| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,037,700 | G→A | A510V (GCG→GTG) | unknown ← | Arginyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.19) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,037,700 | 0 | G | A | 100.0% | 217.8 / NA | 77 | A510V (GCG→GTG) | unknown | Arginyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.19) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (46/31); total (46/31) | |||||||||||
CTGAACGAACGGGATCTTTTTGAATTGGATGAAACTACATTCTCTCGACGGTTTTAATGCCCAGTAAATCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCGCGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAGCATATTGTCCCAATCAAACACATAATCGGTGATACGGTTTTTGGATAAATCTGCGTATTTTAC > 1/1037461‑1037944 | cTGAACGAACGGGATCTTTTTGAATTGGATGAAACTACATTCTCTCGACGGTTTTAATGCCCAGTAAATCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAAt < 1:859575/250‑1 (MQ=255) gaacgaacGGGATCTTTTTGAATTGGATGAAACTACATTCTCTCGACGGTTTTAATGCCCAGTAAATCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATgg > 1:30915/1‑250 (MQ=255) aaaCTACATTCTCTCGACGGTTTTAATGCCCAGTAAATCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCa > 1:604714/1‑251 (MQ=255) aaaCTACATTCTCTCGACGGTTTTAATGCCCAGTAAATCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCa > 1:151953/1‑251 (MQ=255) aCTACATTCTCTCGACGGTTTTAATGCCCAGTAAATCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCaa > 1:188066/1‑250 (MQ=255) gTTTTAATGCCCAGTAAATCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTc > 1:48123/1‑248 (MQ=255) tGCCCAGTAAATCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAg < 1:213449/251‑1 (MQ=255) cAGTAAATCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTa > 1:413453/1‑251 (MQ=255) cAGTAAATCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTa > 1:283146/1‑251 (MQ=255) cAGTAAATCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTa > 1:475664/1‑251 (MQ=255) cAGTAAATCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTa > 1:440534/1‑251 (MQ=255) gTAAATCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAAt > 1:129937/1‑251 (MQ=255) tAAATCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATg < 1:142661/251‑1 (MQ=255) aaaTCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATgg < 1:42441/251‑1 (MQ=255) aTCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAAt > 1:404719/1‑183 (MQ=255) aTCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGgcg > 1:688000/1‑251 (MQ=255) tCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGtt > 1:854427/1‑251 (MQ=255) tGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTAc < 1:475145/251‑1 (MQ=255) gTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTAc > 1:868948/1‑250 (MQ=255) gTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTAc > 1:731985/1‑250 (MQ=255) ttttAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTAcc < 1:184186/250‑1 (MQ=255) tttctGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCgggg > 1:560018/1‑248 (MQ=255) ctGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGAtt < 1:558318/251‑1 (MQ=255) ctGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGAtt > 1:115115/1‑251 (MQ=255) gTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTg > 1:22086/1‑251 (MQ=255) tttAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGAt < 1:852346/251‑1 (MQ=255) tttAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGAt < 1:146811/251‑1 (MQ=255) tttAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGAt < 1:267754/251‑1 (MQ=255) cGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGTGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACg < 1:413902/251‑1 (MQ=255) cGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATgg < 1:244471/200‑1 (MQ=255) gAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATgg > 1:545805/1‑131 (MQ=255) gAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTg > 1:352485/1‑144 (MQ=255) gTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGa > 1:569536/1‑251 (MQ=255) ttttACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAg < 1:847386/251‑1 (MQ=255) tttCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGc < 1:666557/250‑1 (MQ=255) cTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGc < 1:331668/251‑1 (MQ=255) tCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCat > 1:586346/1‑251 (MQ=255) tCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCat > 1:515580/1‑251 (MQ=255) aTTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGc < 1:155045/194‑1 (MQ=255) aTTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGt > 1:244111/1‑209 (MQ=255) aTTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCg < 1:887471/238‑1 (MQ=255) gaATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGAt < 1:563002/211‑1 (MQ=255) gaATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAAc > 1:329100/1‑216 (MQ=255) aTCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGt < 1:378144/158‑1 (MQ=255) aTCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAgt > 1:593227/1‑251 (MQ=255) tGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATgg < 1:764619/155‑1 (MQ=255) cTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCaa > 1:688229/1‑251 (MQ=255) gTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAg > 1:621792/1‑250 (MQ=255) aaagaaGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAg > 1:745392/1‑251 (MQ=255) gaagaGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCt > 1:788566/1‑157 (MQ=255) gaagaGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAGCat > 1:463688/1‑251 (MQ=255) gaagaGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAGCat > 1:452803/1‑251 (MQ=255) aagaGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTGCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAGCat < 1:437613/250‑1 (MQ=255) gagaACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAGCATAtt > 1:783274/1‑251 (MQ=255) cGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAgg > 1:113456/1‑214 (MQ=255) ccAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAGCATATTGTCCCAATCAAac < 1:134760/251‑1 (MQ=255) aaTTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAGCATATTGTCCCAATCAAacac < 1:467736/251‑1 (MQ=255) aaTTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAGCATATTGTCCCAATCAAacac < 1:102551/251‑1 (MQ=255) cATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTAcc < 1:88882/134‑1 (MQ=255) cATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAGCATATTGTcc > 1:777610/1‑236 (MQ=255) atatAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAg > 1:438083/1‑179 (MQ=255) tataAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAGCat > 1:335198/1‑227 (MQ=255) taAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAGCATATTGTCCCAATCAAACACATAATCgg < 1:567612/251‑1 (MQ=255) ggCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAGCATATTGTcc > 1:218175/1‑226 (MQ=255) ggCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAGCATATTGTCCCAATCAAACACATAATCGGTGATa > 1:348497/1‑250 (MQ=255) ggCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGAATGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAGCatat > 1:513846/1‑221 (MQ=255) gCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGcc < 1:283726/203‑1 (MQ=255) cacaAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAGCATATTGTCCCAATCAAACACATAATCGGTGATACgg > 1:457969/1‑251 (MQ=255) caAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCg > 1:138988/1‑174 (MQ=255) gAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAGCATATTGTCCCAATCAAACACATAATCGGTGAt > 1:713633/1‑241 (MQ=255) tgtgtgGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAGCATATTGTCCCAATCAAACACATAATCGGTGATACGGTTTTTGGAt < 1:260184/251‑1 (MQ=255) tgtgtgGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAGCATATTGTCCCAATCAAACACATAATCGGTGATACGGTTTTTGGAt < 1:31414/251‑1 (MQ=255) gtgtgGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAGCATATTGTCCCAATCAAACACATAATCGGTGATACGGTTTTTGGATa > 1:381460/1‑251 (MQ=255) ggCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGAt > 1:618145/1‑140 (MQ=255) gCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAGCATATTGTCCCAATCAAACACATAATCGGTGATACGGTTTTTGGATAAATc < 1:574799/250‑1 (MQ=255) gTCTTTTGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCat > 1:840703/1‑162 (MQ=255) tttGCCACGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAGCATATTGTCCCAATCAAACACATAATCGGTGATACGGTTTTTGGATAAATCTGCGTATTTTac < 1:50578/251‑1 (MQ=255) | CTGAACGAACGGGATCTTTTTGAATTGGATGAAACTACATTCTCTCGACGGTTTTAATGCCCAGTAAATCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCGCGAGTTGAATGGCTTCTTCAAATTGCAGTAATTTGATTGCCAACGCGCGTTCTTTTTCATTCGTTAAGGTTAATGGCGCCTGTTTTACCTTTCCGGGGCTGATTTGGCTGCGGTTAAAGATAGAACGAATGCGAGTGTAAGCGTATTGCATATAAGGCGCAGTGTTGCCTTCAAAGCTTAGCATATTGTCCCAATCAAACACATAATCGGTGATACGGTTTTTGGATAAATCTGCGTATTTTAC > 1/1037461‑1037944 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |