| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 92,642 | C→T | A69V (GCC→GTC) G410G (GGG→GGA) |
unknown → unknown ← |
Sialic acid‑specific 9‑O‑acetylesterase hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 92,642 | 0 | C | T | 100.0% | 176.0 / NA | 62 | A69V (GCC→GTC) G410G (GGG→GGA) | unknown unknown | Sialic acid‑specific 9‑O‑acetylesterase hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (39/23); total (39/23) | |||||||||||
GTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGGCATTGTATATGTCCTTTTTTATTGTCAACTTTTGCTTCTTAAAGTGCGGTGG‑TTTTTACGGCGTTTTGAAAATCACTTATGCCCGACCCGAATTGTAATATCCCTGAATGCCAGGGCATTGCGGCTAACGCCGGGCTGTACCTCAATACGCACACGAATTTTATCCACATTTTGCGCGAGGCTGTCAGCCACTTGTTGCGGATGCCAATCGTCAGTTGTCCAGTCGCCCAAAAGCTCGGATGGGTATGATTTGACCACCTCGGCGCCGCTTAAAAGCTGCACAATCACCCGGCATTTGCCTTTGCGCTGCGCATAGCTCAGTAT > 1/92491‑92884 | gtttaaacatagcacgctccttttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgttt‑gCATTGTATATGTCCTTTTTTATTGTCAAATTTTGATTATAAAAATGCAGTGGATTTTTACGGCGTTTTGAAAATCACTTATGTCCCACCCGAATTGTAATATCCCTAAATGCCAGCGCGTTGCGGCTAATGCCCGGCTGTACCt > 1:863311/22‑213 (MQ=19) tttaaacatagcacgctccttttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgttt‑gCATTGTGTATGTCCTTTTTTATTGTCAAATTTTGATTATAAAAATGCAGTGGATTTTTACGGCGTTTTGAAAATCACTTATGTCCCACCCGAATTGTAATATCCCTAAATGCCAGCGCGTTGCGGCTAATGCCCGGCTGTACCTCAATGCGCAGACGAATTTTATCCACATTTTGCGCGAgg > 1:23162/21‑250 (MQ=255) 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(MQ=255) gtttgttt‑gCATTGTATATGTCCTTTTTTATTGTCAAATTTTGATTATAAAAATGCAGTGGATTTTTACGGCGTTTTGAAAATCACTTATGTCCCACCCGAATTGTAATATCCCTAAATGCCAGCGCGTTGCGGCTAATGCCCGGCTGTACCTCAATGCGCAGACGAATTTTATCCACATTTTGCGCGAGGCTGTCAGCCACTTGTTGCGGATGCCAATCGTCAGTTGTCCAGt > 1:400327/1‑234 (MQ=255) tgttt‑gCATTGTATATGTCCTTTTTTATTGTCAAATTTTGATTATAAAAATGCAGTGGATTTTTACGGCGTTTTGAAAATCACTTATGTCCCACCCGAATTGTAATATCCCTAAATGCCAGCGCGTTGCGGCTAATGCCCGGCTGTACCTCAAtg > 1:606460/1‑154 (MQ=255) gtttgCATTGTATATGTCCTTTTTTATTGTCAAATTTTGATTATAAAAATGCAGTGGATTTTTACGGCGTTTTGAAAATCACTTATGTCCCACCCGAATTGTAATATc < 1:882847/104‑1 (MQ=255) ttgCATTGTATATGTCCTTTTTTATTGTCAAATTTTGATTATAAAAATGCAGTGGATTTTTACGGCGTTTTGAAAATCACTTATGTCCCACCCGAATTGTAATATCCCTAAATGCCAGCGCGTTGCGGCTAATGCCCGGCTGTACCTCAATGCGCAGACGAATTTTATCCACATTTTGCGCGAGGCTGTCAGCCACTTGTTGCGGATGCCAATCGTCAGTTGTCCAGTCGCCCAAAAGCTCGGATGGGTAt < 1:383425/249‑1 (MQ=255) gCATTGTATATGTCCTTTTTTATTGTCAAATTTTGATTATAAAAATGCAGTGGATTTTTACGGCGTTTTGAAAATCACTTATGTCCCACCCGAATTGTAATATcc < 1:853778/105‑1 (MQ=255) 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GTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGGCATTGTATATGTCCTTTTTTATTGTCAACTTTTGCTTCTTAAAGTGCGGTGG‑TTTTTACGGCGTTTTGAAAATCACTTATGCCCGACCCGAATTGTAATATCCCTGAATGCCAGGGCATTGCGGCTAACGCCGGGCTGTACCTCAATACGCACACGAATTTTATCCACATTTTGCGCGAGGCTGTCAGCCACTTGTTGCGGATGCCAATCGTCAGTTGTCCAGTCGCCCAAAAGCTCGGATGGGTATGATTTGACCACCTCGGCGCCGCTTAAAAGCTGCACAATCACCCGGCATTTGCCTTTGCGCTGCGCATAGCTCAGTAT > 1/92491‑92884 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |