| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,026,300 | C→T | A253V (GCA→GTA) | unknown → | Cytolethal distending toxin subunit B, DNase I‑like |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,026,300 | 0 | C | T | 100.0% | 171.6 / NA | 60 | A253V (GCA→GTA) | unknown | Cytolethal distending toxin subunit B, DNase I‑like |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (32/28); total (32/28) | |||||||||||
TATCTTCACTACTTTTACCTCATCACCATCATCACCGGAAAGACGAGGATATAGCTGGATGGTTGTTGGTGATTTCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAACTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCGGTCCGGTAATATTTTAGATTATGCGATTTTACATGACGCACATTTACCACGTCGAGAGCAAGCACGTGAACGTATCGGCGCAAGTTTAATGTTAAATCAGTTACGCTCACAAATTACATCCGATCATTTTCCTGTTAGTTTTGTTCATGATCGCTAAGGAGAATACTATGAAAAAATATTTATTGAGCTTCTTATTAAGCATGATACTGACTTTGACGAGTCATGCAGAATCAAATCCTGATCCGACTACTTATCCTGATGTAGAGTTATCGCCTCCTCCACGTATTAGCTTGCGTAGTTT > 1/1026067‑1026538 | tatCTTCCCTACTTTTACCTCATCACCATCATCACCGGAAAGACGAGGATATAGCTGGATGTTTGTTGGTGATTTCAAT‑CGTGCGCCGTTTAATCTGGAAGCTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCAGTCCGGTAATATTTTAGATTATGCGATTTTACATGACGCACATTTACCACGTCGAGAGCAAGTACGTGAACGTATCGgcg < 1:674245/251‑1 (MQ=255) actTTTACCTCATCACCATCATCACCGGAAAGACGAGGATATAGCTGGATGGTTGTTGGTGATTTCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAGCTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCAGTCCGGTAATATTTTAGATTATGCGATTTTACATGACGCACATTTACCACGTCGAGAGCAAGTACGTGAAc > 1:490870/1‑232 (MQ=255) actTTTACCTCATCACCATCATCACCGGAAAGACGAGGATATAGCTGGATGGTTGTTGGTGATTTCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAGCTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCAGTCCGGTAATATTTTAGATTATGCGATTTTACATGACGCACATTTACCACGTCGAGAGCAAGTACGTGAACGTATCGGCGCAAGTTTAAt > 1:638940/1‑251 (MQ=255) ctTTTACCTCATCCCAATCATCACCGGAAAGACGAGTATATAGCGGGATGGTTGTTGGTGA‑TTAAATGGGTGCGCGGTTTAATCTGGAAGCGGCATTAAGAGAGGACCCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCAGTCCGGTAATATTTTAGATTATGCGATTTTACATGACGCACATTTACCACGTCGAGAGCAAGTACGTGAACGTATCGGCGCAAGTTTAATg < 1:661379/251‑1 (MQ=255) ccTCATCACCATCATCACCGGAAAGACGAGGATATAGCTGGATGGTTGTTGGTGATTTCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAGCTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCAGTCCGGTAATATTTTAGATTATGCGATTTTACATGACGCACATTTACCACGTCGAGAGCAAGTACGTGAACGTATCGGCGCAAGTTTAATGTTAAAt > 1:8602/1‑251 (MQ=255) cTCATCCCCATCATCCCCGGAAAGACGAGGATATAGCTGGATGGTTGTTGGTGATTTCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCGGGAAGCTGCATTAAGACAGGACCCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCAGTCCGGTAATATTTTAGATTATGCGATTTTACATGACGCACATTTACCACGTCGAGAGCAAGTACGTGAACGTATCGGCGCAAGTTTAATGTTAAATc < 1:264554/251‑1 (MQ=255) catcaCCATCATCACCGGAAAGACGGGGATATAGCTGGATGGTTGTTGGTGTTTTCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAGCTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCAGTCCGGTAATATTTTAGATTATGCGATTTTACATGACGCACATTTACCACGTCGAGAGCAAGTACGTGAACGTATCgg < 1:291138/229‑1 (MQ=255) cTGGATGGTTGTTGGTGATTTCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAGCTGCATTAAGACAGGACCCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCAGTCCGGTAATATTTTAGATTATGCGATTTTACATGACGCACATTTACCACGTCGAGAGCAAGTACGTGAACGTATCGGCGCAAGTTTAATGTTAAATCAGTTACGCTCACAAATTACATCCGATCATTTTcc < 1:424554/249‑1 (MQ=255) cTGGATGGTTGTTGGTGATTTCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAGCTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCAGTCCGGTAATATTTTAGATTATGCGATTTTACATGACGCACATTTACCACGTCGAGAGCAAGTACGTGAACGTATCGGCGCAAGTTTAATGTTAAATCAGTTACGCTCACAAATTACATCCGATCATTTTc > 1:138165/1‑248 (MQ=255) gttgttGGTGATTTCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAGCTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCAGTCCGGTAATATTTTAGATTATGCGATTTTACATGACGCACATTTACCACGTCGAGAGCAAGTACGTGAACGTATCGGCGCAAGTTTAATGTTAAATCAGTTACGCTCACAAATTACATc > 1:557481/1‑230 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |