| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,397,390 | Δ849 bp | [unknown]–[unknown] | [unknown], [unknown] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1397390 | 1398238 | 849 | 66 [0] | [0] 66 | [unknown]–[unknown] | [unknown],[unknown] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1397389 | 0 (0.000) | 66 (0.760) | 50/426 | 0.5 | 100% | coding (812/1365 nt) | unknown | PTS system, galactitol‑specific IIC component |
| ? | 1 | 1398239 = | 0 (0.000) | coding (275/1044 nt) | unknown | Galactitol‑1‑phosphate 5‑dehydrogenase (EC 1.1.1.251) | |||||
TCGCAGTATTGACCGACACCATCATCGAAAAAATCCCGGGCTTGAATAAAGTGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTAACACCCATTGCCAAGCAAGCACGTAAAAAATTACAGGCGCGTTTCGGCGGCGAAGAATTTCTTATCGGCTTGGATCCGGCGCTCTTGCTTGGACACACCTCAGTGGTGTCCGCCAGTTTGATTTTTATTCCGCTGACTATTTTGGTTGCCGTTATCTTACCGGGAAATCAGGTGCTGCCTTTCGGCGATTTGGCCACTATCGGTTTCTTTGTCGCCATGGCGGTAGCGGTGCATCAGGGCAATTT > 1/1397146‑1397635 | tCGCAGTATTGACCGACACCATCATAGAAAAAATCCCGGGCTTGAATAAAGTGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaaga > 1:751927‑M1/1‑244 (MQ=255)tCGCAGTATTGACCGACACCATCATAGAAAAAATCCCGGGCTTGAATAAAGTGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaag > 1:722336‑M1/1‑244 (MQ=255)tCGCAGTATTGACCGACACCATCATAGAAAAAATCCCGGGCTTGAATAAAGTGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaag < 1:364505‑M1/250‑7 (MQ=255)tCGCAGTATTGACCGACACCATCATAGAAAAAATCCCGGGCTTGAATAAAGTGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaa > 1:748997‑M1/1‑244 (MQ=255) gTATTGACCGACACCATCATAGAAAAAATCCCGGGCTTGAATAAAGTGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgt > 1:619695‑M1/1‑239 (MQ=255) aTTGACCGACACCATCATAGAAAAAATCCCGGGCTTGAATAAAGTGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcac < 1:234671‑M1/251‑15 (MQ=255) gACCGACACCATCATAGAAAAAATCCCGGGCTTGAATAAAGTGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaa > 1:608728‑M1/1‑234 (MQ=255) catcatAGAAAAAATCCCGGGCTTGAATAAAGTGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattat < 1:354398‑M1/251‑27 (MQ=255) catcatAGAAAAAATCCCGGGCTTGAATAAAGTGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattat < 1:295374‑M1/251‑27 (MQ=255) cataatagaaaaacacccgggcttgaataaagtGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTCTTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattat < 1:613019‑M1/236‑27 (MQ=255) tcataGAAAAAATCCCGGGCTTGAATAAAGTGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattat > 1:303773‑M1/1‑223 (MQ=255) atagaaaAAATCCCGGGCTTGAATAAAGTGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcat < 1:134254‑M1/248‑31 (MQ=255) cccGGGCTTGAATAAAGTGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaac < 1:95807‑M1/251‑42 (MQ=255) cccGGGCTTGAATAAAGTGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaac < 1:61944‑M1/251‑42 (MQ=255) ggCTTGAATAAAGTGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactaca > 1:24661‑M1/1‑206 (MQ=255) ttGAATAAAGTGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatt < 1:333036‑M1/251‑49 (MQ=255) tGAATAAAGTGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaattt > 1:204904‑M1/1‑202 (MQ=255) gAATAAAGTGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCCTGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaattt > 1:307239‑M1/1‑201 (MQ=255) aTAAAGTGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcat > 1:376217‑M1/1‑199 (MQ=255) gTGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggtt > 1:570382‑M1/1‑194 (MQ=255) gTGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatg < 1:677905‑M1/204‑11 (MQ=255) gCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattat > 1:582192‑M1/1‑192 (MQ=255) aagcgctTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaat < 1:477376‑M1/248‑85 (MQ=255) gCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatat > 1:764304‑M1/1‑163 (MQ=255) tCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttg < 1:210177‑M1/251‑92 (MQ=255) ggACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttg > 1:396132‑M1/1‑158 (MQ=255) gTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttgg > 1:604632‑M1/1‑140 (MQ=255) gTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtat > 1:799860‑M1/1‑130 (MQ=255) tGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcacca < 1:116084‑M1/251‑126 (MQ=255) tGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcacca < 1:279820‑M1/251‑126 (MQ=255) ggATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaa > 1:830556‑M1/1‑118 (MQ=255) ggATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatg > 1:39135‑M1/1‑118 (MQ=255) gATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcacc > 1:308594‑M1/1‑117 (MQ=255) gATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaattt < 1:25435‑M1/166‑50 (MQ=255) ttattaTCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattat < 1:720644‑M1/141‑27 (MQ=255) tATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatga < 1:522105‑M1/250‑146 (MQ=255) tATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaac < 1:772758‑M1/251‑160 (MQ=255) aTCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaac > 1:880018‑M1/1‑91 (MQ=255) gTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCAGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattc < 1:283564‑M1/115‑29 (MQ=255) ttAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgaaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaacc < 1:334519‑M1/221‑136 (MQ=255) aaaGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctattacgg < 1:144938‑M1/251‑169 (MQ=255) aaaGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctattacgg < 1:733984‑M1/251‑169 (MQ=255) aaaGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctattacgg < 1:655604‑M1/251‑169 (MQ=255) ggTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctattacggtgggtctgcac < 1:431969‑M1/242‑180 (MQ=255) gTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctattacggtgggtctgcacgccattaat > 1:263935‑M1/1‑62 (MQ=255) tAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctattacggtgggtctgcacgccattaatc < 1:652046‑M1/250‑190 (MQ=255) tAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctattacggtgggtctgcacgccattaatc < 1:402464‑M1/250‑190 (MQ=255) ccGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaa > 1:177772‑M1/1‑55 (MQ=255) gATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctattacggt > 1:16234‑M1/1‑45 (MQ=255) tgttgtTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctattacggtgggtctgcacgccattaatctggcgcaggggtgtagcga < 1:805503‑M1/251‑209 (MQ=255) gttAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctattacgg > 1:598786‑M1/1‑39 (MQ=255) aaTGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctattacggtgggtctgcacgccattaatctggcgcaggggtgtagcgataaaaat < 1:813162‑M1/251‑216 (MQ=255) aaTGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctattacggtgggtctgcacgccattaatctggcgcaggggtgtagcgataaaaat < 1:191295‑M1/251‑216 (MQ=255) aTGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctattacggtgggtctgcacgccattaatctggcgcaggggtgtagcgataaaaatg < 1:859439‑M1/251‑217 (MQ=255) tCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctattacggtgggtctgcacgccattaatctggcgcaggggtgtagcgataaaaatgtgattgtggt > 1:375359‑M1/1‑25 (MQ=255) tCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctattacggtgggtc > 1:874760‑M1/1‑25 (MQ=255) tCATTAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattc < 1:171925‑M1/53‑29 (MQ=255) tAAACCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctattacggtgggtctgcacgccattaatctggcgcaggggtgtagcgataaaaatgtgattgtggtagga < 1:80011‑M1/251‑231 (MQ=255) aaaCCAATCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctattacggtgggtctgcacg > 1:82354‑M1/1‑20 (MQ=255) aTCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctattacggtgggtctgcacgccattaatctggcgcaggggtgtagcgataaaaatg < 1:68160‑M1/230‑217 (MQ=255) aTCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctattacggtgggtctgcacgccattaatctggcg > 1:74236‑M1/1‑14 (MQ=255) aTCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctattacggtgggtc < 1:584577‑M1/188‑175 (MQ=255) tCATGGACGGTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctattacggtgggtctgcacgccattaatctggcgcaggggtgtagcgataaaaatgtgattgtggtaggagccggtac < 1:567799‑M1/251‑239 (MQ=255) gTTTgcgacgaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatat > 1:408939‑M1/1‑4 (MQ=255) gTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctattacggtgggtctgcacgccattaatctggcgcaggggtgtagcgataaaaatgtgattgtggtaggagccggtactattggct < 1:493545‑M1/250‑247 (MQ=255) gTTTgcgaagaatgtcacaaaggatattattcattatgtaaaaactacaatttcatcggttcccgtcgcttcggcgccaatgcggaatatatttgcgtcaacaagaaaaatttggtgaaagtatcaccagattccaaccctttgcatgatgcttttatcgaacctatta > 1:195043‑M1/1‑4 (MQ=255) | TCGCAGTATTGACCGACACCATCATCGAAAAAATCCCGGGCTTGAATAAAGTGCATTTCTCCGCCGATGATTTGCAAAAACGCTTCGGACCGTTCGGCGAGCCGGTCACCGTCGGTTTTGTCATGGGGATTATTATCGGTATTTTGGCGGGCTATCCGTTAAAAGACATTTTGCAGTTAGCGGTAAAAACCGCTGCAGTGATGTTGTTAATGCCACGCGTCATTAAACCAATCATGGACGGTTTAACACCCATTGCCAAGCAAGCACGTAAAAAATTACAGGCGCGTTTCGGCGGCGAAGAATTTCTTATCGGCTTGGATCCGGCGCTCTTGCTTGGACACACCTCAGTGGTGTCCGCCAGTTTGATTTTTATTCCGCTGACTATTTTGGTTGCCGTTATCTTACCGGGAAATCAGGTGCTGCCTTTCGGCGATTTGGCCACTATCGGTTTCTTTGTCGCCATGGCGGTAGCGGTGCATCAGGGCAATTT > 1/1397146‑1397635 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |