| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,554,871 | Δ3 bp | coding (131‑133/165 nt) | unknown ← | UPF0181 protein YoaH |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1554871 | 1554873 | 3 | 46 [0] | [0] 46 | unknown | UPF0181 protein YoaH |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1554870 | 0 (0.000) | 46 (0.530) | 41/426 | 0.8 | 100% | coding (134/165 nt) | unknown | UPF0181 protein YoaH |
| ? | 1 | 1554874 = | 0 (0.000) | coding (130/165 nt) | unknown | UPF0181 protein YoaH | |||||
AAACCATTTAACAACACCAACTTCCATAATTCAAACCTCTTATGGTTTTTTAGTCCTTATAGAACTACATTTACTTCAATAAGACAAAATGCCCTATCACCTTGATTTGCTGGCAGTTATATTAAGTAAATTTGTTGGTTGCGCAATAAAAAAAGTCTCAAAATCAAACAGAGATCACAAAAATTATTAAAATTTTGCTGCAAAAACACTTCAGCAATTACTTCTCTTTTGCTTTATCTGCCCGATTTTGTTCCCGTAACTTTTTTGCCACTAAAGCGATAGCCTCGCCGCTGCCCACGCCTTGCGCCATTAATTCCTGAATTTTTTCCACGGCAAGTTGCTGCTGTTCATGGGTTAAATGTAATAAATCGTTATCTAACATTGCATTTCCTTTATTATTTATACAAAAAGTGCGGTCGTTTTTTTAACTGTTTTTTACCACTGAAATGTCCGCATTAAATGTTTCCATTGTTCATCCAATCCCGCTTCAA > 1/1554622‑1555112 | aaaCCATTTAACAACACCAACTTCCATAATTCAAACCTCTTATGGTTTTTTAGTCCTTATAGAACTACATTTACTTCAATAAGACAAAATGCCCTATCACCTTGATTTGCTGGCAGTTATATTAAGTAAATTTGTTGGTTGCGCAATAAAAAAAGTCTCAAAATCAAACAGAGATCACAAAAATTATTAAAATTTTGCTGCAAAAACACTTCAGCAATTACTTCTCTTTTGCTTTATCTGCCCGATTTTcc < 1:64235‑M1/251‑3 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |