| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,037,414 | G→T | intergenic (+279/+81) | unknown → / ← unknown | GTP‑binding protein/Arginyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.19) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,037,414 | 0 | G | T | 100.0% | 229.5 / NA | 79 | intergenic (+279/+81) | unknown/unknown | GTP‑binding protein/Arginyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.19) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (46/33); total (46/33) | |||||||||||
TAATTAAAGTGCGGTCATAAAAAATATTATTTTTTATGACCGCACTTTTCATTTGTAAAGCGAACTTTAGTTAAGGTAAATTTTTTGTAAAACAGTAGGTTATGTCACATTTATTCGCAATAATGGTTTGCCTTCCAGTCATTAATTGAGTATCCTTAGCCGCAACAAAAACAAGTGCTATATAAATAGCCAAACATATTTTGCTTTCCGAGTAGTGCCTCCTGTGAGGCACTTTTTTTATCCGATTTTTTCTCAATAACCTAGCAAGTTCCAAAATAAAAAATCCCGCGCTGAACGAACGGGATCTTTTTGAATTGGATGAAACTACATTCTCTCGACGGTTTTAATGCCCAGTAAATCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTC > 1/1037171‑1037656 | taattaaAGTGCGGTCATAAAAAATATTATTTTTTATGACCGCACTTTTCATTTGTAAAGCGAACTTTAGTTAAGGTAAATTTTTTGTAAAACAGTAGGTTATGTCACATTTATTCGCAATAATGGTTTGCCTTCCAGTCATTAATTGAGTATCCTTAGCCGCAACAAAAACAAGTGCTATATAAATAGCCAAACATATTTTGCTTTCCGAGTAGTGCCTCCTGTGAGGCACTTTTTTTATCCTAtttttt > 1:878353/1‑251 (MQ=255) 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ttttATCCTATTTTTTCTCAATAACCTAGCAAGTTCCAAAATAAAAAATCCCGCGCTGAACGAACGGGATCTTTTTGAATTGGATGAAACTACATTCTCTCGACGGTTTTAATGCCCAGTAAATCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTc < 1:800013/251‑1 (MQ=255) ttttATCCTATTTTTTCTCAATAACCTAGCAAGTTCCAAAATAAAAAATCCCGCGCTGAACGAACGGGATCTTTTTGAATTGGATGAAACTACATTCTCTCGACGGTTTTAATGCCCAGTAAATCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTc < 1:847190/251‑1 (MQ=255) aTCCTATTTTTTCTCAATAACCTAGCAAGTTCCAAAATAAAAAATCCCGCGCTGAACGAACGGGATCTTTTTGAATTGGATGAAACTACATTCTCTCGACgg < 1:585706/102‑1 (MQ=255) | TAATTAAAGTGCGGTCATAAAAAATATTATTTTTTATGACCGCACTTTTCATTTGTAAAGCGAACTTTAGTTAAGGTAAATTTTTTGTAAAACAGTAGGTTATGTCACATTTATTCGCAATAATGGTTTGCCTTCCAGTCATTAATTGAGTATCCTTAGCCGCAACAAAAACAAGTGCTATATAAATAGCCAAACATATTTTGCTTTCCGAGTAGTGCCTCCTGTGAGGCACTTTTTTTATCCGATTTTTTCTCAATAACCTAGCAAGTTCCAAAATAAAAAATCCCGCGCTGAACGAACGGGATCTTTTTGAATTGGATGAAACTACATTCTCTCGACGGTTTTAATGCCCAGTAAATCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTC > 1/1037171‑1037656 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |