| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,939,614 | (A)9→8 | intergenic (+48/‑46) | unknown → / → unknown | DNA polymerase III epsilon subunit (EC 2.7.7.7)/tRNA‑Asp‑GTC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,939,606 | 0 | A | . | 100.0% | 319.0 / NA | 75 | intergenic (+40/‑54) | unknown/unknown | DNA polymerase III epsilon subunit (EC 2.7.7.7)/tRNA‑Asp‑GTC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base . (33/42); total (33/42) | |||||||||||
TTGATGAAAGTGAACCGGAAATTATTCAGCACGCCGGCGAACAGCAAGTACAAAGTGCGGTCGTTTTTTCACACAATTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAGAAAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAA > 1/1939364‑1939846 | ttGATGAAAGTGAACCGGAAATTATTCAGCACGCCGGCGAACAGCAAGTACAAAGTGCGGTCGTTTTTTCACACAATTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAGaaaaaaaag < 1:684627/251‑2 (MQ=255) gatgaAAGTGAACCGGAAATTATTCAGCACGCCGGCGAACAGCAAGTACAAAGTGCGGTCGTTTTTTCACACAATTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAGaaaaaaaagtt > 1:108976/1‑248 (MQ=255) cGGAAATTATTCAGCACGCCGGCGAACAGCAAGTACAAAGTGCGGTCGTTTTTTCACACAATTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTccc < 1:579625/251‑1 (MQ=255) aaaTTATTCAGCACGCCGGCGAACAGCAAGTACAAAGTGCGGTCGTTTTTTCACACAATTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTg > 1:808313/1‑250 (MQ=255) aaaTTATTCAGCACGCCGGCGAACAGCAAGTACAAAGTGCGGTCGTTTTTTCACACAATTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTg < 1:522408/250‑1 (MQ=255) attattCAGCACGCCGGCGAACAGCAAGTACAAAGTGCGGTCGTTTTTTCACACAATTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTgcgc < 1:316783/251‑1 (MQ=255) attCAGCACGCCGGCGAACAGCAAGTACAAAGTGCGGTCGTTTTTTCACACAATTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCat > 1:744354/1‑251 (MQ=255) cACGCCGGCGAACAGCAAGTACAAAGTGCGGTCGTTTTTTCACACAATTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCAttatta < 1:408402/250‑1 (MQ=255) cGCCGGCGAACAGCAAGTACAAAGTGCGGTCGTTTTTTCACACAATTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGc < 1:584742/251‑1 (MQ=255) ccGGCGAACAGCAAGTACAAAGTGCGGTCGTTTTTTCACACAATTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGcac < 1:357071/251‑1 (MQ=255) aaCAGCAAGTACAAAGTGCGGTCGTTTTTTCACACAATTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGcacctcacc < 1:822585/251‑1 (MQ=255) gCAAGTACAAAGTGCGGTCGTTTTTTCACACAATTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTg > 1:764462/1‑225 (MQ=255) gTACAAAGTGCGGTCGTTTTTTCACACAATTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGa > 1:302728/1‑251 (MQ=255) aCAAAGTGCGGTCGTTTTTTCACACAATTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGt < 1:361938/251‑1 (MQ=255) cGGTCGTTTTTTCACACAATTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATATAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGtt < 1:387150/250‑1 (MQ=255) gTTTTTTCACACAATTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTgcgc > 1:497768/1‑209 (MQ=255) ttttttCACACAATTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGt < 1:789752/237‑1 (MQ=255) acacaATTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAAt < 1:664864/251‑1 (MQ=255) acacaATTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAAt < 1:501443/251‑1 (MQ=255) aTTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AACAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATAc > 1:454892/1‑248 (MQ=255) aTTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCAttatta < 1:332516/204‑1 (MQ=255) aTTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGcacc > 1:327320/1‑210 (MQ=255) aTTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGcac < 1:225445/209‑1 (MQ=255) aTTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGt > 1:74472/1‑225 (MQ=255) aTTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATAc > 1:688953/1‑248 (MQ=255) aTTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATAc > 1:89738/1‑248 (MQ=255) cGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGcacctcacc > 1:584276/1‑210 (MQ=255) tCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAg < 1:606890/251‑1 (MQ=255) tCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAg < 1:266283/251‑1 (MQ=255) aCCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAggg < 1:523179/251‑1 (MQ=255) ccccGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGTAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACgg > 1:7646/1‑168 (MQ=255) cGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATAc > 1:690154/1‑227 (MQ=255) cGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTcgcg < 1:837700/251‑1 (MQ=255) gaagaagaaCTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCatta > 1:634268/1‑178 (MQ=255) gaagaagaaCTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGcacctcacc > 1:629633/1‑192 (MQ=255) gaagaaCTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCAttatta > 1:385566/1‑178 (MQ=255) gaagaaCTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCtgtg < 1:77076/193‑1 (MQ=255) gaaCTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGtt < 1:107196/212‑1 (MQ=255) cATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGcac > 1:243199/1‑168 (MQ=255) cATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCAtt > 1:612046/1‑250 (MQ=255) gAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGcacctcacc < 1:557923/168‑1 (MQ=255) gAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCaa > 1:395869/1‑251 (MQ=255) tACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTg < 1:34614/251‑1 (MQ=255) aCCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATAcctg < 1:405524/200‑1 (MQ=255) ccTCAAATTAATCAGTAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGtt < 1:360868/180‑1 (MQ=255) ttAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAGaaaaaaa > 1:104544/1‑115 (MQ=255) aTAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCAttatta < 1:60752/138‑1 (MQ=255) tAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAAtt < 1:515061/251‑1 (MQ=255) aaaaaaaaGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAGTAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAAtt < 1:605486/250‑1 (MQ=255) ggATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTcc < 1:807830/214‑1 (MQ=255) gCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGt > 1:787288/1‑181 (MQ=255) gCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGc < 1:406177/248‑1 (MQ=255) gCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTgg > 1:114538/1‑251 (MQ=255) ttGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAg < 1:364124/251‑1 (MQ=255) gAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAAt < 1:837647/250‑1 (MQ=255) cGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAAtt < 1:868409/220‑1 (MQ=255) cGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATAc > 1:663882/1‑249 (MQ=255) tCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATAcctg < 1:272458/250‑1 (MQ=255) aGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATc < 1:283676/205‑1 (MQ=255) cccAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTc > 1:720496/1‑128 (MQ=255) cccAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGt < 1:394136/250‑1 (MQ=255) ggAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGt < 1:818791/116‑1 (MQ=255) gaagaaACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACg < 1:378292/249‑1 (MQ=255) aCCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGtt > 1:890883/1‑160 (MQ=255) cATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCggg < 1:469631/251‑1 (MQ=255) aataaAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAg > 1:224221/1‑104 (MQ=255) ataaAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGa > 1:869040/1‑251 (MQ=255) aTCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGc > 1:190460/1‑203 (MQ=255) aTCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTcc > 1:259112/1‑250 (MQ=255) ccGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCgg > 1:724775/1‑82 (MQ=255) ccGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGtt > 1:476212/1‑250 (MQ=255) gATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCAc < 1:346700/216‑1 (MQ=255) gATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCg > 1:225279/1‑251 (MQ=255) aTTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGt < 1:492569/212‑1 (MQ=255) aaaCAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTc < 1:217348/186‑1 (MQ=255) aaCCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTc < 1:808093/165‑1 (MQ=255) ccccAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTctaaa > 1:298488/1‑251 (MQ=255) ccccAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTctaaa > 1:200988/1‑251 (MQ=255) | TTGATGAAAGTGAACCGGAAATTATTCAGCACGCCGGCGAACAGCAAGTACAAAGTGCGGTCGTTTTTTCACACAATTTACGCCTGCTCACCCCGACGGAAGAAGAACTGCAGGCGCATTTGGAGTACCTCAAATTAATCAATAAAAAAAGCAAGGATAATTGCCTTTGGGAGCGTCAAGCCCAGGAAGAAACCTTGCATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAGAAAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAA > 1/1939364‑1939846 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |