| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,012,286 | A→C | M205L (ATG→CTG) | unknown → | Probable sugar efflux transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,012,286 | 0 | A | C | 100.0% | 289.7 / NA | 95 | M205L (ATG→CTG) | unknown | Probable sugar efflux transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (50/45); total (50/45) | |||||||||||
CCCTTGCGGTGCGGGTGGCACCGAAAGATAAAAAAGCACAGGCGATCGGGTTGCTGGCAATGGGTAGCGCGTTGGCGATGGTGCTAGGCTTGCCCCTTGGACGGGTTATCGGACAGTATTTTGGTTGGCGTGAGGCATTCGGCATTATCGCGTTCCTGGCGTTTGCCGTGTTAGTATTGCTTTATCGCTTCCTGCCGCACTTGGCGAGCCTCAATGCCGGTTCGTTGAAATCCGTTCCTTTGATGTTTAAACGTCCGCTGCTGGTAGGATTATATGTGCTGACCATTCTGATTATTTCGGCGCATTTCACCGCTTACAGTTATATTGAACCGTTTATTGTGCGTATCGGCGCAATGAGCGATAGCACCGCCACGGCGATCTTATTGATTTTTGGCTTATCGGGCATTACCGCCAGTTTGTTGTTTAACCGCTTTCACCGTTTCGCACCGGCAAAATTTTTGTTGAGCACCATGGCTATTTTAG > 1/1012044‑1012526 | cccTTGCGGTGCGGGTGGCACCGAAAGATAAAAAAGCACAGGCGATCGGGTTGCTGGCAATGGGTAGCGCGTTGGCGATGGTGCTAGGCTTGCCCCTTGGACGGGTTATCGGACAGTATTTTGGTTGGCGTGAGGCATTCGGCATTATCGCGTTCCTGGCGTTTGCCGTGTTAGTATTGCTTTATCGCTTCCTGCCGCACTTGGCGAGCCTCAATGCCGGTTCGTTGAAATCCGTTCCTTTGCTGTTTaaa < 1:749344/251‑1 (MQ=255)cccTTGCGGTGCGGGTGGCACCGAAAGATAAAAAAGCACAGGCGATCGGGTTGCTGGCAATGGGTAGCGCGTTGGCGATGGTGCTAGGCTTGCCCCTTGGACGGGTTATCGGACAGTATTTTGGTTGGCGTGAGGCATTCGGCATTATCGCGTTCCTGGCGTTTGCCGTGTTAGTATTGCTTTATCGCTTCCTGCCGCACTTGGCGAGCCTCAATGCCGGTTCGTTGAAATCCGTTCCTTTGCTGTTTaaa > 1:592974/1‑251 (MQ=255) cTTGCGGTGCGGGTGGCACCGAAAGATAAAAAAGCACAGGCGATCGGGTTGCTGGCAATGGGTAGCGCGTTGGCGATGGTGCTAGGCTTGCCCCTTGGACGGGTTATCGGACAGTATTTTGGTTGGCGTGAGGCATTCGGCATTATCGCGTTCCTGGCGTTTGCCGTGTTAGTATTGCTTTATCGCTTCCTGCCGCACTTGGCGAGCCTCAATGCCGGTTCGTTGAAATCCGTTCCTTTGCTGTTTAAACg < 1:467317/251‑1 (MQ=255) cTTGCGGTGCGGGTGGCACCGAAAGATAAAAAAGCACAGGCGATCGGGTTGCTGGCAATGGGTAGCGCGTTGGCGATGGTGCTAGGCTTGCCCCTTGGACGGGTTATCGGACAGTATTTTGGTTGGCGTGAGGCATTCGGCATTATCGCGTTCCTGGCGTTTGCCGTGTTAGTATTGCTTTATCGCTTCCTGCCGCACTTGGCGAGCCTCAATGCCGGTTCGTTGAAATCCGTTCCTTTGCTGTTTAAACg < 1:330296/251‑1 (MQ=255) ggtgcggGTGGCACCGAAAGATAAAAAAGCACAGGCGATCGGGTTGCTGGCAATGGGTAGCGCGTTGGCGATGGTGCTAGGCTTGCCCCTTGGACGGGTTATCGGACAGTATTTTGGTTGGCGTGAGGCATTCGGCATTATCGCGTTCCTGGCGTTTGCCGTGTTAGTATTGCTTTATCGCTTCCTGCCGCACTTGGCGAGCCTCAATGCCGGTTCGTTGAAATCCGTTCCTTTGCTGTTTAAACGTCCg > 1:663516/1‑250 (MQ=255) gtgcggGTGGCACCGAAAGATAAAAAAGCACAGGCGATCGGGTTGCTGGCAATGGGTAGCGCGTTGGCGATGGTGCTAGGCTTGCCCCTTGGACGGGTTATCGGACAGTATTTTGGTTGGCGTGAGGCATTCGGCATTATCGCGTTCCTGGCGTTTGCCGTGTTAGTATTGCTTTATCGCTTCCTGCCGCACTTGGCGAGCCTCAATGCCGGTTCGTTGAAATCCGTTCCTTTGCTGTTTAAACGTCCg > 1:839058/1‑249 (MQ=255) gtgcggGAGGCACCGAAAGATAAAAAAGCACAGGCGATCGGGTTGCTGGCAATGGGTAGCGCGTTGGCGATGGTGCTAGGCTTGCCCCTTGGACGGGTTATCGGACAGTATTTTGGTTGGCGTGAGGCATTCGGCATTATCGCGTTCCTGGCGTTTGCCGTGTTAGTATTGCTTTATCGCTTCCTGCCGCACTTGGCGAGCCTCAATGCCGGTTCGTTGAAATCCGTTCCTTTGCTGTTTAAACGTCCg > 1:839071/1‑249 (MQ=255) tGGCACCGAAAGATAAAAAAGCACAGGCGATCGGGTTGCTGGCAATGGGTAGCGCGTTGGCGATGGTGCTAGGCTTGCCCCTTGGACGGGTTATCGGACAGTATTTTGGTTGGCGTGAGGCATTCGGCATTATCGCGTTCCTGGCGTTTGCCGTGTTAGTATTGCTTTATCGCTTCCTGCCGCACTTGGCGAGCCTCAATGCCGGTTCGTTGAAATCCGTTCCTTTGCTGTTTAAACGTCCGCTGCTGGTa < 1:51863/251‑1 (MQ=255) ctcggaatgtgtataagagacaGGCGATCGGGTTGCTGGCAATGGGTAGCGCGTTGGCGATGGTGCTAGGCTTGCCCCTTGGACGGGTTATCGGACAGTATTTTGGTTGGCGTGAGGCATTCGGCATTATCGCGTTCCTGGCGTTTGCCGTGTTAGTATTGCTTTATCGCTTCCTGCCGCACTTGGCGAGCCTCAATGCCGGTTCGTTGAAATCCGTTCCTTTGCTGTTTAAACGTCCGCTGCTGGTAgg < 1:248282/231‑1 (MQ=255) cACCGAAAGATAAAAAAGCACAGGCGATCGGGTTGCTGGCAATGGGTAGCGCGTTGGCGATGGTGCTAGGCTTGCCCCTTGGACGGGTTATCGGACAGTATTTTGGTTGGCGTGAGGCATTCGGCATTATCGCGTTCCTGGCGTTTGCCGTGTTAGTATTGCTTTATCGCTTCCTGCCGCACTTGGCGAGCCTCAATGCCGGTTCGTTGAAATCCGTTCCTTTGCTGTTTAAACGTCCGCTGCTGGTAgg < 1:777565/250‑1 (MQ=255) 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CCCTTGCGGTGCGGGTGGCACCGAAAGATAAAAAAGCACAGGCGATCGGGTTGCTGGCAATGGGTAGCGCGTTGGCGATGGTGCTAGGCTTGCCCCTTGGACGGGTTATCGGACAGTATTTTGGTTGGCGTGAGGCATTCGGCATTATCGCGTTCCTGGCGTTTGCCGTGTTAGTATTGCTTTATCGCTTCCTGCCGCACTTGGCGAGCCTCAATGCCGGTTCGTTGAAATCCGTTCCTTTGATGTTTAAACGTCCGCTGCTGGTAGGATTATATGTGCTGACCATTCTGATTATTTCGGCGCATTTCACCGCTTACAGTTATATTGAACCGTTTATTGTGCGTATCGGCGCAATGAGCGATAGCACCGCCACGGCGATCTTATTGATTTTTGGCTTATCGGGCATTACCGCCAGTTTGTTGTTTAACCGCTTTCACCGTTTCGCACCGGCAAAATTTTTGTTGAGCACCATGGCTATTTTAG > 1/1012044‑1012526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |