| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 716,292 | A→G | H125R (CAT→CGT) | unknown → | LSU ribosomal protein L5p (L11e) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 716,292 | 0 | A | G | 100.0% | 245.4 / NA | 84 | H125R (CAT→CGT) | unknown | LSU ribosomal protein L5p (L11e) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (32/52); total (32/52) | |||||||||||
CCGATAAAAAATTGCTAGATAATGCGGTGGCAGATCTGGCAGCAATTAGCGGTCAAAAACCTTTGATTACTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCATGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAATGATGAAGAAGGTCGAGCACTATTGGCTGCCTTTAATTTCCCATTCCGTAAGTAAGGCAGGTTACAAATGGCTAAACAATCAATGAAAGCACGCGACGTAAAACGCGTGAAATTGGCTGAAAAATTCTATGCTA > 1/716052‑716537 | ccGATAAAAAATTGCTAGATAATGCGGTGGCAGATCTGGCAGCAATTAGCGGTCAAAAACCTTTGATTACTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTAc < 1:104494/251‑1 (MQ=255) aaaTTGCTAGATAATGCGGTGGCAGATCTGGCAGCAATTAGCGGTCAAAAACCTTTGATTACTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATggg < 1:427724/251‑1 (MQ=255) aaaTTGCTAGATAATGCGGTGGCAGATCTGGCAGCAATTAGCGGTCAAAAACCTTTGATTACTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATggg < 1:814/251‑1 (MQ=255) aTAATGCGGTGGCAGATCTGGCAGCAATTAGCGGTCAAAAACCTTTGATTACTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTg < 1:382993/249‑1 (MQ=255) aTAATGCGGTGGCAGATCTGGCAGCAATTAGCGGTCAAAAACCTTTGATTACTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAg > 1:403606/1‑251 (MQ=255) gTGGCAGATCTGGCAGCAATTAGCGGTCAAAAACCTTTGATTACTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGgtg < 1:543144/235‑1 (MQ=255) caATTAGCGGTCAAAAACCTTTGATTACTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGa > 1:751622/1‑250 (MQ=255) gTCAAAAACCTTTGATTACTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTa > 1:803289/1‑244 (MQ=255) gTCAAAAACCTTTGATTACTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATaaa > 1:818581/1‑251 (MQ=255) cAAAAACCTTTGATTACTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGt < 1:888395/251‑1 (MQ=255) cAAAAACCTTTGATTACTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGt < 1:214432/251‑1 (MQ=255) cAAAAACCTTTGATTACTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGt < 1:300214/251‑1 (MQ=255) cAAAAACCTTTGATTACTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGt < 1:150792/251‑1 (MQ=255) cAAAAACCTTTGATTACTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGt < 1:159310/251‑1 (MQ=255) cAAAAACCTTTGATTACTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGt < 1:747758/251‑1 (MQ=255) aaCCTTTGATTACTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGAt < 1:163965/251‑1 (MQ=255) ccTTTGATTACTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCg > 1:318422/1‑251 (MQ=255) ccTTTGATTACTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCg < 1:627082/251‑1 (MQ=255) gATTACTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAg > 1:203054/1‑189 (MQ=255) aCTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTAc < 1:247659/183‑1 (MQ=255) aCTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAg < 1:140218/185‑1 (MQ=255) aCTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATggg < 1:373343/191‑1 (MQ=255) ccGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGgtg < 1:696348/185‑1 (MQ=255) ccGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGata < 1:405453/251‑1 (MQ=255) aaTCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATggg > 1:586623/1‑178 (MQ=255) aTCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGAtattacta < 1:706909/251‑1 (MQ=255) cTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGAt < 1:254624/224‑1 (MQ=255) gTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGt > 1:166522/1‑180 (MQ=255) ttGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTacc < 1:59749/251‑1 (MQ=255) gCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACcaccac < 1:154250/250‑1 (MQ=255) cTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGAtatta > 1:658130/1‑236 (MQ=255) cTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAg > 1:344255/1‑251 (MQ=255) tAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTa < 1:578905/251‑1 (MQ=255) tAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTa < 1:548548/251‑1 (MQ=255) tCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAat < 1:472490/251‑1 (MQ=255) cGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCg < 1:194954/161‑1 (MQ=255) gggATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTAt > 1:480566/1‑147 (MQ=255) gggATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGata < 1:122983/218‑1 (MQ=255) gggATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGat > 1:165077/1‑217 (MQ=255) gggATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAATGATgaag > 1:129654/1‑251 (MQ=255) tatCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAat > 1:611986/1‑240 (MQ=255) atCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGAt > 1:648071/1‑194 (MQ=255) ccAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGat < 1:821887/210‑1 (MQ=255) gTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAATGATGAAGAAGGTCGAGCACTa > 1:711819/1‑251 (MQ=255) gTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAATGATGAAGAAGGTCGAGCACTa > 1:379351/1‑251 (MQ=255) aaGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAATGATGAAGAAGGTCGAGCACTATTGGCt < 1:800856/251‑1 (MQ=255) aaGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAATGATGAAGAAGGTCGAGCACTATTGGCt < 1:96688/251‑1 (MQ=255) gTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGAtattactatta < 1:552367/205‑1 (MQ=255) gTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAat > 1:104645/1‑222 (MQ=255) gTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAat > 1:294007/1‑222 (MQ=255) gTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAATGATGAAGAAGGTCGAGCACTATTGGc < 1:291428/248‑1 (MQ=255) acacTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAATGATGAAGAAGGTCGAGCACTATTGGCTGCCtt > 1:186205/1‑251 (MQ=255) cacTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGAt > 1:693170/1‑164 (MQ=255) cTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATggg < 1:118892/122‑1 (MQ=255) cTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTa > 1:207526/1‑177 (MQ=255) gtggtgAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAg > 1:718858/1‑112 (MQ=255) tggtgAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCgtg < 1:162358/170‑1 (MQ=255) tggtgAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTacc < 1:120802/196‑1 (MQ=255) gAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGata < 1:83876/181‑1 (MQ=255) aCGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTAc < 1:346518/103‑1 (MQ=255) cGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAATGATGAAGAAGGTCGAGCACTATTGGCTGCCTTTAATTTCCCATTCCg > 1:225285/1‑251 (MQ=255) aTGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCg < 1:350844/158‑1 (MQ=255) tgGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAATGATGAAGAAGGTCGAGCACTATTGGCTGCCTTTAATTTCCCATTCCgtaagta < 1:692633/251‑1 (MQ=255) ttCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAATGATGAAGAAGGTCGAGCACTATTGGCTGCCTTTAATTTCCCATTCCGTAAGTAAGGc < 1:594173/249‑1 (MQ=255) ttCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAATGATGAAGAAGGTCGAGCACTATTGGCTGCCTTTAATTTCCCATTCCGTAAGTAAGGc < 1:327970/249‑1 (MQ=255) tCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGAt > 1:569406/1‑146 (MQ=255) tCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAat < 1:536477/191‑1 (MQ=255) gTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAATGATGAAGAAGGTCGAGCACTATTGGCt > 1:259248/1‑209 (MQ=255) cAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACcaccac < 1:859305/163‑1 (MQ=255) ttGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGgtg < 1:498679/78‑1 (MQ=255) gTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTc < 1:149223/93‑1 (MQ=255) ccACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAATGATGAAGCAGGTCGAGCACTATTGGCTGCCTTTAATTTCCCATTCCGTAAGTAAGGCAGGTTACAAATGGCTAAACAATCAATGAAAg > 1:424416/1‑250 (MQ=255) gTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAATGATGAAGAAGGTCGAGCACTATTGGCTGCCTTTAATTTCCCATTCCgtaagt < 1:664397/210‑1 (MQ=255) aTTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAATGATGAAGAAGGTCGAGCACTATTGGCTGCCTTTAATTTCCCATTCCGTAAGTAAGGCAGGTTACAAATGGCTAAACAATCAATGAAAGCAcgc > 1:222266/1‑249 (MQ=255) cTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAATGATGAAGAAGGTCGAGCACTATTGGCTGCCTTTAATTTCCCATTCCGTAAGTAAGGCAGGTTACAAATGGCTAAACAATCAATGAAAGCACGCGACGTAAAAc < 1:1750/251‑1 (MQ=255) ccGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGAt < 1:280512/100‑1 (MQ=255) gTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGAt < 1:787457/95‑1 (MQ=255) gTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGata > 1:301874/1‑114 (MQ=255) gTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAat > 1:820440/1‑140 (MQ=255) gTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAATGATGAAGAAGGTCGAGCACTATTGGCTGCCTTTAATTTCCCATTCCGTAAGTAAGGCAGGTTACAAATGGCTAAACAATCAATGAAAGCACGCGACGTAAAACGCGTGaaa > 1:14846/1‑251 (MQ=255) cgcgAAATCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAATGATGAAGAAGGTCGAGCACTATTGGCTGCCTTTAATTTCCCATTCCGTAAGTAAGGCAGGTTACAAATGGCTAAACAATCAATGAAAGCACGCGACGTAAAACGCGTGAAATTGGc < 1:450609/249‑1 (MQ=255) tCATTTGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGAt < 1:675118/81‑1 (MQ=255) tttGATGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAATGATGAAGAAGGTCGAGCACTATTGGCTGCCTTTAATTTCCCATTCCGTAAGTAAGGCAGGTTACAAATGGCTAAACAATCAATGAAAGCACGCGACGTAAAACGCGTGAAATTGGCTGAAAAATTCTa > 1:188255/1‑251 (MQ=255) tGGTCGTGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAATGATGAAGAAGGTCGAGCACTATTGGCTGCCTTTAATTTCCCATTCCGTAAGTAAGGCAGGTTACAAATGGCTAAACAATCAATGAAAGCACGCGACGTAAAACGCGTGAAATTGGCTGAAAAATTCTATGCTa < 1:354992/251‑1 (MQ=255) | CCGATAAAAAATTGCTAGATAATGCGGTGGCAGATCTGGCAGCAATTAGCGGTCAAAAACCTTTGATTACTAAAGCCCGTAAATCTGTTGCAGGCTTTAAAATCCGTCAGGGATATCCAATCGGTTGTAAAGTAACACTACGTGGTGAACGTATGTGGGAGTTCTTAGAACGTTTAATTACAATTGCTGTTCCACGTATTCGTGACTTCCGCGGTTTAAGCGCGAAATCATTTGATGGTCATGGAAATTACAGTATGGGTGTGCGTGAGCAAATCATCTTCCCTGAAATCGACTACGATAAAGTAGATCGTGTACGTGGTTTAGATATTACTATTACCACCACAGCTAAGAATGATGAAGAAGGTCGAGCACTATTGGCTGCCTTTAATTTCCCATTCCGTAAGTAAGGCAGGTTACAAATGGCTAAACAATCAATGAAAGCACGCGACGTAAAACGCGTGAAATTGGCTGAAAAATTCTATGCTA > 1/716052‑716537 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |