| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 841,649 | Δ1 bp | coding (861/942 nt) | unknown → | ABC transporter, substrate‑binding protein PM1325 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 841,646 | 0 | A | . | 100.0% | 374.7 / NA | 88 | coding (858/942 nt) | unknown | ABC transporter, substrate‑binding protein PM1325 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base . (42/46); total (42/46) | |||||||||||
AACAAGCACTTAATGTAACTACTAATATTTTAACCGCTAATCCAAATGTTAATGGTATTTTTGCCGCTAACGATAATATGGCAATCGGTGCGGTTACGGCTGTGGAAAACGCCGGTCTGGCAGGCAAAGTATTGGTTACCGGCTATGATGGTATTCCGCTTGCCATTGAATATGTAAAACAAGGCAAAATGCAAAATACTATTGATCAGCTGCCGAAAAAACAAGTGGCTATTGCTATTGAGCATGCGTTAAAACAAATCAATAAACAGGAAATTCCGGCTGTTTATTATGTAGATCCGGTCGTCGTGGATAAAGAACAATCTAAAAATTACTGATTTGATACCAAACAAAAAGGCGTACCTTTCGATACGCCTTTTCAGTTTTACTTTGGTTTGTCTTATCAATTATTTGATAATTTTAGCTACCACGCCGGCACCCACTGTACGGCCACCTTCACGGATAGCGAAACGTAAACCTTGGTCCATCGCAATTGGGTG > 1/841396‑841892 | aaCAAGCACTTAATGTAACTACTAATATTTTAACCGCTAATCCAAATGTTAATGGTATTTTTGCCGCTAACGATAATATGGCAATCGGTGCGGTTACGGCTGTGGAAAACGCCGGTCTGGCAGGCAAAGTATTGGTTACCGGCTATGATGGTATTCCGCTTGCCATTGAATATGTAAAACAAGGCAAAATGCAAAATACTATTGATCAGCTGCCGAAAAAACAAGTGGCTATTGCTATTGAGCATGCGTTa > 1:369829/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |