| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 591642 = | 0 (0.000) | 82 (0.930) | 58/430 | 0.3 | 98.8% | intergenic (‑8/‑107) | unknown/unknown | UPF0758 protein YicR/hypothetical protein |
| ? | 1 | 1505053 = | 2 (0.020) | coding (492/966 nt) | unknown | Outer membrane receptor for lactoferrin or transferrin, TonB‑dependent protein A | |||||
CTTTATTAATGGTGCCGAGAAACAGGCGTTCCTGCTTAATCAGGCGATGTTGGTTATCCAGAAAAAGCACCATAAAAATTTCCCGCTCGATATTTGCCAGCTCCGTCTGTAAGTACATTTTCACAATGTCGGTTGAAGTAAAACAGTGGGTCTCTTTTAATTCTGCAAACAAATAACGGCGGGTCATTTCAGTACAGGCTTGCAGCTGAATAAACTGCGTAACGCCAATGCCTTTCACAGCGCAATGTAACCAACCACTTAATATTAGAAATTGATAACAGGTTAGGACTTAAGTTGAATTAAACGGAATTAAGCGGGACAGAATCAATGAAATAAAGGGCTGAAAGAAATTTTGGCCCTTTTTTATTGGGTGGTTTTGTCGTTAAAGTTAGTTTTAGAAAAAAAGTGGCTAAAATCTAAAAAGGGCGGTTTTAGCCACTTAATTGTAGAAAAACAAAAAGGCGTTTAAAAAACGTTTAAAGACCGTTTAAATT > 1/591397‑591890 | aaaactgggggttacagactaagaacgcctatgccagtaaaaatcgtgcttccacacattccattgcaatagcgggaaaaaacgatgggtttgagggtctattcatctacacggatcgtcgaggcaaagaagcacaaattcatcgtgatgcacgcaggggaagacagcgttattcccgccaggttgccgtaccgggtacgggcggtacatataactattttcttttgcaagaggattgtccgtccTGTaac > 1:696615‑M1/246‑251 (MQ=255) 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1:112326‑M1/19‑210 (MQ=255) aggattgtccgtccTGTAACCAACCACTTAATATTAGAAATTGATAACAGGTTAGGACTTAAGTTGAATTAAACGGAATTAAGCGGGGCAGAATCAATGAAATAAAGGGCTGAAAGAAGTTTTGGCCCTTTTTTATTGGGTGGTTTTGTCGTTAAAGTTAGTTTTAGAAAAAAAGTGGCTAAAATCTaaaa > 1:537664‑M1/15‑191 (MQ=255) aggattgtccgtccTGTAACCAACCACTTAATATTAGAAATTGATAACAGGTTAGGACT‑AAGTTGAATTAAACGGAATTAAGCGGGGCAGAATCAATGAAATAAAGGGCTGAAAGAAGTTTTGGCCCTTTTTTATTGGGTGGTTTTGTCGTTAAAGTTAGTTTTAGAAAAAAAGTGGCTAAAATCTAAAAAGGGCGGTTTTAGCCACTTAATTGTAGAAAAACAAAAAGGCGTTTAAAAAACGTTTAAAg < 1:226944‑M1/236‑1 (MQ=255) tgtccgtccTGTAACCAACCACTTAATATTAGAAATTGATAACAGGTTAGGACTTAAGTTGAATTAAACGGAATTAAGCGGGGCAGAATCAATGAAATAAAGGGCTGAAAGAAGTTTTGGCCCTTTTTTATTGGGTGGTTTTGTCGTTAAAGTTAGTTTTAGAAAAAAAGTGGCTAAAATCTAAAAAGGGCGGTTTTAGCCACTTAATTGTAGAAAAACAAAAAGGCGTTTAAAAAACGTTTAAAGCCCGt < 1:369513‑M1/242‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |