| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 642663 | 5 (0.060) | 96 (1.100) | 62/426 | 0.2 | 97.5% | coding (387/396 nt) | unknown | cell filamentation‑like protein |
| ? | 1 | = 644770 | 0 (0.000) | intergenic (‑114/‑358) | unknown/unknown | cell filamentation‑like protein/hypothetical protein | |||||
ATTCAATTAACGGTAAATTTGATTTAAAGCACCTTCAAGCTATCCATAAAAAATTATTCGAAGATATTTATCCCTTTGCTGGAAAAATAAGAGATGGATATTTACAAAAAGGTGAACAAGATTTCACTATGGGCTATCGTATTATTCCGCAATCTGAAAGACTGTTTAAAGAACTCAAAAATGAGCAATTTTTGAAGAAAACAGAGTCTGATAAAATTGCGGGTAGATTAGCTTACTATATGGGGGAAATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/642413‑642663‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttAACGCTATACACCCTTTTAGAGAGGGGAACGGAAGAACACAACGAATCTTTATAGCTCAATTAGCAAAAGAGGCTGGCTACGAATTAAGTTTTGATAAAACAACTCAAGAAGAAATGACAAGTGCTTCAATTCAAGTTCATAGATGTGATTATAAAGGACTTGAGAATATTATCGAAAAAGGGCTAACTCCTCTATCTCTAAATTTAGAAAAAGAGTACAAAAT < 1/644770‑644547 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1:377210/180‑1 GTTTAAAGAACTCAAAAATGAGCAATTTTTGAAGAAAACAGAGTCTGATAAAATTGCGGGTAGATTAGCTTACTATATGGGAGAAATTAACGCTATACACCCTTTTAGAGAGGGGAACGGAAGAACACAACGAATCTTTATAGCTCAATTAGCAAAAGAGGCTGGCTACGAATTAAGTTTTGATAAAACAACTCAAGAAGAAATGACAAGTGCTTCAATTCAAGTTCATAGATGTGATTATAAAGGGCTTG > 1:552014/1‑251 GTTTAAAGAACTCAAAAATGAGCAATTTTTGAAGAAAACAGAGTCTGATAAAATTGCGGGTAGATTAGCTTACTATATGGGAGAAATTAACGCTATACACCCTTTTAGAGAGGGGAACGGAAGAACACAACGAATCTTTATAGCTCAATTAGCAAAAGAGGCTGGCTACGAATTAAGTTTTGATAAAACAACTCAAGAAGAAATGACAAGTGCTTCAATTCAAGTTCATAGATG > 1:399942/1‑234 TTTAAAGAACTCAAAAATGAGCAATTTTTGAAGAAAACAGAGTCTGATAAAATTGCGGGTAGATTAGCTTACTATATGGGAGAAATTAACGCTATACACCCTTTTAGAGAGGGGAACGGAAGAACACAACGAATCTTTATAGCTCAATTAGCAAAAGAGGCTGGCTACGAATTAAGTTTTGATAAAACAACTCAAGAAGAAATGACAAGTGCTTCAATTCAAGTTCATAGATGTGATTATAAAGGGCTTG < 1:538899/250‑1 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AAACAGAGTCTGATAAAATTGCGGGTAGATTAGCTTACTATATGGGAGAAATTAACGCTATACACCCTTTTAGAGAGGGGAACGGAAGAACACAACGAATCTTTATAGCTCAATTAGCAAAAGAGGCTGGCTACGAATTAAGTTTTGATAAAACAACTCAAGAAGAAATGACAAGTGCTTCAATTCAAGTTCATAGATGTGATTATAAAGGGCTTGAGAATATTATCGAAAAAGGGCTAACTCCTCTAT > 1:310604/1‑249 AAACAGAGTCTGATAAAATTGCGGGTAGATTAGCTTACTATATGGGAGAAATTAACGCTATACACCCTTTTAGAGAGGGGAACGGAAGAACACAACGAATCTTTATAGCTCAATTAGCAAAAGAGGCTGGCTACGAATTAAGTTTTGATAAAACAACTCAAGAAGAAATGACAAGTGCTTCAATTCAAGTTCATAGATGTGATTATAAAGGGCTTGAGAATATTATCGAAAAAGGGCTAACTCCTCT > 1:857203/1‑247 AACAGAGTCTGATAAAATTGCGGGTAGATTAGCTTACTATATGGGAGAAATTAACGCTATACACCCTTTTAGAGAGGGGAACGGAAGAACACAACGAATCTTTATAGCTCAATTAGCAAAAGAGGCTGGCTACGAATTAAGTTTTGATAAAACAACTCAAGAAGAAATGACAAGTGCTTCAATTCAAGTTCATAGATGTGATTATAAAGGGCTTGAG > 1:63241/1‑217 GAGTCTGATAAAATTGCGGGTAGATTAGCTTACTATATGGGAGAAATTAACGCTATACACCCTTTTAGAGAGGGGAACGGAAGAACACAACGAATCTTTATAGCTCAATTAGCAAAAGAGGCTGGCTACGAATTAAGTTTTGATAAAACAACTCAAGAAGAAATGACAAGTGCTTCAATTCAAGTTCATAGATGTGATTATAAAG < 1:507845/205‑1 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1/642413‑642663‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttAACGCTATACACCCTTTTAGAGAGGGGAACGGAAGAACACAACGAATCTTTATAGCTCAATTAGCAAAAGAGGCTGGCTACGAATTAAGTTTTGATAAAACAACTCAAGAAGAAATGACAAGTGCTTCAATTCAAGTTCATAGATGTGATTATAAAGGACTTGAGAATATTATCGAAAAAGGGCTAACTCCTCTATCTCTAAATTTAGAAAAAGAGTACAAAAT < 1/644770‑644547 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |