| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 476658 | 2 (0.020) | 15 (0.180) +TAATTAGCAGA |
16/400 | 3.1 | 88.7% | intergenic (‑98/‑87) | unknown/unknown | Fructose‑1,6‑bisphosphatase, GlpX type (EC 3.1.3.11)/Cell division protein ZapB |
| ? | 1 | 476659 = | 2 (0.020) | intergenic (‑99/‑86) | unknown/unknown | Fructose‑1,6‑bisphosphatase, GlpX type (EC 3.1.3.11)/Cell division protein ZapB | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
GAATTAAGTTCAGCATATAACGCATGGCTTTCACCGCCGCATCATCCGCTGCATTTTTATCCCCGCGCCCCAACCAGGCAAAACCGGCTAACGCGGCAACTTCCGTAACTCTTGAAAATTCAATGGCTAATGCTCTGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTTATGTCACTAGAAATTCTAGACCAGTTAGAAAACAAGATTAAACAAGCTGTCGAAACCATTCAGTTGCTTCAATTGGAAGTGGATGAATTAAGA > 1/476419‑476837 | gAATTAAGTTCAGCATATAACGCATGGCTTTCACCGCCGCATCATCCGCTGCATTTTTATCCCCGCGCCCCAACCAGGCAAAACCGGCTAACGCGGCAACTTCCGTAACTCTTGAAAATTCAATGGCTAATGCTCTGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAAtt > 1:241755/1‑244 (MQ=255) aaTTAAGTCCAGCATATACCGCATGGCTTTCACCGCCGCATCATCCGCTGCATTTTTATCCCCGCGCCCCAACCAGGCAAAACCGGCTAACGCGGCAACTTCCGTAACTCTTGAAAATTCAATGGCTAATGCTCTGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAAttagcagat < 1:736801/251‑9 (MQ=255) aTTAAGTTCAGCATATAACGCATGGCTTTCACCGCCGCATCATCCGCTGCATTTTTATCCCCGCGCCCCAACCAGGCAAAACCGGCTAACGCGGCAACTTCCGTAACTCTTGAAAATTCAATGGCTAATGCTCTGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAAttagcagata > 1:887733/1‑242 (MQ=255) gCATATAACGCATGGCTTTCACCGCCGCATCATCCGCTGCATTTTTATCCCCGCGCCCCAACCAGGCAAAACCGGCTAACGCGGCAACTTCCGTAACTCTTGAAAATTCAATGGCTAATGCTCTGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAAttagcagataatgcgattc > 1:71645/1‑232 (MQ=255) ccGCGCCCCAACCAGGCAAAACCGGCTAACGCGGCAACTTCCGTAACTCTTGAAAATTCAATGGCTAATGCTCTGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATc < 1:877230/251‑1 (MQ=255) cgcCCCAACCAGGCAAAACCGGCTAACGCGGCAACTTCCGTAACTCTTGAAAATTCAATGGCTAATGCTCTGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAAtt < 1:740075/180‑2 (MQ=255) cTTCCGTAACTCTTGAAAATTCAATGGCTAATGCTCTGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACtt > 1:214495/1‑238 (MQ=255) tCAATGGCTAATGCTCTGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTTATGTCACTAGAAATTCTAGACCAGTTAGAAAAc < 1:46596/251‑1 (MQ=255) tctGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTTATGTCACTAGAAATTCTAGACCAGTTAGAAAACAAGATTAAACAAGc < 1:744931/251‑1 (MQ=255) gTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATc < 1:372883/177‑1 (MQ=255) aTGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTTATGTCACTAGAAATTCTAGACCAGTTAGAAAACAAGATTAAACAAGCTGTCGAAAc > 1:562976/1‑250 (MQ=255) aaaTAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACtt < 1:356858/169‑1 (MQ=255) gTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTagag > 1:42195/1‑153 (MQ=255) gTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTTATGTCACTAGAAATTCTAGACCAGTTAGAAAACAAGATTAAACAAGCTGTCGAAACCATTCAg < 1:161273/226‑1 (MQ=255) ttttAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTTATGTCACTAGAAATTCTAGACCAGTTAGAAAACAAGATTAAACAAGCTGTCGAAACCATTCAGTTGCTTCAATTGGAAGTGGATGAATTAaga > 1:818324/1‑251 (MQ=255) | GAATTAAGTTCAGCATATAACGCATGGCTTTCACCGCCGCATCATCCGCTGCATTTTTATCCCCGCGCCCCAACCAGGCAAAACCGGCTAACGCGGCAACTTCCGTAACTCTTGAAAATTCAATGGCTAATGCTCTGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTTATGTCACTAGAAATTCTAGACCAGTTAGAAAACAAGATTAAACAAGCTGTCGAAACCATTCAGTTGCTTCAATTGGAAGTGGATGAATTAAGA > 1/476419‑476837 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |