| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | 1 | 957,814 | Δ1,865 bp | coding (1028‑2892/3072 nt) | unknown ← | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | 1 | 957814 | 959678 | 1865 | 102 [0] | [0] 102 | unknown | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | 1 | = 957813 | 0 (0.000) | 102 (1.170) | 64/424 | 0.2 | 100% | coding (2893/3072 nt) | unknown | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| ? | 1 | 959679 = | 0 (0.000) | coding (1027/3072 nt) | unknown | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GACCGCACTTTAAAGCGAAAGAAAAGGAGAAGCGAGGGCTTCTCCTTTTTGTTTGGTTAGAATTCAAGTTGCATTGAAAGTCTATAATTACGACCCGGTGCGTTGAAGCGGTTGATACCCAATCCACTCTTTTGGTCAATCAGATTACTTGTACCAAATGGGCGGATTGATCTCGCAGAATCCCAAGTAATATATTTTCTGTTTGTGAGATTATATACTCCGGCTCTTAAAGTTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/957578‑957813‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taaTTTTTTGTTGGGAATAGGTGATTTTCAATGTATCCCAAAGCGGTGTTGTTGTGAAGTTTTCATAGGTAAAGGCGAAATTTTTACGTTCTACTTTATCATTGGTGTGACGTAACTCTTCCTCGTCATAGGTTCTAAATTGAGTATTTGGCTTTAATGTGTAAGAAAAATCATGTCCTTTAGAGGTTTGCTTATATAAATCTGCCATAACGGAAAAGCGGTGGTTATCTGTTGGTTGAAATGCAAATT > 1/959679‑959924 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AGATTATATACTCCGGCTCTTAAAGTTAATTTTTTGTTGGGAATAGGTGATTTTCAATGTATCCCAAAGCGGTGTTGTTGTGAAGTTTTCATAGGTAAAGGCGAAATTTTTACGTTCTACTTTATCATTGGTGTGACGTAACTCTTCCTCGTCATAGGTTCTAAATTGAGTATTTGGCTTTAATGTGTAAGAAAAATCATGTCCTTTAGAGGTTTGCTTATATAAATCTGCCATAACGG < 1:583742/239‑1 AGATTATATACTCCGGCTCTTAAAGTTAATTTTTTGTTGGGAATAGGTGATTTTCAATGTATCCCAAAGCGGTGTTGTTGTGAAGTTTTCATAGGTAAAGGCGAAATTTTTACGTTCTACTT < 1:28904/122‑1 GATTATATACTCCGGCTCTTAAAGTTAATTTTTTGTTGGGAATAGGTGATTTTCAATGTATCCCAAAGCGGTGTTGTTGTGAAGTTTTCATAGGTAAAGGCGAAATTTTTACGTTCTACTTTATCATTGGTGTGACGTAACTCTTCCTCGTCATAGGTTCTAAATTGAGTATTTGGCTTTAATGTGTAAGAAAAATCATGTCCTTTAGAGGTTTGCTTATATAAATCTGCCATAACGGAGAAGCGGTGGTT > 1:722899/1‑251 GATTATATACTCCGGCTCTTAAAGTTAATTTTTTGTTGGGAATAGGTGATTTTCAATGTATCCCAAAGCGGTGTTGTTGTGAAGTTTTCATAGGTAAAGGCGAAATTTTTACGTTCTACTTTATCATTGGTGTGACGTAACTCTTCCTCGTCATAGGTTCTAAATTGAGTATTTGGCTTTAATGTGTAAGAAAAATCATGTCCTTTAGAGGTTTGCTTATATAAATCTGCCATAACGGAGAAGCGGTGGTT > 1:606306/1‑251 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< 1:469907/197‑1 TTAAAGTTAATTTTTTGTTGGGAATAGGTGATTTTCAATGTATCCCAAAGCGGTGTTGTTGTGAAGTTTTCATAGGTAAAGGCGAAATTTTTACGTTCTACTTTATCATTGGTGTGACGTAACTCTTCCTCGTCATAGGTTCTAAATTGAGTATTTGGCTTTAATGTGTAAGAAAAATCATGTCCTTTAGAGGTTTGCTTATATAAATCTGCCATAACGGAGAAGCGGTGGTTATCTGTTGGTTGAAATGC < 1:460616/251‑1 GTTAATTTTTTGTTGGGAATAGGTGATTTTCAATGTATCCCAAAGCGGTGTTGTTGTGAAGTTTTCATAGGTAAAGGCGAAATTTTTACGTTCTACTTTATCATTGGTGTGACGTAACTCTTCCTCGTCATAGGTTCTAAATTGAGTATTTGGCTTTAATGTGTAAGAAAAATCATGTCCTTTAGAGGTTTGCTTATATAAATCTGCCATAACGGAga < 1:110216/218‑3 TTAATTTTTTGTTGGGAATAGGTGATTTTCAATGTATCCCAAAGCGGAGTTGTTGTGAAGTTTTCATAGGTAAAGGCGAAATTTTTACGTTCTACTTTATCATTGGTGTGACGTAACTCTTCCTCGTCATAGGTTCTAAATTGAGTATTTGGCTTTAATGTGTAAGAAAAATCATGTCCTTTAGAGGTTTGCTTATATAAATCTGCCATAACGGAGAAGCGGTGGTTATCTGTTGGTTGAAATGCAAATT < 1:634867/250‑1 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|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |