| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 552,236 | +T | intergenic (‑57/+177) | unknown ← / ← unknown | Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase (EC 3.1.4.46) periplasmic (secreted in GramPositives)/Glycerol‑3‑phosphate transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 552,235 | 1 | . | T | 100.0% | 272.4 / NA | 91 | intergenic (‑56/+178) | unknown/unknown | Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase (EC 3.1.4.46) periplasmic (secreted in GramPositives)/Glycerol‑3‑phosphate transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base T (45/46); total (45/46) | |||||||||||
TTGCTCCAAATAATCCGCGTGTTGGGCAAAGGCAAGGGCTTTTGCTTCCAGTGTATGCTCCGGTAAATAGCCGCTGGCGCCACGATGGGCAATAATAATTTTATCCATATCATAACCTTTGTGATAATTTGCGCTACAACCGGCTAAAACGGTTGCTGCAATTAAGCTAAGGGCTAACGTTTTAAGTTTCATAAGCATTTCTCCTTGAAAGTGCGGTTGATTTTAGGCTTGTTTTTTATATCCCTCCC‑TCCGTTTACGGAGGGAAGTGCCGAAGGGGATGTGGCCCCCTTACGTCGCTTCGCACCACCTTCCCCCGCAAGCAGGGGAAGGCAAGTTAATTTGGTAGGTTTAAGACTCCTGTAGTTGAATTTTAGTTACAAAAAAGGCGACCAAGCATGATCTGCCTGCCGCCTTTTTTACGCTAATTATTTGGTACCGTAAGTATCTCCTAATTTCGCTTTGTGTTTGCCTTCTTCAATCATCACGATGAAGA > 1/551988‑552480 | ttGCTCCAAATAATCCGCGTGTTGGGCAAAGGCAAGGGCTTTTGCTTCCAGTGTATGCTCCGGTAAATAGCCGCTGGCGCCACGATGGGCAATAATAATTTTATCCATATCATAACCTTTGTGATAATTTGCGCTACAACCGGCTAAAACGGTTGCTGCAATTAAGCTAAGGGCTAACGTTTTAAGTTTCATAAGCATTTCTCCTTGAAAGTGCGGTTGATTTTAGGCTTGTTTTTTATATccctccc‑ttc < 1:698149/251‑3 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |