| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,496,917 | +T | coding (751/753 nt) | unknown → | Indole‑3‑glycerol phosphate synthase (EC 4.1.1.48) / Phosphoribosylanthranilate isomerase (EC 5.3.1.24) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,496,913 | 1 | . | T | 100.0% | 209.3 / NA | 72 | G249G (GGC→GGT) | unknown | Indole‑3‑glycerol phosphate synthase (EC 4.1.1.48) / Phosphoribosylanthranilate isomerase (EC 5.3.1.24) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base T (45/27); total (45/27) | |||||||||||
CCCATTCCCTCGGCATGGGCGTGCTGACCGAAACCAGCAACGAGGAAGAATTTGAACGCGCCTTGGCGTTAGGCGCAAAAATTATCGGCGTGAACAATCGTAACCTGCATGATTTAACGGTAGATTTAAATCGCGTGGTGGAACTCACCGCCAAATATGCGGATAAAATCCCTGAGGATGTGCGAATCATCAGCGAATCGGGCATCTATAATCATCAACAAGTGCGTGAATTACAACACGTTGCCCATGGC‑TTTTAATCGGCAGCAGCTTAATGGGCAGCGCGGATTTAAATAACACCGTGCGCGAAGTGATTTTCGGTGAAAACAAAGTGTGTGGCTTAACCCGTGCGCAGGATGTGAAAACTGCTTACGACAACGGCGCTTTATACGGTGGGCTAATTTTCGCCGAACAGTCTAAACGCTGCGTCAGTTTACGTCAGGCGCAGGAATTGGTGACCGCCGCCCCACTGCGTTTTGTGGGCGTG > 1/1496663‑1497146 | cccATTCCCTCGGCATGGGCGTGCTGACCGAAACCAGCAACGAGGAAGAATTTGAACGCGCCTTGGCGTTAGGCGCAAAAATTATCGGCGTGAACAATCGTAACCTGCATGATTTAACGGTAGATTTAAATCGCGTGGTGGAACTCACCGCCAAATATGCGGATAAAATCCCTGAGGATGTGCGAATCATCAGCGAATCGGGCATCTATAATCATCAACAAGTGCGTGAATTACAACACGTTGCCCATGGc < 1:750619/251‑1 (MQ=255) 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1:324179/249‑1 (MQ=255) cATCTATAATCATCAACAAGTGCGTGAATTACAACACGTTGCCCATGGCTTTTTAATCGGCAGCAGCTTAATGGGCAGCGCGGATTTAAATAACACCGTGCGCGAAGTGATTTTCGGTGAAAACAAAGTGTGTGGCTTAACCCGTGCGCAGGATGTGAAAACTGCTTACGACAACGGCGCTTTATAc > 1:59920/1‑187 (MQ=255) cTATAATCATCAACAAGTGCGTGAATTACAACACGTTGCCCATGGCTTTTTAATCGGCAGCAGCTTAATGGGCAGCGCGGATTTAAATAACACCGTGCGCGAAGTGATTTTCGGTGAAAACAAAGTGTGTGGCTTAACCCGTGCGCAGGATGTGaaa < 1:184544/157‑1 (MQ=255) cTATAATCATCAACAAGTGCGTGAATTACAACACGTTGCCCATGGCTTTTTAATCGGCAGCAGCTTAATGGGCAGCGCGGATTTAAATAACACCGTGCGCGAAGTGATTTTCGGTGAAAACAAAGTGTGTGGCTTAACCCGTGCGCAGGATGTGAAAACTGCTTACGACAACGGCGCTTTATACGGTGGGCTAATTTTCGCCGAACAGTCTAAACGCTGCGTCAGTTTACGTCAGGCGCAGGAATTGGTGa > 1:489632/1‑251 (MQ=255) ataATCATCAACAAGTGCGTGAATTACAACACGTTGCCCATGGCTTTTTAATCGGCAGCAGCTTAATGGGCAGCGCGGATTTAAATAACACCGTGCGCGAAGTGATTTTCGGTGAAAACAAAGTGTGTGGCTTAACCCGTGCGCAGGATGTGAAAACTGCTTACGACAACGGCGCTTTATACGGTGGGCTAATTTTCGCCGAACAGTCTAAAc < 1:387199/213‑1 (MQ=255) 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CCCATTCCCTCGGCATGGGCGTGCTGACCGAAACCAGCAACGAGGAAGAATTTGAACGCGCCTTGGCGTTAGGCGCAAAAATTATCGGCGTGAACAATCGTAACCTGCATGATTTAACGGTAGATTTAAATCGCGTGGTGGAACTCACCGCCAAATATGCGGATAAAATCCCTGAGGATGTGCGAATCATCAGCGAATCGGGCATCTATAATCATCAACAAGTGCGTGAATTACAACACGTTGCCCATGGC‑TTTTAATCGGCAGCAGCTTAATGGGCAGCGCGGATTTAAATAACACCGTGCGCGAAGTGATTTTCGGTGAAAACAAAGTGTGTGGCTTAACCCGTGCGCAGGATGTGAAAACTGCTTACGACAACGGCGCTTTATACGGTGGGCTAATTTTCGCCGAACAGTCTAAACGCTGCGTCAGTTTACGTCAGGCGCAGGAATTGGTGACCGCCGCCCCACTGCGTTTTGTGGGCGTG > 1/1496663‑1497146 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |