| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,808,340 | (T)9→8 | coding (628/822 nt) | unknown ← | probable glucanotransferase (endo alpha‑1,4 polygalactosaminidase related protein) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,808,332 | 0 | T | . | 100.0% | 106.0 / NA | 26 | coding (636/822 nt) | unknown | probable glucanotransferase (endo alpha‑1,4 polygalactosaminidase related protein) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base . (9/17); total (9/17) | |||||||||||
TATTATATCTGCATTCACACGAGTTACCGAAGCTCTAATCCCTTCGCGTTATACCAAAGAAAGCCATTTTCATTTGCATATTTGTCAATTTTTTTTGACAGTTCCTTACTTGCATTATATTCAAGTAAATAGACAGATAATCCATGAGCCTTAACATATGCCAGATATTTTTGAAAATAGGTTGTTTCCGATTTCTGCTGGATTCCATATTTTTTTTTATTAAAATCAATAGTGGTAAAAACACTTTCTTGGTTAATACCATCAATTAAAACGGTATTTTGATTAATACATTTTTTTACAAAAAGATCCCCTCCATTAATAATAAGTGGAATATTATAATATCGAAGCCCAGTCAAAATTGTTACAAGCCCTTGAAATATCTCATTTGTTTGATAATGATAATAAACATCTGCATTATCAAGAAAAAAACCATCCAACCCCATATCAGCATA > 1/1808123‑1808574 | tattatATCTGCATTCACACGAGTTACCGAAGCTCTAATCCCTTCGCGTTATACCAAAGAAAGCCATTTTCATTTGCATATTTGTCAATTTTTTTTGACAGTTCCTTACTTGCATTATATTCAAGTAAATAGACAGATAATCCATGAGCCTTAACATATGCCAGATATTTTTGAAAATAGGTTGTTTCCGATTTCTGCTGGATTCCATA‑TTTTTTTTATTAAAATCAATAGTGGTAAAAACACTTTCTTgg > 1:899374/1‑251 (MQ=255) 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1:794510/1‑93 (MQ=255) tGCCAGATATTTTTGAAAATAGGTTGTTTCCGATTTCTGCTGGATTCCATA‑TTTTTTTTATTAAAATCAATAGTGGTAAAAACACTTTCTTGGTTAATAc < 1:98917/100‑1 (MQ=255) tCTGTTGGTTTCCATA‑‑TTTTTTTATTAAAATCAATAGTGGTAAAAACACTTTCTTGGTTAATACCATCAATTAAAACGGTATTTTGATTAATACATTTTTTTACAAAAAGATCCCCTCCATTAATAATAAGTGGAATATTATAATATCGAAGCCCAGTCAAAATTGTTACAAGCCCTTGAAATATCTCATTTGTTTGATAATCATAATAAACATCTGCATTATCAAGAAAAAAACCATCCAACCCCATATc < 1:606918/251‑1 (MQ=255) ctgctgGATTCCATA‑TTTTTTTTATTAAAATCAATAGTGGTAAAAACACTTTCTTGGTTAATACCATCAATTAAAACGGTATTTTGATTAATACATTTTTTTACAAAAAGATCCCCTCCATTAATAATAAGTGGAATATTATAATATCGAAGCCCAGTCAAAATTGTTACAAGCCCTTGAAATATCTCATTTGTTTGATAATCATAATAAACa < 1:656712/213‑1 (MQ=255) ctgctgGATTCCATA‑TTTTTTTTATTAAAATCAATAGTGGTAAAAACACTTTCTTGGTTAATACCATCAATTAAAACGGTATTTTGATTAATACATTTTTTTACAAAAAGATCCCCTCCATTAATAATAAGTGGAATATTATAATATCGAAGCCCAGTCAAAATTGTTACAAGCCCTTGAAATATCTCATTTGTTTGATAATCATAATAAACATCTGCATTATCAAGAAAAAAACCATCCAACCCCATATc < 1:314439/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |