| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,436,155 | Δ10 bp | intergenic (+112/‑57) | unknown → / → unknown | Murein‑DD‑endopeptidase (EC 3.4.99.‑)/Chromosome partition protein MukF |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1436155 | 1436164 | 10 | 66 [0] | [0] 66 | unknown/unknown | Murein‑DD‑endopeptidase (EC 3.4.99.‑)/Chromosome partition protein MukF |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1436154 | 0 (0.000) | 66 (0.750) | 51/428 | 0.4 | 100% | intergenic (+111/‑67) | unknown/unknown | Murein‑DD‑endopeptidase (EC 3.4.99.‑)/Chromosome partition protein MukF |
| ? | 1 | 1436165 = | 0 (0.000) | intergenic (+122/‑56) | unknown/unknown | Murein‑DD‑endopeptidase (EC 3.4.99.‑)/Chromosome partition protein MukF | |||||
ATTGGAAAAATATGGTTGTACCGCGTTAAACAGCAAGGTGCTGCGAGACTTTGTGGATGATATGCAGTATGAAGAGGGCTATGATGAAGCCGGAATGGACGAATTAATCCGAAAAGTGGCGGGCTAGAAGGGATCTTGTGCCCCTTTTTTCGCCGATTTTTATAGAATCGTTATCTTGAAAAGAAAACCGTTATAAATTCTTCAAATTTTCACCGCACTTGCTATTTTCAAGCTGTTAGAACGATCAAAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATGCTTGAAACATCACAAACAATCCCCGAACTGGTTTCATGGGCGAAAGAACGCGAATTTTCGCTGAATTTACCCACCGATCGTCTGGCGTTTTTATTGGCAATTGCCATTTATAATAACGAACGTTTTGACGGTGAAATGATCGAATCGGATCTGGTGGACATTTTTCGCCACGTTTCCGGCGCCT > 1/1435917‑1436407 | ccaaaaataaattggaaaaatatggttgtaccgcgttaaacagcaaggtgctgcgagactttgtggatgatatgcagtatgaagagggctatgatgaagccggaatggacgaattaatccgaaaagtggcgggctagaagggatcttgtgccccttttttcgccgatttttatagaatcgttatcttgaaaagaaaaccgttataaattcttcaaattttcaccgcacttgctattttcaagctgttaAAt < 1:593525‑M2/3‑1 (MQ=255)ccaaaaataaattggaaaaatatggttgtaccgcgttaaacagcaaggtgctgcgagactttgtggatgatatgcagtatgaagagggctatgatgaagccggaatggacgaattaatccgaaaagtggcgggctagaagggatcttgtgccccttttttcgccgatttttatagaatcgttatcttgaaaagaaaaccgttataaattcttcaaattttcaccgcacttgctattttcaagctgttaAAt < 1:269542‑M2/3‑1 (MQ=255) aaaaataaattggaaaaatatggttgtaccgcgttaaacagcaaggtgctgcgagactttgtggatgatatgcagtatgaagagggctatgatgaagccggaatggacgaattaatccgaaaagtggcgggctagaagggatcttgtgccccttttttcgccgatttttatagaatcgttatcttgaaaagaaaaccgttataaattcttcaaattttcaccgcacttgctattttcaagctgttaAATcc < 1:164557‑M2/5‑1 (MQ=255) ttggaaaaatatggttgtaccgcgttaaacagcaaggtgctgcgagactttgtggatgatatgcagtatgaagagggctatgatgaagccggaatggacgaattaatccgaaaagtggcgggctagaagggatcttgtgccccttttttcgccgatttttatagaatcgttatcttgaaaagaaaaccgttataaattcttcaaattttcaccgcacttgctattttcaagctgttaAATCCTGTATAATc < 1:483043‑M2/14‑1 (MQ=255) 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1:768851‑M2/122‑1 (MQ=255) aagtggcgggctagaagggatcttgtgccccttttttcgccgatttttatagaatcgttatcttgaaaagaaaaccgttataaattcttcaaattttcaccgcacttgctattttcaagctgttaAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATtgtg < 1:750924‑M2/46‑1 (MQ=255) ggctagaagggatcttgtgccccttttttcgccgatttttatagaatcgttatcttgaaaagaaaaccgttataaattcttcaaattttcaccgcacttgctattttcaagctgttaAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTga < 1:317887‑M2/47‑1 (MQ=255) ggctagaagggatcttgtgccccttttttcgccgatttttatagaatcgttatcttgaaaagaaaaccgttataaattcttcaaattttcaccgcacttgctattttcaagctgttaAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATGCTTGAAACATCACAAACAATCCCCGAACTGGTTTCATGGGCGAAAGAACGCGAATTTTCGCTGAATTTACCCAc > 1:735340‑M2/118‑250 (MQ=255) ggctagaagggatcttgtgccccttttttcgccgatttttatagaatcgttatcttgaaaagaaaaccgttataaattcttcaaattttcaccgcacttgctattttcaagctgttaAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATGCTTGAAACATCACAAACAATCCCCGAACTGGTTTCATGGGCGAAAGAACGCGAATTTTCGCTGAATTTACCCAc > 1:874139‑M2/118‑250 (MQ=255) 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ccgttataaattcttcaaattttcaccgcacttgctattttcaagctgttaAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATGCTTGAAACATCACAAACAATCCCCGAACTGGTTTCATGGGCGAAAGAACGCGAATTTTCGCTGAATTTACCCACCGAt > 1:358553‑M2/52‑188 (MQ=255) ccgttataaattcttcaaattttcaccgcacttgctattttcaagctgttaAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATGCTTGAAACATCACAAACAATCCCCGAACTGGTTTCATGGGCGAAAGAACGCGAATTTTCGCTGAATTTACCCACCGATCGTCTGGCGTTTTTATTGGCAATTGCCa > 1:186074‑M2/52‑216 (MQ=255) ccgttataaattcttcaaattttcaccgcacttgctattctcaagctgttaAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATg > 1:806405‑M2/52‑110 (MQ=255) gttataaattcttcaaattttcaccgcacttgctattttcaagctgttaAATcc < 1:223661‑M2/5‑1 (MQ=255) gttataaattcttcaaattttcaccgcacttgctattttcaagctgttaAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATGCTTGAAACATCACAAACAATCCCCGAACTGGTTTCATGGGCGAAAGAACGCGAATTTTCGCTGAATTTACCCACCGATCGTCTGGCGTTTTTATTGGCAATTGCCATTTAtaataa > 1:181625‑M2/50‑224 (MQ=255) gttataaattcttcaaattttcaccgcacttgctattttcaagctgttaAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATGCTTGAAACATCACAAACAATCCCCGAACTGGTTTCATGGGCGAAAGAACGCGAATTTTCGCTGAATTTACCCACCGATCGTCTGGCGTTTTTATTGGCAATTGCCATTTATAATAACGAACGTTTTGACGGTGAAATGATCGa > 1:641285‑M2/50‑251 (MQ=255) ttttcaccgcacttgctattttcaagctgttaAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATGCTTGAAACATCACAAACAATCCCCGAACTGGTTTCATGGGCGAAAGAACGCGaa > 1:263180‑M2/33‑145 (MQ=255) attttcaagctgttaAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATGCTTGAAACATCACAAACAATCCCCGAACTGGTTTCATGGGCGAAAGAACGCGAATTTTCGCTGAATTTACCCACCGATCGTCTGGCGTTTTTATTGGCAATTGCCATTTATAATAACGAACGTTTTGACGGTGAAATGATc > 1:844149‑M2/16‑215 (MQ=255) agctgttaAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATGCTTGAAACATCACAAACAATCCCCGAACTGGTTTCATGGGCGAAAGAACGCGAATTTTCGCTGAATTTACCCACCGATCGTCTGGCGTTTTTATTGGCAATTGCCATTTATAATAACGAACGTTTTGACGGTGAAATGATCGAATCGGATCTGGTGGACATTTTTCGccacttttcggattaat > 1:580160‑M2/9‑243 (MQ=255) ctgttaAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATGCTTGAAACATCACAAACAATCCCCGAACTGGTTTCATGGGCGAAAGAACGCGAATTTTCGCTGAATTTACCCACCGATCGTCTGGCGTTTTTATTGGCAATTGCCATTTATAATAACGAACGttt > 1:373060‑M2/7‑190 (MQ=255) gttaAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATGc > 1:619931‑M2/5‑64 (MQ=255) gttaAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATGCTTGAAACATCACAAACAATCCCCGAACTGGTTTCATGGGCGAAAGAACGCGAATTTTCGCTGAATTTACCCACCGATCGTCTGGCGTTTTTATTGGCAATTGCCATTTATAATAACGAACGTTTTGACGGTGAAATGATCGAATCGGATCTGGTGGACATTTTTCGCCACGTTTCCgg < 1:575384‑M2/238‑1 (MQ=255) | ATTGGAAAAATATGGTTGTACCGCGTTAAACAGCAAGGTGCTGCGAGACTTTGTGGATGATATGCAGTATGAAGAGGGCTATGATGAAGCCGGAATGGACGAATTAATCCGAAAAGTGGCGGGCTAGAAGGGATCTTGTGCCCCTTTTTTCGCCGATTTTTATAGAATCGTTATCTTGAAAAGAAAACCGTTATAAATTCTTCAAATTTTCACCGCACTTGCTATTTTCAAGCTGTTAGAACGATCAAAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATGCTTGAAACATCACAAACAATCCCCGAACTGGTTTCATGGGCGAAAGAACGCGAATTTTCGCTGAATTTACCCACCGATCGTCTGGCGTTTTTATTGGCAATTGCCATTTATAATAACGAACGTTTTGACGGTGAAATGATCGAATCGGATCTGGTGGACATTTTTCGCCACGTTTCCGGCGCCT > 1/1435917‑1436407 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |