| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,026,167 | A→G | T209A (ACT→GCT) | unknown → | Cytolethal distending toxin subunit B, DNase I‑like |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,026,167 | 0 | A | G | 100.0% | 163.9 / NA | 59 | T209A (ACT→GCT) | unknown | Cytolethal distending toxin subunit B, DNase I‑like |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (33/26); total (33/26) | |||||||||||
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aGCTTTTATCGTACATTCTGATTCTTCTGTGCTTCAATCTCGCCCGGCAGTAGGTATCCGCATTGGTACTGATGTATTTTTTACAGTGCATGCTTTGGCCACAGGTGGTTCTGATGCGGTAAGTTTAATTCGTAA‑TATCTTCACTACTTTTACCTCATCACCATCATCACCGGAAAGACGAGGATATAGCTGGATGGTTGTTGGTGATTTCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAGCTGCATTAAGACAgg > 1:830632/1‑251 (MQ=255) ttATCGTACATTCTGATTCTTCTGTGCTTCAATCTCGCCCGGCAGTAGGTATCCGCATTGGTACTGATGTATTTTTTACAGTGCATGCTTTGGCCACAGGTGGTTCTGATGCGGTAAGTTTAATTCGTAA‑TATCTTCACTACTTTTACCTCATCACCATCATCACCGGAAAGACGAGGATATAGCTGGATGGTTGTTGGTGATTTCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAGCTGCATTAAGAc < 1:730083/243‑1 (MQ=255) gATTCTTCTGTGCTTCAATCTCGCCCGGCAGTAGGTATCCGCATTGGTACTGATGTATTTTTTACAGTGCATGCTTTGGCCACAGGTGGTTCTGATGCGGTAAGTTTAATTCGTAA‑TATCTTCACTACTTTTACCTCATCACCATCATCACCGGAAAGACGAGGATATAGCTGGATGGTTGTTGGTGATTTCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAGCTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGaaaa > 1:878263/1‑251 (MQ=255) tgtgCTTCAATCTCGCCCGGCAGTAGGTATCCGCATGGGTATTGATGTATTTTTTACAGTGCATGCTTTGGCCAAAGGTGGTTCTGATGCGGTAAGTTTAATTCGTAA‑TATCTTCACTACTTTTACCTCATCACCATCATCACCGGAAAGACGAGGATATAGCTGGATGGTTGTTGGTGATTTCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAGCTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGAAAATACAatta < 1:255103/251‑1 (MQ=255) gtgCTTCAATCTCGCCCGGCAGTAGGTATCCGCATTGGTACTGATGTATTTTTTACAGTGCATGCTTTGGCCACAGGTGGTTCTGATGCGGTAAGTTTAATTCGTAA‑TATCTTCACTACTTTTACCTCATCACCATCATCACCGGAAAGACGAGGATATAGCTGGATGGTTGTTGGTGATTTCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAGCTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGAAAATACAattat > 1:533365/1‑251 (MQ=255) gCAGTAGGTATCCGCATTGGTACTGATGTATTTTTTACAGTGCATGCTTTGGCCACAGGTGGTTCTGATGCGGTAAGTTTAATTCGTAA‑TATCTTCACTACTTTTACCTCATCACCATCATCACCGGAAAGACGAGGATATAGCTGGATGGTTGTTGGTGATTTCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAGCTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAAc > 1:421438/1‑250 (MQ=255) tAGGTATCCGCATTGGTACTGATGTATTTTTTACAGTGCATGCTTTGGCCACAGGTGGTTCTGATGCGGTAAGTTTAATTCGTAA‑TATCTTCACTACTTTTACCTCATCACCATCATCACCGGAAAGACGAGGATATAGCTGGATGGTTGTTGGTGATTTCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAGCTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACt < 1:306869/251‑1 (MQ=255) tacccGCATTGGTACTGATGTATTTTTTACAGTGCATGCTTTGCCCACAGGTGGTTCTGATGCGGTAAGTTTAATTCATAA‑TATCTTCACTTCTTTTACCTCATCCCCATCATCCCCGGAAAGGCGAGGATATAGCTGGATGGTTGTTGGTAATTACAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAGCTGCATAAAGACAGAACCCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATc < 1:104206/248‑1 (MQ=255) gATGTATTTTTTACAGTGCATGCTTTGGCCACAGGTGGTTCTGATGCGGTAAGTTTAATTCGTAA‑TATCTTCACTACTTTTACCTCATCACCATCATCACCGGAAAGACGAGGATATAGCTGGATGGTTGTTGGTGATTTCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAGCTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCAGTCCGGTAATAtttt > 1:60340/1‑251 (MQ=255) 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aTTTTTTACAGTGCATGCTTTGGCCACAGGTGGTTCTGATGCGGTAAGTTTAATTCGTAA‑TATCTTCACTACTTTTACCTCATCACCATCATCACCGGAAAGACGAGGATATAGCTGGATGGTTGTTGGTGATTTCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAGCTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCAGTCCGGTAATATTTTAGAt > 1:814146/1‑250 (MQ=255) aTTTTTTACAGTGCATGCTTTGGCCACAGGTGGTTCTGATGCGGTAAGTTTAATTCGTAA‑TATCTTCACTACTTTTACCTCATCACCATCATCACCGGAAAGACGAGGATATAGCTGGATGGTTGTTGGTGATTTCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAGCTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCAGTCCGGTAATATTTTAGAt > 1:187664/1‑250 (MQ=255) aTTTTTTACAGTGCATGCTTTGGCCACAGGTGGTTCTGATGCGGTAAGTTTAATTCGTAA‑TATCTTCACTACTTTTACCTCATCACCATCATCACCGGAAAGACGAGGATATAGCTGGATGGTTCTTGGTGATTTCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAGCTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCAGTCCGGTAATATTTTAGAtt > 1:124235/1‑251 (MQ=255) 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tttCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAGCTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCAGTCCGGTAATATTTTAGATTATGCGATTTTACATGACGCACATTTACCACGTCGAGAGCAAGTACGTGAACGTATCGGCGCAAGTTTAATGTTAAATCAGTTACGCTCACAAATTACATCCGATCATTTTc > 1:790580/1‑230 (MQ=255) tttCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAGCTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCAGTCCGGTAATATTTTAGATTATGCGATTTTACATGACGCACATTTACCACGTCGAGAGCAAGTACGTGAACGTATCGGCGCAAGTTTAATGTTAAATCAGTTACGCTCACAAATTACATCCGATCATTTTCCTGTTAGTTTTGTTCATGAt > 1:2610/1‑250 (MQ=255) cGTGCGCCGGTTAATTTGGAAGCTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCAGTCCGGTAATATTTTAGATTATGCGATTTTACATGACGCACATTTACCACGTCGAGAGCAAGTACGTGAACGTATCGGCGCAAGTTTAATGTTAAATCAGTTACGCTCACAAATTACATCCGATCATTTTCCTGTTAGTTTTGTTCATGATCGCTAAgg < 1:388958/251‑1 (MQ=255) aaTCTGGAAGCTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCAGTCCGGTAATATTTTAGATTATGCGATTTTACATGACGCACATTTACCACGTCGAGAGCAAGTACGTGAACGTATCGGCGCAAGTTTAATGTTAAATCAGTTACGCTCACAAATTACATCCGATCATTTTCCTGTTAGTTTTGTTCATGATCGCTAAGGAGAATAc > 1:714843/1‑246 (MQ=255) tCTGGAAGCTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCAGTCCGGTAATATTTTAGATTATGCGATTTTACATGACGCACATTTACCACGTCGAGAGCAAGTACGTGAACGTATCGGCGCAAGTTTAATGTTAAATCAGTTACGCTCACAAATTACATCCGATCATTTTCCTGTTAGTTTTGTTCATGATCGCTAAgg > 1:134179/1‑237 (MQ=255) | TGAAGCTTTTATCGTACATTCTGATTCTTCTGTGCTTCAATCTCGCCCGGCAGTAGGTATCCGCATTGGTACTGATGTATTTTTTACAGTGCATGCTTTGGCCACAGGTGGTTCTGATGCGGTAAGTTTAATTCGTAA‑TATCTTCACTACTTTTACCTCATCACCATCATCACCGGAAAGACGAGGATATAGCTGGATGGTTGTTGGTGATTTCAAT‑CGTGCGCCGGTTAATCTGGAAACTGCATTAAGACAGGAACCCGCCGTGAGTGAAAATACAATTATTATTGCGCCAACAGAACCGACTCATCGGTCCGGTAATATTTTAGATTATGCGATTTTACATGACGCACATTTACCACGTCGAGAGCAAGCACGTGAACGTATCGGCGCAAGTTTAATGTTAAATCAGTTACGCTCACAAATTACATCCGATCATTTTCCTGTTAGTTTTGTTCATGATCGCTAAGGAGAATAC > 1/1025929‑1026403 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |