCGCAAATAAAAGATGGGATACTACCCATAAAGTACAAAAAGATGTTTACAACGATGTATTCGATGTTCGTTTAGCTGAAGTTCAAGTTAGCGAAAACGGTAAATTAg < 1:131473/251‑1 (MQ=255) cGTACACATGAACGACTTCTACTACTGGGATATTTCCGGTCCGGGTGCGGGGGTTGAAAGCATTGATTTGGGTTTTGGTAAATTATCTCTTGCGGTAACCCGTAATACAGAAGCAGGCGGTGCATTTAGCTACTACTATGATCGCGCAAATAAAAGATGGGATACTACCCATAAAGTACAAAAAGATGTTTACAACGATGTATTCGATGTTCGTTTAGCTGAAGTTCAAGTTAGCGAAAACGGTAAATTAg < 1:524010/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |