| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,392,146 | Δ603 bp | intergenic (+158/+624) | unknown → / ← unknown | LSU ribosomal protein L20p/hypothetical protein |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1392146 | 1392748 | 603 | 35 [0] | [0] 35 | unknown/unknown | LSU ribosomal protein L20p/hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1392145 | 0 (0.000) | 35 (0.400) | 31/426 | 1.5 | 100% | intergenic (+157/+1227) | unknown/unknown | LSU ribosomal protein L20p/hypothetical protein |
| ? | 1 | 1392749 = | 0 (0.000) | intergenic (+761/+623) | unknown/unknown | LSU ribosomal protein L20p/hypothetical protein | |||||
GTAAGATCCTTGCTGATATCGCCGTATTCGACAAAGTGGCTTTCGCTGCATTAGTTGAAAAAGCAAAATCTGCACTTTAATTTTAAAGTTTAGATAAAAAATAAGGGCGCTCATGAGCGTCCTTTTTATTATTGTTGATTTTCTGATTGATTGGCTATTTTTTCTTGTTTTGAATAATAGAAATAGAGCCAAATGAGTCCGATTGGTGAGATAAATAAAGCAAAAAAGTAACAGATAGCTATAAAAACCGTACGCTATGCGTATGGAATCAAAGAGTTTAGCGGTCAACATAAAAAATCCTCACTATATATAATGGATAAGGTTGACAACCAAAATTCAAGATACAGGAGGATAAGTCAATGGTAAGTAAATCCAATGACGGTTCAAGCCTATCACACACCAAATGGAGCTGTAAGTATCACATCGTCTTCACACCGAAATAG > 1/1391909‑1392351 | gTAAGATCCTTGCTGATATCGCCGTATTCGACAAAGTGGCTTTCGCTGCATTAGTTGAAAAAGCAAAATCTGCACTTTAATTTTAAAGTTTAGATAAAAAATAAGGGCGCTCATGAGCGTCCTTTTTATTATTGTTGATTTTCTGATTGATTGGCTATTTTTTCTTGTTTTGAATAATAGAAATAGAGCCAAATGAGTCCGATTGGTGAGATAAATAAAGCAAAAAAGTAACAGATAtccattcattctaa > 1:586244‑M1/1‑237 (MQ=255) aTCCTTGCTGATATCGCCGTATTCGACAAAGTGGCTTTCGCTGCATTAGTTGAAAAAGCAAAATCTGCACTTTAATTTTAAAGTTTAGATAAAAAATAAGGGCGCTCATGAGCGTCCTTTTTATTATTGTTGATTTTCTGATTGATTGGCTATTTTTTCTTGTTTTGAATAATAGAAATAGAGCCAAATGAGTCCGATTGGTGAGATAAATAAAGCAAAAAAGTAACAGATAtccattcattctaatga < 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GTAAGATCCTTGCTGATATCGCCGTATTCGACAAAGTGGCTTTCGCTGCATTAGTTGAAAAAGCAAAATCTGCACTTTAATTTTAAAGTTTAGATAAAAAATAAGGGCGCTCATGAGCGTCCTTTTTATTATTGTTGATTTTCTGATTGATTGGCTATTTTTTCTTGTTTTGAATAATAGAAATAGAGCCAAATGAGTCCGATTGGTGAGATAAATAAAGCAAAAAAGTAACAGATAGCTATAAAAACCGTACGCTATGCGTATGGAATCAAAGAGTTTAGCGGTCAACATAAAAAATCCTCACTATATATAATGGATAAGGTTGACAACCAAAATTCAAGATACAGGAGGATAAGTCAATGGTAAGTAAATCCAATGACGGTTCAAGCCTATCACACACCAAATGGAGCTGTAAGTATCACATCGTCTTCACACCGAAATAG > 1/1391909‑1392351 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |