| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 968,666 | C→A | E90* (GAA→TAA) | unknown ← | Galactose/methyl galactoside ABC transporter, ATP‑binding protein MglA (EC 3.6.3.17) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 968,666 | 0 | C | A | 100.0% | 233.5 / NA | 82 | E90* (GAA→TAA) | unknown | Galactose/methyl galactoside ABC transporter, ATP‑binding protein MglA (EC 3.6.3.17) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (39/43); total (39/43) | |||||||||||
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aCGCTGGTCTGACGCACCAGATTCAATTCCTGGTGCACCATGGAAATGCCGTTTTCCAGGGCTTATTTTGAGGTTTTAAAGTTAACGGGCTTGCCTAAAAATAAAATATCGCCTTCATCTTTAGCATAAATACCAAATAAACATTTTAGCAGTGTGGATTTACCCGCACCGTTTTCCCCCATCAATGCGTGTACAGAATGTGaa > 1:372333/1‑204 (MQ=255) cGCTGGTCTGACGCACCAGATTCAATTCCTGGTGCACCATGGAAATGCCGTTTTCCAGGGCTTATTTTGAGGTTTTAAAGTTAACGGGCTTGCCTAAAAATAAAATATCGCCTTCATCTTTAGCATAAATACCAAATAAACATTTTAGCAGTGTGGATTTACCCGCACCGTTTTCCCCCATCAATGCGTGTACAGAATGTGAACGGACGGTCAGATTCGCCTGATCTAAGGCTTTTACGCCCGGAAAGGAt < 1:792052/251‑1 (MQ=255) gTCTGACGCACCAGATTCAATTCCTGGTGCACCATGGAAATGCCGTTTTCCAGGGCTTATTTTGAGGTTTTAAAGTTAACGGGCTTGCCTAAAAATAAAATATCGCCTTCATCTTTAGCATAAATAc > 1:441980/1‑127 (MQ=255) gTCTGACGCACCAGATTCAATTCCTGGTGCACCATGGAAATGCCGTTTTCCAGGGCTTATTTTGAGGTTTTAAAGTTAACGGGCTTGCCTAAAAATAAAATATCGCCTTCATCTTTAGCATAAATACCAAATAAACATTTTAGCAGTGTGGATTTACCCGCACCGTTTTCCCCCATCAATGCGTGTACAGAATGTGAACGGACGGTCAGATTCGCCTGATCTAAGGCTTTTACGCCCGGAAAGGATTTAc < 1:511407/250‑1 (MQ=255) cACCAGATTCAATTCCTGGTGCACCATGGAAATGCCGTTTTCCAGGGCTTATTTTGAGGTTTTAAAGTTAACGGGCTTGCCTAAAAATAAAATATCGCCTTCATCTTTAGCATAAATACCAAATAAACATTTTAGCAGTGTGGATTTACCCGCACCGTTTTCCCCCATCAATGCg > 1:247808/1‑175 (MQ=255) gATTCAATTCCTGGTGCACCATGGAAATGCCGTTTTCCAGGGCTTATTTTGAGGTTTTAAAGTTAACGGGCTTGCCTAAAAATAAAATATCGCCTTCATCTTTAGCATAAATACCAAATAAACATTTTAGCAGTGTGGATTTACCCGCACCGTTTTCCCCCATCAATGCGTGTACAGAATGTGAACGGACGGTCAGATTCGCCTGATCTAAGGCTTTTACGCCCGGAAAGGATTTACTGACATCCTTc < 1:656045/248‑1 (MQ=255) gATTCAATTCCTGGTGCACCATGGAAATGCCGTTTTCCAGGGCTTATTTTGAGGTTTTAAAGTTAACGGGCTTGCCTAAAAATAAAATATCGCCTTCATCTTTAGCATAAATACCAAATAAACATTTTAGCAGTGTGGATTTACCCGCACCGTTTTCCCCCATCAATGCGTGTACAGAATGTGAACGGACGGTCAGATTCGCCTGATCTAAGGCTTTTACGCCCGGAAAGGATTTACTGACATCCTTc < 1:203701/248‑1 (MQ=255) 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ggCTTATTTTGAGGTTTTAGAGTTAACGGGCTTGCCTAAAAATAAAATATCGCCTTCATCTTTAGCATAAATACCAAATAAACATTTTAGc < 1:315996/91‑1 (MQ=255) ggCTTATTTTGAGGTTTTAAAGTTAACGGGCTTGCCTAAAAATAAAATATCGCCTTCATCTTTAGCATAAATACCAAATAAACATTTTAGCAGTGTGGAtt < 1:134446/101‑1 (MQ=255) ggCTTATTTTGAGGTTTTAAAGTTAACGGGCTTGCCTAAAAATAAAATATCGCCTTCATCTTTAGCATAAATACCAAATAAACATTTTAGCAGTGTGGATTTACCCGCACCGTTTTCCCCCATCAATGCGTGTACAGAATGTGAACGGACGGTCAGATTCGCCTGATCTAAGGCTTTTACGCCCGGAAAgg < 1:209822/191‑1 (MQ=255) | TAAGAAAACGCTTTCGCAATTTCGATCATCTGCATTTGAGAAACGGAAAGTTTCGCCACTTTTTCTTTCGGATCAATATCAATATCCAACTCGTCAAAAATGGCTTTGGTATCACGATAGATTTTGGCGTGATCCACAAACGGTCCTTTCAGCGGATAACGTCCGAGCCACAGGTTATCCATTACGCTGGTCTGACGCACCAGATTCAATTCCTGGTGCACCATGGAAATGCCGTTTTCCAGGGCTTCTTTTGAGGTTTTAAAGTTAACGGGCTTGCCTAAAAATAAAATATCGCCTTCATCTTTAGCATAAATACCAAATAAACATTTTAGCAGTGTGGATTTACCCGCACCGTTTTCCCCCATCAATGCGTGTACAGAATGTGAACGGACGGTCAGATTCGCCTGATCTAAGGCTTTTACGCCCGGAAAGGATTTACTGACATCCTTCATCGTAAGCAGCACTTCACCGCTTTGACT > 1/968419‑968897 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |