| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 2,033,460 | (CGCCC)2→3 | coding (406/642 nt) | unknown → | Oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB (TC 3.A.1.5.1) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 2033450 | 1 (0.010) | 103 (1.200) +CGCCC |
68/400 | 0.1 | 99.0% | coding (396/642 nt) | unknown | Oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB (TC 3.A.1.5.1) |
| ? | 1 | 2033451 = | 1 (0.010) | coding (397/642 nt) | unknown | Oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB (TC 3.A.1.5.1) | |||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CCTTTACTGGTGCTGTTGTTTGCGATAACTCTGGGCTGGCTGCCGGCAGGCGGTTGGAATGAGGGGGCTTTGAGTTACATTCTGTTGCCGGTGGCATCCTTAACCATCGGATATGTGGCGGGCATTGCGCGGATTATGCGCGGTTCTATGATTGAAGTG‑TTGCACTCCAATTTTATTCGTACCGCCAAGGCAAAAGGCTTGTCCACCTCTCGCATTATCTTAAAGCACGCGCTGCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAACCGTATTCGGCTTACCGGGCATGGGCAAACTTTTCGTTAACGGCGCGCTTAACCGCGATTATTCCCTTGTATTGAGCCTCACGATTTTGGTCGGCACACTGACTATCGTTTTTAACGCCGTAGTGGATATTTTATACGCCGTGATTGATCCGAAAATTCGTTAT > 1/2033217‑2033693 | tactggtgctgttgtttgcgataactctgggctggctgccggcaggcggttggaatgagggggctttgagttacattctgttgccggtggcatccttaaccatcggatatgtggcgggcattgcgcggattatgcgcggttctatgattgaagtgttgcactccaattttattcgtaccgccaaggcaaaaggcttgtccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTg > 1:488533‑M2/236‑250 (MQ=255) ctACTGGTGCTGTTGTTTGAGACAACTCTGGGATGGCTGCCGGCAGCACGTTGGAATGACGGGGCTTTGAGTGGATTTCTGTTGCCGGTGGCATCCTTAACCATCGGATATGTGGCGGGCATTGCGCGGATTATGAGGGTTTCTATGATTG‑GGTGTTTGCACTACAGTTTTATTCGTACCGGCAAGGCAAAAGGCGTGTCCACCTGGGGAGTTATCTTAAAGCGCGCGCTGcgccccgccccgccctg < 1:319840/247‑8 (MQ=255) ggtgctgttgtttgcgataactctgggctggctgccggcaggcggttggaatgagggggctttgagttacattctgttgccggtggcatccttaaccatcggatatgtggcgggcattgcgcggattatgcgcggttctatgattgaagtgttgcactccaattttattcgtaccgccaaggcaaaaggcttgtccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCcggg > 1:439499‑M2/232‑250 (MQ=255) gtgctgttgtttgcgataactctgggctggctgccggcaggcggttggaatgagggggctttgagttacattctgttgccggtggcatccttaaccatcggatatgtggcgggcattgcgcggattatgcgcggttctatgattgaagtgttgcactccaattttattcgtaccgccaaggcaaaaggcttgtccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTg > 1:186480‑M2/231‑251 (MQ=255) ttgtttgcgataactctgggctggctgccggcaggcggttggaatgagggggctttgagttacattctgttgccggtggcatccttaaccatcggatatgtggcgggcattgcgcggattatgcgcggttctatgattgaagtgttgcactccaattttattcgtaccgccaaggcaaaaggcttgtccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTAcc < 1:525043‑M2/27‑1 (MQ=255) ttgtttgcgataactctgggctggctgccggcaggcggttggaatgagggggctttgagttacattctgttgccggtggcatccttaaccatcggatatgtggcgggcattgcgcggattatgcgcggttctatgattgaagtgttgcactccaattttattcgtaccgccaaggcaaaaggcttgtccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTAcc < 1:366709‑M2/27‑1 (MQ=255) gtttgcgataactctgggctggctgccggcaggcggttggaatgagggggctttgagttacattctgttgccggtggcatccttaaccatcggatatgtggcgggcattgcgcggattatgcgcggttctatgattgaagtgttgcactccaattttattcgtaccgccaaggcaaaaggcttgtccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTAc < 1:334292‑M2/26‑1 (MQ=255) taactctgggctggctgccggcaggcggttggaatgagggggctttgagttacattctgttgccggtggcatccttaaccatcggatatgtggcgggcattgcgcggattatgcgcggttctatgattgaagtgttgcactccaattttattcgtaccgccaaggcaaaaggcttgtccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGc < 1:132695‑M2/37‑1 (MQ=255) taactctgggctggctgccggcaggcggttggaatgagggggctttgagttacattctgttgccggtggcatccttaaccatcggatatgtggcgggcattgcgcggattatgcgcggttctatgattgaagtgttgcactccaattttattcgtaccgccaaggcaaaaggcttgtccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGc < 1:731397‑M2/37‑1 (MQ=255) actctgggctggctgccggcaggcggttggaatgagggggctttgagttacattctgttgccggtggcatccttaaccatcggatatgtggcgggcattgcgcggattatgcgcggttctatgattgaagtgttgcactccaattttattcgtaccgccaaggcaaaaggcttgtccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAg > 1:163597‑M2/213‑246 (MQ=255) actctgggctggctgccggcaggcggttggaatgagggggctttgagttacattctgttgccggtggcatccttaaccatcggatatgtggcgggcattgcgcggattatgcgcggttctatgattgaagtgttgcactccaattttattcgtaccgccaaggcaaaaggcttgtccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCg > 1:758551‑M2/213‑251 (MQ=255) actctgggctggctgccggcaggcggttggaatgagggggctttgagttacattctgttgccggtggcatccttaaccatcggatatgtggcgggcattgcgcggattatgcgcggttctatgattgaagtgttgcactccaattttattcgtaccgccaaggcaaaaagcttgtccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCg > 1:195794‑M2/213‑251 (MQ=255) ctctgggctggctgccggcaggcggttggaatgagggggctttgagttacattctgttgccggtggcatccttaaccatcggatatgtggcgggcattgcgcggattatgcgcggttctatgattgaagtgttgcactccaattttattcgtaccgccaaggcaaaaggcttgtccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGggcccg > 1:330752‑M2/212‑249 (MQ=255) 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atgagggggctttgagttacattctgttgccggtggcatccttaaccatcggatatgtggcgggcattgcgcggattatgcgcggttctatgattgaagtgttgcactccaattttattcgtaccgccaaggcaaaaggcttgtccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATgg < 1:732722‑M2/70‑1 (MQ=255) ggctttgagttacattctgttgccggtggcatccttaaccatcggatatgtggcgggcattgcgcggattatgcgcggttctatgattgaagtgttgcactccaattttattcgtaccgccaaggcaaaaggcttgtccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTAcc < 1:358614‑M2/27‑1 (MQ=255) ctttgagttacattctgttgccggtggcatccttaaccatcggatatgtggcgggcattgcgcggattatgcgcggttctatgattgaagtgttgcactccaattttattcgtaccgccaaggcaaaaggcttgtccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGaa < 1:589073‑M2/78‑1 (MQ=255) 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1:334321‑M2/71‑150 (MQ=255) attttattcgtaccgccaaggcaaaaggcttgtccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAACCGTATTCGGCTTACCGGGCATGGGCAAACTTTTCGTTAACGGCGCGCTTAAc < 1:590942‑M2/132‑1 (MQ=255) ttttattcgtaccgccaaggcaaaaggcttgtccccctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAACCGTATTCGGCTTACCGGGCATGGGCAAACTTTTCGTTAACGGCGCGCTTAACCGCGATTATTCCCTTGTATTGAGCCTCACGATTTTGGTCGGCACACTGAc < 1:832163‑M2/182‑1 (MQ=255) tcgtaccgccaaggcaaaaggcttgtccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAACCGTATTCGGCTTACCGGGCATGGGCAAACTTTTCGTTAACGGCGCGCTTAACCGCGATTATTCCCTTGTATTGAGCCTCACGATTTTGGTCGGCACACTGACTATCGt < 1:648941‑M2/188‑1 (MQ=255) 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ggcaaaaggcttgtccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAACCGTATTCGGCTTACCGGGCATGGGCAAACTTTTCGTTAACGGCGCGCTTAACCGCGATTATTCCCTTGTATTGAGc > 1:736262‑M2/52‑207 (MQ=255) ggcttgtccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATgg > 1:360479‑M2/45‑114 (MQ=255) ggcttgtccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAACCGTATTCGGCTTACCGGGCATGGGCAAACt < 1:380827‑M2/110‑1 (MQ=255) gcttgtccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAACCGTATTCGGCTTACCGGGCATGGGCAAACTTTTCGTTAACGGCGCGCTTAACCGCGATTATTCCCTTGTATTGAGCCTCACGATTTTGGTCGGCACACTGACTATCGTTTTTAACGCCGTAGTGGat < 1:14860‑M2/207‑1 (MQ=255) cttgtccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAACCGTATTCGGCTTACCGGGCATGGGCAAACTTTTCGTTAACGGCGCGCTTAACCGCGATTATTCCCTTGTATTGAGCCTCACGATTTTGGTCGGCACACTGACTATCGTTTTTAACGCCGTAGTGGatat < 1:442136‑M2/209‑1 (MQ=255) tccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAACCGTATTCGGCTTACCGGGCATGGGCAAACTTTTCGTTAACGGCGCGCTTAACCGCGATTATTCCCTTGTATTGAGCCTCACGATTTTGGTCGGCACACTGACTATCGTTTTTAACGCCGTAGTGGATAtttt < 1:841621‑M2/212‑1 (MQ=255) ccacctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTa < 1:214093‑M2/29‑1 (MQ=255) ccctctcgcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAACCGTATTCGGCTTACCGGGCATGGGCAAACTTTTCGTTAACGGCGCGCTTAACCGCGATTATTCCCTTGTATTGAGCCTCACGATTTTGGTCGGCACACTGACTATCGTTTTTAACGCCGTAGTGGATATTTTATAc < 1:192905‑M2/216‑1 (MQ=255) gcattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAACCGTATTCGGCTTACCGGGCATGGGCAAACTTTTCGTTAACGGCGCGCTTAACCGCGATTATTCCCTTGTATTGAGCCTCACGATTTTGGTCGGCACACTGACTATCGTTTTTAACGCCGTAGTGGATATTTTATACGCCGtga > 1:698355‑M2/29‑251 (MQ=255) cattatcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAACCGTATTCGGCTTACCGGGCATGGGCAAACTTTTCGTTAACGGCGCGCTTAACCGCGATTATTCCCTTGTATTGAGCCTCACGATTTTGGTCGGCACACTGACTATCGTTTTTAACGCCGTAGTGGATATTTtat > 1:579674‑M2/28‑241 (MQ=255) atcttaaagtacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAACCGTATTCGGCTTACCGGGCATGGGCAAACTTTTCGTTAACGGCGCGCTTAACCGCGATTATTCCCTTGTATTGAGc < 1:455816‑M2/156‑1 (MQ=255) atcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAACCGTATTCGGCTTACCGGGCATGGGCAAACTTTTCGTTAACGGCGCGCTTAAcc > 1:742686‑M2/24‑156 (MQ=255) atcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAACCGTATTCGGCTTACCGGGCATGGGCAAACTTTTCGTTAACGGCGCGCTTAACCGCGATTATTCCCTTGTATTg < 1:754047‑M2/153‑1 (MQ=255) atcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAACCGTATTCGGCTTACCGGGCATGGGCAAACTTTTCGTTAACGGCGCGCTTAACCGCGATTATTCCCTTGTATTGAGCCTCACGATTTTGGTCGGCACACTGACTATCGTTTTTAACGCCGTAg < 1:726565‑M2/202‑1 (MQ=255) atcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAACCGTATTCGGCTTACCGGGCATGGGCAAACTTTTCGTTAACGGCGCGCTTAACCGCGATTATTCCCTTGTATTGAGCCTCACGATTTTGGTCGGCACACTGACTATCGTTTTTAACGCCGTAGTGGATATTTTATAc < 1:477562‑M2/216‑1 (MQ=255) atcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAACCGTATTCGGCTTACCGGGCATGGGCAAACTTTTCGTTAACGGCGCGCTTAACCGCGATTATTCCCTTGTATTGAGCCTCACGATTTTGGTCGGCACACTGACTATCGTTTTTAACGCCGTAGTGGATATTTTATACGCCGtgattgat > 1:732567‑M2/24‑251 (MQ=255) atcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAACCGTATTCGGCTTACCGGGCATGGGCAAACTTTTCGTTAACGGCGCGCTCAACCGCGATTATTCCCTTGTATTGAGCCTCACGATTTTGGTCGGCACACTGACTATCGTTTTTAACGCCGTAGTGGATATTTtat > 1:344427‑M2/24‑237 (MQ=255) atcttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGCGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTc > 1:389368‑M2/24‑88 (MQ=255) cttaaagcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAAc > 1:593103‑M2/22‑101 (MQ=255) gcacgcgctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAACCGTATTCGGc > 1:744819‑M2/16‑105 (MQ=255) ctgcgcccCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAACCGTATTCGGCTTACCGGGCATGGGCAAACTTTTCGTTAACGGCGCGCTTAACCGCGATTATTCCCTTGTATTGAGCCTCACGATTTTGGTCGGCACACTGACTATCGTTTTTAACGCCGTAGTGGATATTTTATACGCCGTGATTGATCCGAAAATTCGttat > 1:379224‑M2/9‑251 (MQ=255) | CCTTTACTGGTGCTGTTGTTTGCGATAACTCTGGGCTGGCTGCCGGCAGGCGGTTGGAATGAGGGGGCTTTGAGTTACATTCTGTTGCCGGTGGCATCCTTAACCATCGGATATGTGGCGGGCATTGCGCGGATTATGCGCGGTTCTATGATTGAAGTG‑TTGCACTCCAATTTTATTCGTACCGCCAAGGCAAAAGGCTTGTCCACCTCTCGCATTATCTTAAAGCACGCGCTGCGCCCCGCCCTGTTGCCGGTGATTACCTATTTAGGGCCGGCATTTGTGGGCATTATTACCGGTTCCATGGTGATCGAAACCGTATTCGGCTTACCGGGCATGGGCAAACTTTTCGTTAACGGCGCGCTTAACCGCGATTATTCCCTTGTATTGAGCCTCACGATTTTGGTCGGCACACTGACTATCGTTTTTAACGCCGTAGTGGATATTTTATACGCCGTGATTGATCCGAAAATTCGTTAT > 1/2033217‑2033693 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |