| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,114,297 | T→C | E249G (GAA→GGA) | unknown ← | Type I restriction‑modification system, restriction subunit R (EC 3.1.21.3) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,114,297 | 0 | T | C | 100.0% | 314.3 / NA | 102 | E249G (GAA→GGA) | unknown | Type I restriction‑modification system, restriction subunit R (EC 3.1.21.3) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (52/50); total (52/50) | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
CTCAAAGACTACATCATCCCAATCAATGGTTGATTTGCCTTTTTCTTCGCCATCTTTTTGCCGGCGAAGCCAATCACGAATGTCATTATAAGTAGATCGATAATTTTGAATAGCGCGTTCGCTTGGTATATCAATTTTTTGTATTTCAGCAAGGGCTTCATCGCTAAGATAATACTTTTCTTTAAATGCTTGTATTGCTTGTTCATCAGTTTTATCAACGGATTGAAATGCCTGCAAAGCGGAAAATTCATCATAATTTTGCAGGATATTTTCAACGCGTAAATATTCACCGAATAATTTAACAAAGGCTTTTTTGCCTTTTTCCGTTTCAATTTCAGTTGGATCAGGAAAACGATCGCTGAGTTCGGTAATGACGTCTAAATAGCCGCGGCGATCGATGCCTGCATCGGTATAGCCTTCCATATATTCTTGATAGCTTTTTTCCAGTACTACGTTACGCGTATTGGCGTTGCCAAAAAGCGTAATGG > 1/1114050‑1114537 | cTCAAAGACTACATCATCCCAATCAATGGTTGATTTGCCTTTTTCTTCGCCATCTTTTTGCCGGCGAAGCCAATCACGAATGTCATTATAAGTAGATAGATAATTTTGAATAGCGCGTTCGCTTGGTATATCAATTTTTTGTATTTCAGCAAGGGCTTCATCGCTAAGATAATACTTTTCTTTAAATGCTTGTATTGCTTGTTCATCAGTTTTATCAACGGATTGAAATGCCTGCAAAGCGGAAAATccat > 1:769540/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |