| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 788,130 | T→C | S515G (AGT→GGT) | unknown ← | Alanyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.7) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 788,130 | 0 | T | C | 100.0% | 252.1 / NA | 88 | S515G (AGT→GGT) | unknown | Alanyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.7) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (40/48); total (40/48) | |||||||||||
CAATAATGCATCAGAAACAAGCGATCCTTTCTGAGCGACGTGTTCGCCTAAGACCTGACGTAACGCGGCGTGCAACAAATGGGTTGCAGAGTGATTTAATGAAATACGTTGACGGCGAACCTCGTCAACCACTGCATTCACGGACTGCCCGACGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACTGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTGCGCG > 1/787894‑788371 | cAATAATGCATCAGAAACAAGCGATCCTTTCTGAGCGACGTGTTCGCCTAAGACCTGACGTAACGCGGCGTGCAACAAATGGGTTGCAGAGTGATTTAATGAAATACGTTGACGGCGAACCTCGTCAACCACTGCATTCACGGACTGCCCGACGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAg > 1:280525/1‑250 (MQ=255) cATCAGAAACAAGCGATCCTTTCTGAGCGACGTGTTCGCCTAAGACCTGACGTAACGCGGCGTGCAACAAATGGGTTGCAGAGTGATTTAATGAAATACGTTGACGGCGAACCTCGTCAACCACTGCATTCACGGACTGCCCGACGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATg > 1:672323/1‑251 (MQ=255) cAAGCGATCCTTTCTGAGCGACGTGTTCGCCTAAGACCTGACGTAACGCGGCGTGCAACAAATGGGTTGCAGAGTGATTTAATGAAATACGTTGACGGCGAACCTCGTCAACCACTGCATTCACGGACTGCCCGACGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGAtt < 1:283245/251‑1 (MQ=255) aTCCTTTCTGAGCGACGTGTTCGCCTAAGACCTGACGTAACGCGGCGTGCAACAAATGGGTTGCAGAGTGATTTAATGAAATACGTTGACGGCGAACCTCGTCAACCACTGCATTCACGGACTGCCCGACGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGacc < 1:705984/250‑1 (MQ=255) tttCTGAGCGACGTGTTCGCCTAAGACCTGACGTAACGCGGCGTGCAACAAATGGGTTGCAGAGTGATTTAATGAAATACGTTGACGGCGAACCTCGTCAACCACTGCATTCACGGACTGCCCGACGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCgg < 1:289123/251‑1 (MQ=255) ttCGCCTAAGACCTGACGTAACGCGGCGTGCAACAAATGGGTTGCAGAGTGATTTAATGAAATACGTTGACGGCGAACCTTGTCAACCACTGCATTCACGGACTGCCCGACGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAAt < 1:423433/250‑1 (MQ=255) gCCTAAGACCTGACGTAACGCGGCGTGCAACAAATGGGTTGCAGAGTGATTTAATGAAATACGTTGACGGCGAACCTCGTCAACCACTGCATTCACGGACTGCCCGACGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAg < 1:808772/205‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |