| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 114,678 | (CAA)2→3 | coding (96/714 nt) | unknown → | Type IV fimbrial assembly, ATPase PilB |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | 1 | = 114672 | 0 (0.000) | 92 (1.060) +CAA |
67/412 | 0.1 | 100% | coding (90/714 nt) | unknown | Type IV fimbrial assembly, ATPase PilB |
| ? | 1 | 114673 = | 0 (0.000) | coding (91/714 nt) | unknown | Type IV fimbrial assembly, ATPase PilB | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
CGGCAAAGGCAGTTTGGATAAAATCAGCTACACCCTTACCGCTTCGGGCACGGCTGCCAGCGGGGTCAGCTGGAACGCCGCCTGCGGCAATAATGCCGACATTTTCCCGGCAGGTTTCTGTTCTTAATCACTAACGCAGCGGGGCAATGATCCATGCAAAATCCGATGGCGCAAGGTTATTTGATTCACAGCCAAAATCACGGGGACTTTACCATTGCGCCCGAGCTATGGCTTAAAAATCAGCAACAAACCGTCCTGTTGCGTTATCTCGCCCTGCCCTTAGCAGAAAACGGGCAGACCTTGTGGCTAGGGTTAGACTCGTTAACTAACCTGAGCGCCTGTGAAGCCTTTTCTTTTCTCACCGGCAAAACCATTGAGCCGGTATTAATTGAAAGCCAAACGCTAAAAACCGCATTGCAGGATTTATCCCCGCGCGTCGAAAAAGTCGAAGAAAATCAACCGCTCTTTTATTCCGCACTGTCACAGGAAC > 1/114430‑114919 | caaaggcagtttggataaaatcagctacacccttaccgcttcgggcacggctgccagcggggtcagctggaacgccgcctgcggcaataatgccgacattttcccggcaggtttctgttcttaatcactaacgcagcggggcaatgatccatgcaaaatccgatggcgcaaggttatttgattcacagccaaaatcacggggactttaccattgcgcccgagctatggcttaaaaatcagcaaCAACAAAc < 1:728359‑M2/8‑1 (MQ=255) aaaggcagtttggataaaatcagctacacccttaccgcttcgggcacggctgccagcggggtcagctggaacgccgcctgcggcaataatgccgacattttcccggcaggtttctgttcttaatcactaacgcagcggggcaatgatccatgcaaaatccgatggcgcaaggttatttgattcacagccaaaatcacggggactttaccattgcgcccgagctatggcttaaaaatcagcaaCAACAAAcc < 1:887377‑M2/9‑1 (MQ=255) cagtttggataaaatcagctacacccttaccgcttcgggcacggctgccagcggggtcagctggaacgccgcctgcggcaataatgccgacattttcccggcaggtttctgttcttaatcactaacgcagcggggcaatgatccatgcaaaatccgatggcgcaaggttatttgattcacagccaaaatcacggggactttaccattgcgcccgagctatggcttaaaaatcagcaaCAACAAACCGTcc < 1:646195‑M2/13‑1 (MQ=255) gtttggataaaatcagctacacccttaccgcttcgggcacggctgccagcggggtcagctggaacgccgcctgcggcaataatgccgacattttcccggcaggtttctgttcttaatcactaacgcagcggggcaatgatccatgcaaaatccgatggcgcaaggttatttgattcacagccaaaatcacggggactttaccattgcgcccgagctatggcttaaaaatcagcaaCAACAAACCGTc > 1:154883‑M2/236‑247 (MQ=255) 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1:518098‑M2/57‑1 (MQ=255) atgcaaaatccgatggcgcaaggttatttgattcacagccaaaatcacggggactttaccattgcgcccgagctatggcttaaaaatcagcaaCAACAAACCGTCCTGTTGCGTTATCTCGCCCTGCCCTTAGCAGAAAACGGGCAGACCTTGTGGCTAGGGTTAGACTCGTTAACTAACCTGAGCGCCTGTGAAGCCTTTTCTTTTCTCACCGGCAAAACCATTGAGCCGGTATTAATTg < 1:129858‑M2/148‑1 (MQ=255) gcaaaatccgatggcgcaaggttatttgattcacagccaaaatcacggggactttaccattgcgcccgagctatggcttaaaaatcagcaaCAACAAACCGTCCTGTTGCGTTATCTCGCCCTGCCCTTAGCAGAAAACGGGCAGACCTTGTGGCTAGGGTTAGACTCGTTAACTAACCTGAGCGCCTGTGAAGCCTTTTCTTTTCTCACCGGCAAAACCATTGAGCCGGTATTAATTGAAAGCCAAACg > 1:845704‑M2/92‑250 (MQ=255) atccgatggcgcaaggttatttgattcacagccaaaatcacggggactttaccattgcgcccgagctatggcttaaaaatcagcaaCAACAAACCGTCCTGTTGCGTTATCTCGCCCTGCCCTTAGCAGAAAACGGGCAGACCTTGTGGCTAGGGTTAGACTCGTTAACTAACCTGAGCGCCTGTGAAGCCTTTTCTTTTCTCACCGGCAAAACCATTGAGCCGGTATTAAtt < 1:869651‑M2/147‑1 (MQ=255) gcgcaaggttatttgattcacagccaaaatcacggggactttaccattgcgcccgagctatggcttaaaaatcagcaaCAACAAACCGTCCTGTTGCGTTATCTCGCCCTGCCCTTAGc < 1:762844‑M2/41‑1 (MQ=255) 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ctttaccattgcgcccgagctatggcttaaaaatcagcaaCAACAAACCGTCCTGTTGCGTTATCTCGCCCTGCCCTTAGCAGAAAACGGGCAGACCTTGTGGCTAGGGTTAGACTCGTTAACTAACCTGAGCGCCTGTGAAGCCTTTTCTTTTCTCACCGGCAAAACCATTGAGCCGGTATTAATTGAAAGCCAAACGCTAAAAACCGCATTGCAGGATTTATCCCCGCGCGTCGAAAAAGTCGAAGaaa > 1:763188‑M2/41‑251 (MQ=255) ttaccattgcgcccgagctatggcttaaaaatcagcaaCAACAAACCGTCCTGTTGCGTTATCTCGCCCTGCCCTTAGc > 1:680002‑M2/39‑79 (MQ=255) ttaccattgcgcccgagctatggcttaaaaatcagcaaCAACAAACCGTCCTGTTGCGTTATCTCGCCCTGCCCTTAGCAGAAAACGGGCAGACCTTGTGGCTAGGGTTAGACTCGTTAACTAACCTg < 1:27625‑M2/90‑1 (MQ=255) ttaccattgcgcccgagctatggcttaaaaatcagcaaCAACAAACCGTCCTGTTGCGTTATCTCGCCCTGCCCTTAGCAGAAAACGGGCAGACCTTGTGGCTAGGGTTAGACTCGTTAACTAACCTGAgc < 1:377042‑M2/93‑1 (MQ=255) ttaccattgcgcccgagctatggcttaaaaatcagcaaCAACAAACCGTCCTGTTGCGTTATCTCGCCCTGCCCTTAGCAGAAAACGGGCAGACCTTGTGGCTAGGGTTAGACTCGTTAACTAACCTGAGCGCCTGTGAAGCCTTTTCTTTTCTCACCGGCAAAACCATTGAGCCGGTATTAAtt < 1:319512‑M2/147‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |