| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,078,849 | C→T | K353K (AAG→AAA) | unknown ← | Spermidine synthase long (EC 2.5.1.16) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,078,849 | 0 | C | T | 100.0% | 92.2 / NA | 33 | K353K (AAG→AAA) | unknown | Spermidine synthase long (EC 2.5.1.16) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (22/11); total (22/11) | |||||||||||
GTGACATATTCATATATTGATAAACATGAGGGAAAACTTCTTTTGAGGTGTAGTATGCATCATATGATTCCGTTGTGTTGAAATAGATAAAACCATTTTCATTTAAATGCGATTTTGTTAATTCTAAAAACTCTTTACTAAGTAAATTAGATGCATAATTTCTCCAATGGAATGTGGTATTCATTAGAATAAAGTCAAATTTCTTCTCAGGATTACGGTTTAACCAACGGCGACCATCATCAGTGATGAGATTGACCCGCTTGTCCTGCAGAAATTTGCCCATTTCAGAGTACATTCCGGCTAGCTGAGGATAGCCCGGATTTAATTCAATAACAGTCATTGATTCCAATTCGGGCATTGATGTTAAAACTCTTGTCCAAGAGGCTGTACTTAAACCGATAACAAGAATGTTTTTCGCATGAGGTGCAATAACCGGTAATAAAT > 1/1078647‑1079090 | gTGACATATTCATATATTGATAAACATGAGGGAAAACTTCTTTTGAGGTGTAGTATGCATCATATGATTCCGTTGTGTTGAAATAGATAAAACCATTTTCATTTAAATGCGATTTTGTTAATTCTAAAAACTCTTTACTAAGTAAATTAGATGCATAATTTCTCCAATGGAATGTGGTATTCATTAGAATAAAGTCAAATTTTTTCTCAGGATTACgg > 1:374353/1‑218 (MQ=255) tGACATATTCATATATTGATAAACATGAGGGAAAACTTCTTTTGAGGTGTAGTATGCATCATATGATTCCGTTGTGTTGAAATAGATAAAACCATTTTCATTTAAATGCGATTTTGTTAATTCTAAAAACTCTTTACTAAGTAAATTAGATGCATAATTTCTCCAATGGAATGTGGTATTCATTAGAATAAAGTCAAATTTTTTCTCAGGATTACGGTTTAACCAACGGCGACCATCATCAGTGATgaga < 1:593810/250‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) atatGATTCCGTTGTGTTGAAATAGATAAAACCATTTTCATTTAAATGCGATTTTGTTAATTCTAAAAACTCTTTACTAAGTAAATTAGATGCATAATTTCTCCAATGGAATGTGGTATTCATTAGAATAAAGTCAAATTTTTTCTCAGGATTACGGTTTAACCAACGGCGACCATCATCAGTGATGAGATTGACCCGCTTGTCCTGCAGAAATTTGCCCATTTCAGAGTACATTCCGGCTAGCTGAGGAt > 1:364501/1‑251 (MQ=255) aGATAAAACCATTTTCATTTAAATGCGATTTTGTTAATTCTAAAAACTCTTTACTAAGTAAATTAGATGCATAATTTCTCCAATGGAATGTGGTATTCATTAGAATAAAGTCAAATTTTTTCTCAGGATTACGGTTTAACCAACGGCGACCATCATCAGTGATGAGATTGACCCGCt < 1:230579/177‑1 (MQ=255) tAAAACCATTTTCATTTAAATGCGATTTTGTTAATTCTAAAAACTCTTTACTAAGTAAATTAGATGCATAATTTCTCCAATGGAATGTGGTATTCATTAGAATAAAGTCAAATTTTTTCTCAGGATTACGGTTTAACCAACGGCGACCATCATCAGTGATGAGATTGACCCGCTTGTCCTGCAGAAATTTGCCCATTTCAGAGTACATTCCGGCTAGCTGAGGATAGCCCGGATTTAATTCAATAACAGTc < 1:85988/251‑1 (MQ=255) 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1:111905/73‑1 (MQ=255) aTTCATTAGAATAAAGTCAAATTTTTTCTCAGGATTACGGTTTAACCAACGGCGACCATCATCAGTGATGAGATTGACCCGCTTGTCCTGCAGAAATTTGCCCATTTCAGAGTACATTCCGGCTAGCTGAGGATAGCCCGGATTTAATTCAATAACAGTCATTGATTCCAATTCGGGCATTGATGTTAAAACTCTTGTCCAAGAGGCTGTACTTAAACCGATAACAAGAATGTTTTTCGCATGAGGTGCaa > 1:20262/1‑251 (MQ=255) ttCATTAGAATAAAGTCAAATTTTTTCTCAGGATTACGGTTTAACCAACGGCGACCATCATCAGTGATGAGATTGACCCGCTTGTCCTGCAGAAATTTGCCCATTTCAGAGTACATTCCGGCTAGCTGAGGATAGCCCGGATTTAATTCAATAACAGTCATTGATTCCAATTCGGGCATTGATGTTAAAACTCTTGTCCAAGAGGCTGTACTTAAACCGATAACAAGAATGTTTTTCGCATGAGGTGCAAt < 1:128922/251‑1 (MQ=255) cATTAGAATAAAGTCAAATTTTTTCTCAGGATTACGGTTTAACCAACGGCGACCATCATCAGTGATGAGATTGACCCGCTTGTCCTGCAGAAATTTGCCCATTTCAGAGTACATTCCGGCTAGCTGAGGATAGCCCGGATTTAATTCAATAACAGTCATTGATTCCAATTCGGGCATTGATGTTAAAACTCTTGTCCAAGAGGCTGTACTTAAACCGATAACAAGAATGTTTTTCGCATGAGGTGCAATaa > 1:48246/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |