| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | 1 | 1,388,736 | (CCCAACTTA)1→2 | coding (67/741 nt) | unknown → | Type III restriction‑modification system restriction subunit (EC 3.1.21.5) |
| New junction evidence | |||||||||||
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ATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTAAATCCTATGCCAAATTGCTGCGTAATCTTCCGCCTGAAACTTTACTTTGCGAAGACAAAAACCACAACGCTAAACCTGAAAATGCCAACAGCCAAAATCTGTTAATCCAAGGG > 1/1388474‑1388969 | tttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAAc < 1:697985‑M2/139‑1 (MQ=255) 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gtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgccttgccttgccttgccttgcctaaactaaacgttaattgcaagcaaaatctatcacttttcttaaaaatttattcggaggataaatgatctccgaagaacttttctctcgtgacggcgtttccgctaactctgcacaacttaccCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTaa > 1:170108‑M2/206‑251 (MQ=255) ctcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAacttacccaacttacccaacttaaagc < 1:275169‑M2/164‑14 (MQ=255) atattgtataaaacaaagtacactttgtacttgataaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTCATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAacttacccaacttacccaacttaaagc > 1:34500‑M2/67‑217 (MQ=255) 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gccttgccttgccttgcctaaactaaacgttaattgcaagcaaaatctatcacttttcttaaaaatttattcggaggataaatgatctccgaagaacttttctctcgtgacggcgtttccgctaactctgcacaacttaccCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGa > 1:358413‑M2/142‑251 (MQ=255) gccttgccttgccttgcctaaactaaacgttaattgcaagcaaaatctatcacttttcttaaaaatttattcggaggataaatgatctccgaagaacttttctctcgtgacggcgtttccgctaactctgcacaacttaccCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGa > 1:487610‑M2/142‑251 (MQ=255) gccttgcctaaactaaacgttaattgcaagcaaaatctatcacttttcttaaaaatttattcggaggataaatgatctccgaagaacttttctctcgtgacggcgtttccgctaactctgcacaacttaccCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCaa < 1:125632‑M2/75‑1 (MQ=255) 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1:895859‑M2/30‑1 (MQ=255) acgttaattgcaagcaaaatctatcacttttcttaaaaatttattcggaggataaatgatctccgaagaacttttctctcgtgacggcgtttccgctaactctgcacaacttaccCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTa < 1:29484‑M2/136‑1 (MQ=255) aattgcaagcaaaatctatcacttttcttaaaaatttattcggaggataaatgatctccgaagaacttttctctcgtgacggcgtttccgctaactctgcacaacttaccCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTAAATcc < 1:528694‑M2/141‑1 (MQ=255) aattgcaagcaaaatctatcacttttcttaaaaatttattcggaggataaatgatctccgaagaacttttctctcgtgacggcgtttccgctaactctgcacaacttaccCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTAAATcc < 1:243720‑M2/141‑1 (MQ=255) 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1:616888‑M2/18‑251 (MQ=255) ctgcacaacttaccCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTAAATCCTATGCCAAATTGCTGCGTAATCTTCCGCCTGAAACTTTACTTTGCGAAGACAAAAACCACAACGCTAAACCTGAAAATGCCAACAGCCAAAAt > 1:790374‑M2/15‑248 (MQ=255) caacttaccCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTAAATCCTATGCCAAATTGCTGCGTAATCTTCCGCCTGAAACTTTACTTTGCGAAGACAAAAACCACAACGCTAAAcc > 1:498397‑M2/10‑221 (MQ=255) acttaccCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTAAATCCTATGcc > 1:474764‑M2/8‑154 (MQ=255) cttaccCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTAAATCCTATGCCAAATTGCTGCGTAATCTTCCGCCTGAAACTTTACTTTGCGAAGACAAAAACCACAAc < 1:9033‑M2/204‑1 (MQ=255) ttaccCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTAAATcc > 1:213427‑M2/6‑146 (MQ=255) ccCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTAAATCCTATGCCAAATTGCTGCGTAATCTTCCGCCTGAAACTTTACTTTGCGAAGACAAAAACCACAACGCTAAACCTGAAAATGCCAACAGCCAAAATCTGTTAATCCAAggg < 1:237004‑M2/249‑1 (MQ=255) caACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTAAATCCTATGCCAAATTGCTGCGTAATCTTCCGCCTGAAACTTTACTTTGCGAAGACAAAAACCACAACGCTAAACCTGaaaa < 1:473940/218‑1 (MQ=255) | ATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTAAATCCTATGCCAAATTGCTGCGTAATCTTCCGCCTGAAACTTTACTTTGCGAAGACAAAAACCACAACGCTAAACCTGAAAATGCCAACAGCCAAAATCTGTTAATCCAAGGG > 1/1388474‑1388969 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |