| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 839,582 | T→G | intergenic (+80/+3) | unknown → / ← unknown | hypothetical protein/Transcription elongation factor GreB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 839,582 | 0 | T | G | 100.0% | 246.1 / NA | 83 | intergenic (+80/+3) | unknown/unknown | hypothetical protein/Transcription elongation factor GreB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (37/46); total (37/46) | |||||||||||
TTAATTTCCGATGGTCAGGAAAAACCGCTTTCCTTGCTGCAACACAGTCAGGTTTATATGCATTTGGCTATTTGTCCGTACTGTCGTGCTTTTGCTCGAAATTGCGCAAAAATGCACGATATGATGCACGAATTCGCTGAACAACCGGATAATGAGAAGGCTCGGTAATATTAAGTATCCTAAAAGTGCGGTGAGAAATTTATATGTTTTTTCGATCGCACTTTTCATCTATTGAAAAGCAATTCTGTCGCTATGCGTTTTTTTCATACCAAATTCGATTCACACATAGCCAAATTTTACCGGCAGGCGTGTCCACCGTAATTTCGTCATCTTCCTGCTTGCCGATTAGTGCGCGTGCCACCGGTGAATCAATGGAAATCCAGTTATTTGCCGGATCAAATTCATCACAGCCGACAATGCGATATTGTTTCACTTCGCCGTCTTCATTTTCCAGTTCCACCCATGCGCCGAAAAACACTTTGCTTTCCTGTTT > 1/839335‑839827 | ttAATTTCCGATGGTCAGGAAAAACCGCTTTCCTTGTTGCAACACAGTCAGGTTTATATGCATTTGGCTATTTGTCCGTACTGTCGTGCTTTTGCTCGAAATTGCGCAAAAATGCACGATATGATGCACGAATTCGCTGAACAACCGGATAATGAGAAGGCTCGGTAATATTAAGTATCCTAAAAGTGCGGTGAGAAATTTATATGTTTTTTCGATCGCACTTTTCATCTATTGAAAAGCAATTCTGgcgc < 1:147148/251‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |