| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,124,600 | C→T | G276D (GGT→GAT) | unknown ← | Maltodextrin ABC transporter, substrate‑binding protein MdxE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,124,600 | 0 | C | T | 100.0% | 262.3 / NA | 87 | G276D (GGT→GAT) | unknown | Maltodextrin ABC transporter, substrate‑binding protein MdxE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (43/44); total (43/44) | |||||||||||
ATATTCGGCATGATTTCACCGTTTTTCGCATTTTCCATGGTGGCGGCGATACGCGGATCTTTCGCTAATTTTTCTTGGTAGGATTTCAATGCCACAGCGCCTAGTGGTTTGTCTTTATTGACGGTTTCCAAACCGTCATCGGTCAACAGGTAGTTTTCCATGAATTCCACCGCGAGATCTTTGTTCGGGCTGGCGGAGTTAATACCGGCACTTAACACGCCGACGAACGGTTTGGCATTGTGACCGTTTAAGGTCGGCAACACGGCAACGCCGTAATTGATTTTGCTTTTCTCAATGTTGCCCCAAGACCAAGGACCATTAATGGTTAACGCCGCATCGCCTTTGTTAAATGCCGCTTCCGCGATGGCATAGTCCATATCGGCGCTGATGACTTTATTTTTCACCATATTCACCACGAATTGCAGGGCTTTTTGTGAACCTTCGTTGTTTACGCCGATGTCGTTAATGTCATATTTGCCGTTGACAAA > 1/1124357‑1124844 | atatTCGGCATGATTTCACCGTTTTTCGCATTTTCCATGGTGGCGGCGATACGCGGATCTTTCGCTAATTTTTCTTGGTAGGATTTCAATGCCACAGCGCCTAGTGGTTTGTCTTTATTGACGGTTTCCAAACCGTCATCGGTCAACAGGTAGTTTTCCATGAATTCCACCGCGAGATCTTTGTTCGGGCTGGCGGAGTTAATACCGGCACTTAACACGCCGACGAACGGTTTGGCATTGTGATCGTTTaa > 1:164852/1‑251 (MQ=255) 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ATATTCGGCATGATTTCACCGTTTTTCGCATTTTCCATGGTGGCGGCGATACGCGGATCTTTCGCTAATTTTTCTTGGTAGGATTTCAATGCCACAGCGCCTAGTGGTTTGTCTTTATTGACGGTTTCCAAACCGTCATCGGTCAACAGGTAGTTTTCCATGAATTCCACCGCGAGATCTTTGTTCGGGCTGGCGGAGTTAATACCGGCACTTAACACGCCGACGAACGGTTTGGCATTGTGACCGTTTAAGGTCGGCAACACGGCAACGCCGTAATTGATTTTGCTTTTCTCAATGTTGCCCCAAGACCAAGGACCATTAATGGTTAACGCCGCATCGCCTTTGTTAAATGCCGCTTCCGCGATGGCATAGTCCATATCGGCGCTGATGACTTTATTTTTCACCATATTCACCACGAATTGCAGGGCTTTTTGTGAACCTTCGTTGTTTACGCCGATGTCGTTAATGTCATATTTGCCGTTGACAAA > 1/1124357‑1124844 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |