| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,026,444 | C→T | L14L (CTG→TTG) | unknown → | Cytolethal distending toxin subunit C |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,026,444 | 0 | C | T | 100.0% | 161.9 / NA | 57 | L14L (CTG→TTG) | unknown | Cytolethal distending toxin subunit C |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (29/28); total (29/28) | |||||||||||
AAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCGGTCCGGTAATATTTTAGATTATGCGATTTTACATGACGCACATTTACCACGTCGAGAGCAAGCACGTGAACGTATCGGCGCAAGTTTAATGTTAAATCAGTTACGCTCACAAATTACATCCGATCATTTTCCTGTTAGTTTTGTTCATGATCGCTAAGGAGAATACTATGAAAAAATATTTATTGAGCTTCTTATTAAGCATGATACTGACTTTGACGAGTCATGCAGAATCAAATCCTGATCCGACTACTTATCCTGATGTAGAGTTATCGCCTCCTCCACGTATTAGCTTGCGTAGTTTGCTTACGGCTCAACCAATTAAAAATGACCATTATGATTCACATAATTATTTAAGTACACATTGGGAATTAATTGATTACAAGGGAAAAGAATATGAAAAATTACGTGACGGTGGTACGTTGGTTCAATTTAAAGTGGTCGGTGCAGCAA > 1/1026198‑1026687 | aaaaTACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCAGTCCGGTAATATTTTAGATTATGCGATTTTACATGACGCACATTTACCACGTCGAGAGCAAGTACGTGAACGTATCGGCGCAAGTTTAATGTTAAATCAGTTACGCTCACAAATTACATCCGATCATTTTCCTGTTAGTTTTGTTCATGATCGCTAAGGAGAATACTATGAAAAAATATTTATTGAGCTTCTTATTAAGCATGATATTGAc < 1:675577/251‑1 (MQ=255) 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AAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCGGTCCGGTAATATTTTAGATTATGCGATTTTACATGACGCACATTTACCACGTCGAGAGCAAGCACGTGAACGTATCGGCGCAAGTTTAATGTTAAATCAGTTACGCTCACAAATTACATCCGATCATTTTCCTGTTAGTTTTGTTCATGATCGCTAAGGAGAATACTATGAAAAAATATTTATTGAGCTTCTTATTAAGCATGATACTGACTTTGACGAGTCATGCAGAATCAAATCCTGATCCGACTACTTATCCTGATGTAGAGTTATCGCCTCCTCCACGTATTAGCTTGCGTAGTTTGCTTACGGCTCAACCAATTAAAAATGACCATTATGATTCACATAATTATTTAAGTACACATTGGGAATTAATTGATTACAAGGGAAAAGAATATGAAAAATTACGTGACGGTGGTACGTTGGTTCAATTTAAAGTGGTCGGTGCAGCAA > 1/1026198‑1026687 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |