| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,930,364 | (T)6→5 | intergenic (+74/‑104) | unknown → / → unknown | Ribose‑phosphate pyrophosphokinase (EC 2.7.6.1)/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,930,359 | 0 | T | . | 100.0% | 350.3 / NA | 82 | intergenic (+69/‑109) | unknown/unknown | Ribose‑phosphate pyrophosphokinase (EC 2.7.6.1)/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base . (32/50); total (32/50) | |||||||||||
TGCGGCAAAAAATATTGCCAGCGATGCCCTTGACGAAGTAGTCGTCACTGACACCATCCCACTTTCTCCGGAAATCCGCGTATTAGGCAAAGTCCGCACCTTAACCTTATCCGGTATGCTTGCCGAAGCTATTCGTCGCATCAGCAACGAAGAGTCCATTTCCGCAATGTTTAACGAATAATAAAAAAACACCCGTAAAAACCACCGCACTTTAAACTACAAAAGGTTTAGCAAAAACTAAACCTTTTGTTTTTTATACGTTATGCCGAACTAACTGCCCGCCACATTGTTGTGCTATAATCGCGCCACATTTAATTTAACAACCCATTTTATTTTAATTTATCAGTAAAGGTGTTCCATGAAAAAATTACTTTTTGTCCTCGCCGGCATTTTAACCATCGCCGCCTGCTCCCAGCCAAAAGACATCTATTTTAACGGTTCCGAAGGTTCCCACTCCGGTTTGAAATACGACAAAAGTACTAAGACTTTTGGTG > 1/1930110‑1930603 | tGCGGCAAAAAATATTGCCAGCGATGCCCTTGACGAAGTAGTTGTCACTGACACCATCCCACTTTCTCCGGAAATCCGCGTATTAGGCAAAGTCCGCACCTTAACCTTATCCGGTATGCTTGCCGAAGCTATTCGTCGCATCAGCAACGAAGAGTCCATTTCCGCAATGTTTAACGAATAATAAAAAAAGACCCGTAAAAACCACCGCACTTTAAACTACAAAAGGTTTAGCAAAAACTAAACCTTTTGtt < 1:521598/251‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |