| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 1,940,768 | +ATT | coding (180/339 nt) | unknown ← | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1940764 | 0 (0.000) | 77 (0.890) +TAT |
64/416 | 0.1 | 100% | coding (184/339 nt) | unknown | hypothetical protein |
| ? | 1 | 1940765 = | 0 (0.000) | coding (183/339 nt) | unknown | hypothetical protein | |||||
ATACAAAAATGCAGAATTCAGACAAGCTCGGTAAAACGGGCTTTTTTTAACCCTTGAATTTACAATCCAAGTGCCTCTCTGCTTACCTCACTATCTCCCCTCTTTCGGGAACACCACCGTCAAGAACATTTTGAAATTCTCCAAGGCATACAAAGCATGGGGAATGTCCGCAGGCAGCACGATACTTTCGCCGGCATTGACTTCGTAGTCGGTTGTGTCGATAGTGATTCTGGCTTTGCCTTCCAATATTGTCACCAAAGCATCACCACGGGATTTATGGGCGCTGATTTCCTCGCCTTTCGGCAGACAAAACATGGTTAAGCCCACGGCAGGGTTTTGTGAAAATGTTTTGCTGATAACTTGTCCGTCTTGATATGCCAGAAGATCATTCAATTTAAGAACGGTGGCTTTTTCAATGTTTTTTAACATATTTTTGCTCCTTTTAAATCGTCAAATCAAACTGCTTGTCGCTCAATAAATAGGCGACAAGCCG > 1/1940519‑1941011 | caaaaatgcagaattcagacaagctcggtaaaacgggctttttttaacccttgaatttacaatccaagtgcctctctgcttacctcactatctcccctctttcgggaacaccaccgtcaagaacattttgaaattctccaaggcatacaaagcatggggaatgtccgcaggcagcacgatactttcgccggcattgacttcgtagtcggttgtgtcgatagtgattctggctttgccttccaatatTATTg < 1:814529‑M2/5‑1 (MQ=255) atgcagaattcagacaagctcggtaaaacgggctttttttaacccttgaatttacaatccaagtgcctctctgcttacctcactatctcccctctttcgggaacaccaccgtcaagaacattttgaaattctccaaggcatacaaagcatggggaatgtccgcaggcagcacgatactttcgccggcattgacttcgtagtcggttgtgtcgatagtgattctggctttgccttccaatatTATTGTCAcc < 1:171‑M2/10‑1 (MQ=255) gaattcagacaagctcggtaaaacgggctttttttaacccttgaatttacaatccaagtgcctctctgcttacctcactatctcccctctttcgggaacaccaccgtcaagaacattttgaaattctccaaggcatacaaagcatggggaatgtccgcaggcagcacgatactttcgccggcattgacttcgtagtcggttgtgtcgatagtgattctggctttgccttccaatatTATTGTCACCAAAg > 1:327763‑M2/237‑250 (MQ=255) attcagacaagctcggtaaaacgggctttttttaacccttgaatttacaatccaagtgcctctctgcttacctcactatctcccctctttcgggaacaccaccgtcaagaacattttgaaattctccaaggcatacaaagcatggggaacgtccgcaggcagcacgatactttcgccggcattgacttcgtagtcggttgtgtcgatagtgattctggctttgccttccaatatTATTGTCACCAAAGc < 1:229821‑M2/15‑1 (MQ=255) cagacaagctcggtaaaacgggctttttttaacccttgaatttacaatccaagtgcctctctgcttacctcactatctcccctctttcgggaacaccaccgtcaagaacattttgaaattctccaaggcatacaaagcatggggaatgtccgcaggcagcacgatactttcgccggcattgacttcgtagtcggttgtgtcgatagtgattctggctttgccttccaatatTATTGTCACCAAAGCATca > 1:682139‑M2/232‑250 (MQ=255) acaagctcggtaaaacgggctttttttaccccttgaatttacaatccaagtgcctctctgcttacctcactatctcccctctttcgggaacaccaccgtcaagaacattttgaaattctccaaggcatacaaagcatggggaatgtccgcaggcagcacgatactttcgccggcattgacttcgtagtcggttgtgtcgatagtgattctggctttgccttccaatatTATTGTCACCAAAGCATcac < 1:549960‑M2/20‑1 (MQ=255) cggtaaaacgggctttttttaacccttgaatttacaatccaagtgcctctctgcttacctcactatctcccctctttcgggaacaccaccgtcaagaacattttgaaattctccaaggcatacaaagcatggggaatgtccgcaggcagcacgatactttcgccggcattgacttcgtagtcggttgtgtcgatagtgattctggctttgccttccaatatTATTGTCACCAAAGCATCACCACGGGAttt > 1:369085‑M2/222‑251 (MQ=255) 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1:86980‑M2/35‑236 (MQ=255) tgtcgatagtgattctggctttgccttccaatatTATTGTCACCAAAGCATCACCACGGGATTTATGGGCGCTGATTTCCTCGCCTTTCGGCAGACAAAACATGGTTAAGCCCACGGCAGGGTTTTGTGAAAATGTTTTGCTGATAACTTGTCCGTCTTGATATGCCAGAAGATCATTCAATTTAAGAACGGTGGCTTTTTCAATGTTTTTTAACATATTTTTGCTCCTTTTAAATCGtcaaatcaaa > 1:834929‑M2/35‑248 (MQ=255) atagtgattctggctttgccttccaatatTATTGTCACCAAAGCATCACCACGGGATTTATGGGCGCTGATTTCCTCGCCTTTCGGCAGACAAAACATGGTTAAGCCCACGGCAGGGTTTTGTGAAAATGTTTTGCTGATAACTTGTCCGTCTTGATATGCCAGAAGAt < 1:885375‑M2/140‑1 (MQ=255) atagtgattctggctttgccttccaatatTATTGTCACCAAAGCATCACCACGGGATTTATGGGCGCTGATTTCCTCGCCTTTCGGCAGACAAAACATGGTTAAGCCCACGGCAGGGTTTTGTGAAAATGTTTTGCTGATAACTTGTCCGTCTTGATATGCCAGAAGATCATTCAATTTAAGAACGGTGGCTTTTTCAATGTTTTTTAACATATTTTTGCTc > 1:890521‑M2/30‑222 (MQ=255) tgattctggctttgccttccaatatTATTGTCACCAAAGCATCACCACGGGATTTATGGGCGCTGATTTCCTCGCCTTTCGGCAGACAAAACATGGTTAAGCCCACGGCAGGGTTTTGTGAAAATGTTTTGCTGATAACTTGTCCGTCTTGATATGCCAGAAGATCATTCAATTTAAGAACGGTGGCTTTTTCAATGt < 1:21798‑M2/173‑1 (MQ=255) 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atatTATTGTCACCAAAGCATCACCACGGGATTTATGGGCGCTGATTTCCTCGCCTTTCGGCAGACAAAACATGGTTAAGCCCACGGCAGGGTTTTGTGAAAATGTTTTGCTGATAACTTGTCCGTCTTGATATGCCAGAAGATCATTCAATTTAAGAACGGTGGCTTTTTCAATGTTTTTTAACATATTTTTGCTCCTTTTAAATCGTCAAATCAAACTGCTTGTCGCTCAATAAATAGGCGACAAGCCg > 1:45031‑M2/5‑251 (MQ=255) atatTATTGTCACCAAAGCATCACCACGGGATTTATGGGCGCTGATTTCCTCGCCTTTCGGCAGACAAAACATGGTTAAGCCCACGGCAGGGTTTTGTGAAAATGTTTTGCTGATAACTTGTCCGTCTTGATATGCCAGAAGATCATTCAATTTAAGAACGGTGGCTTTTTCAATGTTTTTTAACATATTTTTGCTCCTTTTAAATCGTCAAATCAAACTGCTTGTCGCTCAATAAATAGGCGACAAGCCg > 1:242343‑M2/5‑251 (MQ=255) | ATACAAAAATGCAGAATTCAGACAAGCTCGGTAAAACGGGCTTTTTTTAACCCTTGAATTTACAATCCAAGTGCCTCTCTGCTTACCTCACTATCTCCCCTCTTTCGGGAACACCACCGTCAAGAACATTTTGAAATTCTCCAAGGCATACAAAGCATGGGGAATGTCCGCAGGCAGCACGATACTTTCGCCGGCATTGACTTCGTAGTCGGTTGTGTCGATAGTGATTCTGGCTTTGCCTTCCAATATTGTCACCAAAGCATCACCACGGGATTTATGGGCGCTGATTTCCTCGCCTTTCGGCAGACAAAACATGGTTAAGCCCACGGCAGGGTTTTGTGAAAATGTTTTGCTGATAACTTGTCCGTCTTGATATGCCAGAAGATCATTCAATTTAAGAACGGTGGCTTTTTCAATGTTTTTTAACATATTTTTGCTCCTTTTAAATCGTCAAATCAAACTGCTTGTCGCTCAATAAATAGGCGACAAGCCG > 1/1940519‑1941011 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |