| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 666,333 | (16-bp)2→1 | coding (60‑75/1560 nt) | unknown → | Glucose‑6‑phosphate 1‑dehydrogenase (EC 1.1.1.49) |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 666316 | 666331 | 16 | 82 [0] | [0] 82 | unknown | Glucose‑6‑phosphate 1‑dehydrogenase (EC 1.1.1.49) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 666332 = | 0 (0.000) | 76 (0.940) | 49/396 | 0.4 | 100% | coding (59/1560 nt) | unknown | Glucose‑6‑phosphate 1‑dehydrogenase (EC 1.1.1.49) |
| ? | 1 | = 666315 | 0 (0.000) | coding (42/1560 nt) | unknown | Glucose‑6‑phosphate 1‑dehydrogenase (EC 1.1.1.49) | |||||
ATGGGATACTGCCGCTTCCGAGATTTTACTGGCGGAAATGGGTGGCATTATTTTTGACTTGAATTATCAACCGCTGACTTATAATAAACGGGAATCTTTCGTCAATCCGAATTTTGTCATGGGAATCACGCAGGATTTTCCGTGGGATAAAATCTTTCACTCCAATTAATTAGAGTAATTGGAAATCCGGAATGATTTTACCTATTATACGAAGCAGTTATTTAAACAATGACATCAACATGGTAACAAATCAACATGGTAACAAAATGAAAGCAGAAAACTGTTGTATTGTAATTTTCGGCGCCTCCGGCGATCTCACTTATCGTAAACTTATTCCGGCTTTATATAGCCTCTATAAAATTGATCGACTGGGTGAAGATTTCTCCGTTCTCGGCGTGGCACGTACCGAACTGAATGACAAATCATTCCGTGAGAAAATGCGCCAAACGCTGATCAAAAATGAAGGCGCGAAAGGCGAGTGCTTGGAGCAATTTTGCAG > 1/666083‑666581 | tgggttgcatcggtgaatgggatactgccgcttccgagattttactggcggaaatgggtggcattatttttgacttgaattatcaaccgctgacttataataaacgggaatctttcgtcaatccgaattttgtcatgggaatcacgcaggattttccgtgggataaaatttttcactccaattaattagagtaattggaaatccggaatgattttacctattatacgaagcagttatttaaacaatgacAt > 1:179846‑M1/250‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |