| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,304,016 | Δ3,545 bp | [unknown]–[unknown] | [unknown], unknown, [unknown] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1304016 | 1307560 | 3545 | 74 [0] | [0] 73 | [unknown]–[unknown] | [unknown],unknown,[unknown] |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1304015 | 0 (0.000) | 73 (0.850) | 44/420 | 0.7 | 100% | coding (2205/2373 nt) | unknown | Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) |
| ? | 1 | 1307561 = | 0 (0.000) | coding (1328/2715 nt) | unknown | Helicase, SNF2/RAD54 family | |||||
TGCAAACAGGCTTTGGCGAAATAGCAAAACTGGGGGCGACACAAAAGGCGATTATTTTTACGGAATCGGTTCGTACACAACATTATTTGTATGATTTCTTGCTTCAAAATGGCTACGCCGATCAGGTGGTGATGTTTAGTGGGACAAATAATGATGCTCAATCGACCCAAATTTACCATGATTGGTTAGCATGCAATGCTGGTACGGAAAAAGTCACGGGATCGGTCGATGTGGATAAACGTTCTGCCTTAATTGAGCATTTCCGCAAAAATGCACAGATTATGATTGCCACTGAGGCTGCGAGCGAAGGGGTGAACTTACAATTTTGCTCATTGCTGATTAACTATGATTTACCTTGGAATCCACAGCGAGTAGAACAGCGGATTGGTCGTTGTCATCGTTATGGGCAGAAATTTGACGTAGTTGTGGTGAATTTCTTGAATAAACGCAATCTTGCCGATCAACGCGTGTTAGAGTTACTTA > 1/1307321‑1307803 | gagcattttgccaaaccgttcgattacgaattaaatattgccaccagctcggcaggggcgtatcagccacaaaaaattgatttagtggaaacctttaactatttgattgggttgcgggtgaatacggtagatgatcgccgtgagcgtggcatggtgtcggtggagggtacgcttccaagcggtgaaaaaaccttaattatttggcgagatgtggaacgcatggattatgaggcgttaaacGTTCTGCCTTa > 1:865889‑M2/241‑251 (MQ=255) cattttgccaaaccgttcgattacgaattaaatattgccaccagctcggcaggggcgtatcagccacaaaaaattgatttagtggaaacctttaactatttgattgggttgcgggtgaatacggtagatgatcgccgtgagcgtggcatggtgtcggtggagggtacgcttccaagcggtgaaaaaaccttaattatttggcgagatgtggaacgcatggattatgaggcgttaaacGTTCTGCCTTAAt < 1:783917‑M2/13‑1 (MQ=255) attttgccaaaccgttcgattacgaattaaatattgccaccagctcggcaggggcgtatcagccacaaaaaattgatttagtggaaacctttaactatttgattgggttgcgggtgaatacggtagatgatcgccgtgagcgtggcatggtgtcggtggagggtacgcttccaagcggtgaaaaaaccttaattatttggcgagatgtggaacgcatggattatgaggcgttaaacGTTCTGCCTTAATTg < 1:551924‑M2/15‑1 (MQ=255) attttgccaaaccgttcgattacgaattaaatattgccaccagctcggcaggggcgtatcagccacaaaaaattgatttagtggaaacctttaactatttgattgggttgcgggtgaatacggtagatgatcgccgtgagcgtggcatggtgtcggtggagggtacgcttccaagcggtgaaaaaaccttaattatttggcgagatgtggaacgcatggattatgaggcgttaaacGTTCTGCCTTAATTg < 1:781306‑M2/15‑1 (MQ=255) ttgccaaaccgttcgattacgaattaaatattgccaccagctcggcaggggcgtatcagccacaaaaaattgatttagtggaaacctttaactatttgattgggttgcgggtgaatacggtagatgatcgccgtgagcgtggcatggtgtcggtggagggtacgcttccaagcggtgaaaaaaccttaattatttggcgagatgtggaacgcatggattatgaggcgttaaacGTTCTGCCTTAATTGAg > 1:672936‑M2/234‑250 (MQ=255) ccaaaccgttcgattacgaattaaatattgccaccagctcggcaggggcgtatcagccacaaaaaattgatttagtggaaacctttaactatttgattgggttgcgggtgaatacggtagatgatcgccgtgagcgtggcatggtgtcggtggagggtacgcttccaagcggtgaaaaaaccttaattatttggcgagatgtggaacgcatggattatgaggcgttaaacGTTCTGCCTTAATTGAGCAt < 1:564780‑M2/20‑1 (MQ=255) acgaattaaatattgccaccagctcggcaggggcgtatcagccacaaaaaattgatttagtggaaacctttaactatttgattgggttgcgggtgaatacggtagatgatcgccgtgagcgtggcatggtgtcggtggagggtacgcttccaagcggtgaaaaaaccttaattatttggcgagatgtggaacgcatggattatgaggcgttaaacGTTCTGCCTTAATTGAGCATTTCCGCAAAAATGcac < 1:345548‑M2/36‑1 (MQ=255) 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1:897512‑M2/19‑149 (MQ=255) gattatgaggcgttaaacGTTCTGCCTTAATTGAGCATTTCCGCAAAAATGCACAGATTATGATTGCCACTGAGGCTGCGAGCGAAGGGGTGAACTTACAATTTTGCTCATTGCTGATTAACTATGATTTACCTTGGAATCCACAGCGAGTAGAACAGCgg > 1:345625‑M2/19‑161 (MQ=255) gattatgaggcgttaaacGTTCTGCCTTAATTGAGCATTTCCGCAAAAATGCACAGATTATGATTGCCACTGAGGCTGCGAGCGAAGGGGTGAACTTACAATTTTGCTCATTGCTGATTAACTATGATTTACCTTGGAATCCACAGCGAGTAGAACAGCGGATTGGTCGTTGTCATCGTTATGGGc < 1:519826‑M2/168‑1 (MQ=255) attatgaggcgttaaacGTTCTGCCTTAATTGAGCATTTCCGCAAAAATGCACAGATTATGATTGCCACTGAGGCTGCGAGCGAAGGGGTGAACTTACAATTTTGCTCATTGCTGATTAACTATGATTTACCTTGGAATCCACAGCGAGTAGAACAGCgg < 1:42271‑M2/143‑1 (MQ=255) tatgaggcgttaaacGTTCTGCCTTAATTGAGCATTTCCGCAAAAATGCACAGATTATGATTGCCACTGAGGCTGCGAGCGAAGGGGTGAACTTACAATTTTGCTCATTGCTGATTAACTATGATTTACCTTGGAATCCACAGCGAGTAGAACAGCGGATTGGTCGTTGTCATCGTTATGGGCAGAAATTTGACGTAGTTGTGGTGAATTTCTTGAATAAACGCAATCTTGCCGATCAACGCGTGTTagag < 1:624407‑M2/236‑1 (MQ=255) 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TGCAAACAGGCTTTGGCGAAATAGCAAAACTGGGGGCGACACAAAAGGCGATTATTTTTACGGAATCGGTTCGTACACAACATTATTTGTATGATTTCTTGCTTCAAAATGGCTACGCCGATCAGGTGGTGATGTTTAGTGGGACAAATAATGATGCTCAATCGACCCAAATTTACCATGATTGGTTAGCATGCAATGCTGGTACGGAAAAAGTCACGGGATCGGTCGATGTGGATAAACGTTCTGCCTTAATTGAGCATTTCCGCAAAAATGCACAGATTATGATTGCCACTGAGGCTGCGAGCGAAGGGGTGAACTTACAATTTTGCTCATTGCTGATTAACTATGATTTACCTTGGAATCCACAGCGAGTAGAACAGCGGATTGGTCGTTGTCATCGTTATGGGCAGAAATTTGACGTAGTTGTGGTGAATTTCTTGAATAAACGCAATCTTGCCGATCAACGCGTGTTAGAGTTACTTA > 1/1307321‑1307803 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |