| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | 1 | = 279703 | 0 (0.000) | 159 (2.200) | 53/352 | 0.2 | 100% | intergenic (‑152/+523) | unknown/unknown | Peptide deformylase (EC 3.5.1.88)/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | 279870 = | NA (NA) | intergenic (‑319/+356) | unknown/unknown | Peptide deformylase (EC 3.5.1.88)/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 305 total aligned reads displayed.
CAATAATCTTACGCGTGTTGTCATTGACTTCCACGACCGGATCGCAAACCACTTTAAGGTGCTCTTCCGGGTAAATAAGTACATTTAAAGCTGTCATAATTTCTCTTGAGATTTGAAATACGTGCGACATTGTAGCATCTTTTCAATGGAATTTCTACGCTATAAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTGCCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTT > 1/279455‑279950 | cAATAATCTTACGCGTGTTGTCATTGACTTCCACGACCGGATCGCAAACCACTTTAAGGTGCTCTTCCGGGTAAATAAGTACATTTAAAGCTGTCATAATTTCTCTTGAGATTTGAAATACGTGCGACATTGTAGCGTCTTTTCAATGGAATTTCTACGCTATAAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTac < 1:4818‑M1/251‑3 (MQ=255) ataatCTTACGCGTGTTGTCATTGACTTCCACGACCGGATCGCAAACCACTTTAAGGTGCTCTTCCGGGTAAATAAGTACATTTAAAGCTGTCATAATTTCTCTTGAGATTTGAAATACGTGCGACATTGTAGCGTCTTTTCAATGGAATTTCTACGCTATAAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTacca < 1:87644‑M1/251‑5 (MQ=255) cTTACGCGTGTTGTCATTGACTTCCACGACCGGATCGCAAACCACTTTAAGGTGCTCTTCCGGGTAAATAAGTACATTTAAAGCTGTCATAATTTCTCTTGAGATTTGAAATACGTGCGACATTGTAGCGTCTTTTCAATGGAATTTCTACGCTATAAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTaccatcggc < 1:818539‑M1/251‑10 (MQ=255) gACTTCCACGACCGGATCGCAAACCACTTTAAGGTGCTCTTCCGGGTAAATAAGTACATTTAAAGCTGTCATAATTTCTCTTGAGATTTGAAATACGTGCGACATTGTAGCGTCTTTTCAATGGAATTTCTACGCTATAAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTaccatcggc < 1:434800‑M1/233‑10 (MQ=255) 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ccACTTTAAGGTGCTCTTCCGGGTAAATAAGTACATTTAAAGCTGTCATAATTTCTCTTGAGATTTGAAATACGTGCGACATTGTAGCGTCTTTTCAATGGAATTTCTACGCTATAAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTaccatcggcattacggcctttcacttctgagttcggtatggtttcaggtg > 1:560125‑M1/1‑201 (MQ=255) ttAAGGTGCTCTTCCGGGTAAATAAGTACATTTAAAGCTGTCATAATTTCTCTTGAGATTTGAAATACGTGCGACATTGTAGCGTCTTTTCAATGGAATTTCTACGCTATAAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTaccatcggcattacggcctttcacttctgagttcggtatggtttcaggtggtac > 1:290121‑M1/1‑196 (MQ=255) ctTCCGGGTAAATAAGTACATTTAAAGCTGTCATAATTTCTCTTGAGATTTGAAATACGTGCGACATTGTAGCGTCTTTTCAATGGAATTTCTACGCTATAAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTaccatcggcattacggcctttcacttctgagttcggtatggtttcaggt < 1:735971‑M1/235‑50 (MQ=255) 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> 1:691663‑M1/1‑128 (MQ=255) aCATTGTAGCGTCTTTTCAATGGAATTTCTACGCTATAAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTaccatcggcattacggcctttcacttctgagttcggtatggtttcaggtggtaccaccgcactatcgccgccaatattctttgatgactatcctctctcctttccgcgctttcgctttcttattccg > 1:186377‑M1/1‑123 (MQ=255) tttCAATGGAATTTCTACGCTATAAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTaccatcggcattacggcctttcacttctgagttcggtatggtttcaggtggtaccaccgcactatcgccgccaatattctttgatgactatcctctctcctttccgcgctttcgctttcttattccgctcttcgcttctct > 1:304864‑M1/1‑109 (MQ=255) gAATTTCTACGCTATAAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTaccatcggcattacggcctttcacttctgagttcggtatggtttcaggtggtaccaccgcactatcgccgccaatattctttgatgactatc > 1:328465‑M1/1‑101 (MQ=255) gAATTTCTACGCTATAAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTaccatcggcat < 1:10635‑M1/112‑12 (MQ=255) 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ataAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTaccatcggcattacggcctttcacttctgagttcggtatggtttcaggtggtaccaccgcactatcgccgccaatattctttgatgactatcctctctcctttccgcgctttcgctttcttattccgctcttcgcttctctcgttctttcccttcttacttc > 1:633526‑M1/1‑88 (MQ=255) aaCAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTaccatcggcattacggcctttcacttctgagttcggtatggtttcaggtggtaccaccgcactatcgccgccaatattctttgatgactatcctctctcctttccgcgctttcgctttcttattccgctcttcgcttctctcgttctttcccttcttacttcctttcc < 1:806164‑M1/251‑169 (MQ=255) cAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTaccatcggcattacggcctttcacttctgagttcggtatggtttcaggtggtaccaccgcactatcgccgccaatattctttgatgactatcctctctcctttccgcgctttcgctttcttattccgctcttcgcttctctcgttctttcccttcttacttcctttc > 1:869206‑M1/1‑81 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |