| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,450,874 | 737 bp→TACGTGCTTGAATTTATGCTTACAT | unknown | unknown | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1450874 | 1451610 | 737 | 36 [1] | [0] 28 | unknown | unknown |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1450873 | 1 (0.010) | 27 (0.350) +TACGTGCTTGAATTTATGCTTACAT |
19/380 | 2.5 | 98.4% | intergenic (+33/‑216) | unknown/unknown | hypothetical protein/FIG00698722: hypothetical protein |
| ? | 1 | 1451611 = | 0 (0.000) | intergenic (+49/‑619) | unknown/unknown | FIG00698722: hypothetical protein/Bacterial non‑heme ferritin (EC 1.16.3.2) | |||||
TTTTTAACGGGTAAATCCAAAAATGATACTAGGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTA‑TTTTCCGCTTGC‑GG‑AAAATGCAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACAATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGCGCTTAAATTTAAGCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCTTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGAAACGCGCCTTTAATTTATGCTTACATTTCATCAATCACGTCTAACTCTGTGTTTTCATTAAATCGTAGTGTTCATTTACTTTGTCACTAATTTCGCATAATGATTTTTCGGATTATGTTACAATTCGCAGCGCGGTATAATCGCGCAGGACCGCGCAAGAATTTATACATAATCCGTGATTATGCGAATTTAACTTATTGATATTAATAATTATTATGAGCGATTTAACAATAAAATATATAACGCCAA > 1/1450626‑1451122 | gtttgatagttttttaacgaaattGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCA‑AAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGTACCTAAATTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGat > 1:297496/24‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |