| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,934,467 | +T | intergenic (‑80/‑119) | unknown ← / → unknown | UPF0265 protein YeeX/Phosphoserine aminotransferase (EC 2.6.1.52) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,934,463 | 1 | . | T | 100.0% | 257.6 / NA | 90 | intergenic (‑76/‑123) | unknown/unknown | UPF0265 protein YeeX/Phosphoserine aminotransferase (EC 2.6.1.52) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base T (50/40); total (50/40) | |||||||||||
GACATATCGTCACGAATGTACTGATCTAAGTTTTGTAACAACAATACGCGTTTCTGGTTATCACGGATTTTACGATTATTATCGTCCATATCGCGCAATAGTTTATTTTTTAAGCGATACATACGCACATACTCCAAAACATCCTGAAAAGATTTATTCACATTGTCCATCAATTTGCTCCCTTGTTATAAAAAATGAATGGCGATAATGTAGCCTTTTTTGTGAATTTCGTCAAAAAATTCGCAC‑TTTTACAGGGGATTATTTTTCTTTCCCGCAAATTAAAAAAATTTCCGTAAAAATCATTGATTAGAAAACGGCTAGGTGATAAAACGTAACCCTCTTTTTATTTATTTTAAGGAAATAATTATATGGCGAACGTATTTAATTTCAGTGCCGGTCCGGCGATGATGCCGCAAGCGGTGTTAGAACAGGCGCAACAAGAATTACTGAACTGGCAAGGGCAAGGCACTTCGGTGATGGAAGTTAGCC > 1/1934218‑1934706 | gACATATCGTCACGAATGTACTGATCTAAGTTTTGTAACAACAATACGCGTTTCTGGTTATCACGGATTTTACGATTATTATCGTCCATATCGCGCAATAGTTTATTTTTTAAGCGATACATACGCACATACTCCGAAACATCCTGAAAAGATTTATTCACATTGTCCATCAATTTGCTCCCTTGTTATAAAAAATGAATGGCGATAATGTAGCCTTTTTTGTGAATTTCGTCAAAAAATTCGCAC‑ttttt > 1:352539/1‑250 (MQ=255) 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GACATATCGTCACGAATGTACTGATCTAAGTTTTGTAACAACAATACGCGTTTCTGGTTATCACGGATTTTACGATTATTATCGTCCATATCGCGCAATAGTTTATTTTTTAAGCGATACATACGCACATACTCCAAAACATCCTGAAAAGATTTATTCACATTGTCCATCAATTTGCTCCCTTGTTATAAAAAATGAATGGCGATAATGTAGCCTTTTTTGTGAATTTCGTCAAAAAATTCGCAC‑TTTTACAGGGGATTATTTTTCTTTCCCGCAAATTAAAAAAATTTCCGTAAAAATCATTGATTAGAAAACGGCTAGGTGATAAAACGTAACCCTCTTTTTATTTATTTTAAGGAAATAATTATATGGCGAACGTATTTAATTTCAGTGCCGGTCCGGCGATGATGCCGCAAGCGGTGTTAGAACAGGCGCAACAAGAATTACTGAACTGGCAAGGGCAAGGCACTTCGGTGATGGAAGTTAGCC > 1/1934218‑1934706 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |