| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,440,828 | (G)5→3 | coding (3100‑3101/3174 nt) | unknown → | Lysophospholipid transporter LplT / 2‑acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase (EC 2.3.1.40) / Acyl‑[acyl‑carrier‑protein] synthetase (EC 6.2.1.20) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,440,825 | 0 | G | . | 100.0% | 203.1 / NA | 48 | coding (3097/3174 nt) | unknown | Lysophospholipid transporter LplT / 2‑acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase (EC 2.3.1.40) / Acyl‑[acyl‑carrier‑protein] synthetase (EC 6.2.1.20) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (25/23); total (25/23) | |||||||||||
| * | 1 | 1,440,826 | 0 | G | . | 100.0% | 203.1 / NA | 48 | coding (3098/3174 nt) | unknown | Lysophospholipid transporter LplT / 2‑acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase (EC 2.3.1.40) / Acyl‑[acyl‑carrier‑protein] synthetase (EC 6.2.1.20) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (25/23); total (25/23) | |||||||||||
AATATTTTGGAAAAAGAAACGTTAAAAGAGCTGACGTTTAACAAACAGGGCTCTGTCGGGATGCCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAAGGGGGCATATTGATGAGAACGGTTTTATTACTATCGTTGACCGTTATTCCCGCTTTGCGAAAGTCGGTGGCGAAATGATTAGTTTAGGCAGTGTAGAAGAACAAATTGCACAGGTTTTGAATGACGATGTGCAATTTACCGCTGCAAATGTGCCGGATGATAAAAAAGGTGAAGCGGTGGTGCTTTTAGTGAAAACCGAATCGGATATTAATGAGGTCGTCAATAT > 1/1440576‑1441050 || aaTATTTTGGAAAAAGAAACGTTAAAAGAGCTGACGTTTAACAAACAGGGCTCTGTCGGGATGCCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAAg < 1:465965/250‑1 (MQ=255)aaTATTTTGGAAAAAGAAACGTTAAAAGAGCTGACGTTTAACAAACAGGGCTCTGTCGGGATGCCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAAg < 1:352844/250‑1 (MQ=255) gAAAAAGAAACGTTAAAAGAGCTGACGTTTAACAAACAGGGCTCTGTCGGGATGCCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAAgggcatattg < 1:322177/250‑8 (MQ=255) aaaaGAAACGTTAAAAGAGCTGACGTTTAACAAACAGGGCTCTGTCGGGATTGCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGGAACGGGAGAAGAAGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAAACGCTTACGGCATTTGCGAAATTGACGACGTGCCTTATTACAAAACGGGTGATAAA‑‑GGGCATATtgatg < 1:475753/251‑1 (MQ=255) aaGAAACGTTAAAAGAGCTGACGTTTAACAAACAGGGCTCTGTCGGGATGCCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAA‑‑GGGCATATTGATgag < 1:854280/251‑1 (MQ=255) aaaCGTTAAAAGAGCTGACGTTTAACAAACAGGGCTCTGTCGGGATGCCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAA‑‑GGGCATATTGATGAGAAc < 1:799387/251‑1 (MQ=255) cGTTAAAAGAGCTGACGTTTAACAAACAGGGCTCTGTCGGGATGCCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAAgg > 1:829991/1‑232 (MQ=255) aacaaacaGGGCTCTGTCGGGATGCCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAA‑‑GGGCATATTGATGAGAACGGTTTTATTACTATCGTTGACCg > 1:610465/1‑251 (MQ=255) acaaacaGGGCTCTGTCGGGATGCCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAAg < 1:751486/210‑1 (MQ=255) caaacaGGGCTCTGTCGGGATGCCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAA‑‑GGGCATATTGATGAGAACGGTTTTATTACTATCg < 1:787293/242‑1 (MQ=255) 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ctGTCGGGATGCCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAA‑‑GGGCATATTGATGAGAACGGTTTTATTAc > 1:782903/1‑226 (MQ=255) gTCGGGATGCCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAAgggcatat > 1:701856/1‑198 (MQ=255) ccGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTCCAAAACGGGTGATAAA‑‑GGGCATATTGATGAGAACGGTTTTATTAc > 1:453538/1‑215 (MQ=255) ccGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAA‑‑GGGCATATTGATGAGAACGGTTTTATTAc < 1:138889/215‑1 (MQ=255) ccGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAA‑‑GGGCATATTGATGAGAACGGTTTTATTACTATCGTTGACCGTTATTCCCGCTTTGCGAAAGTcc < 1:471287/250‑2 (MQ=255) aTTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAA‑‑GGGCATATTGATGAGAACGGTTTTATTACTATCGTTGACCGTTATTCCCGCTTTGCGAAAGTCGGTGGCGAAATGATTAGTTTAGGCAg > 1:308719/1‑251 (MQ=255) tCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAA‑‑GGGCATATTGATGAGAAc < 1:309522/172‑1 (MQ=255) tCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAA‑‑GGGCATATTGATGAGAACGGTTTTATTAc < 1:753823/183‑1 (MQ=255) 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attaCAAAACGGGTGATAAA‑‑GGGCATATTGATGAGAACGGTTTTATTACTATCGTTGACCGTTATTCCCGCTTTGCGAAAGTCGGTGGCGAAATGATTAGTTTAGGCAGTGTAGAAGAACAAATTGCACAGGTTTTGAATGACGATGTGCAATTTACTGCTGCAAATGTGCCGGATGATAAAAAAGGTGAAGCGGTGGTGCtt < 1:689252/203‑1 (MQ=255) ttaCAAAACGGGTGATAAA‑‑GGGCATATTGATGAGAACGGTTTTATTACTATCGTTGACCGTTATTCCCGCTTTGCGAAAGTCGGTGGCGAAATGATTAGTTTAGGCAGTGTAGAAGAACAAATTGCACAGGTTTTGaa > 1:55479/1‑138 (MQ=255) || AATATTTTGGAAAAAGAAACGTTAAAAGAGCTGACGTTTAACAAACAGGGCTCTGTCGGGATGCCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAAGGGGGCATATTGATGAGAACGGTTTTATTACTATCGTTGACCGTTATTCCCGCTTTGCGAAAGTCGGTGGCGAAATGATTAGTTTAGGCAGTGTAGAAGAACAAATTGCACAGGTTTTGAATGACGATGTGCAATTTACCGCTGCAAATGTGCCGGATGATAAAAAAGGTGAAGCGGTGGTGCTTTTAGTGAAAACCGAATCGGATATTAATGAGGTCGTCAATAT > 1/1440576‑1441050 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |