| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 602,596 | T→G | A63A (GCT→GCG) | unknown → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 602,596 | 0 | T | G | 100.0% | 218.9 / NA | 78 | A63A (GCT→GCG) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (45/33); total (45/33) | |||||||||||
GCATATACGTGATTAACGCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATGAAAAAAACACTTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTTTACAAGATGCTGGAGCTAAATTTAATAGAGATGGGGCGTTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGACAGTTAAAAATAAGTTGGCTGCCGGCAATTAAAAGGAGTAAGATTTAAAACGCCAGAGCAATC‑‑‑‑‑‑TAGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAAC > 1/602355‑602836 | gcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAAt > 1:128138‑M2/19‑251 (MQ=255) 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gaATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATAGAGATGAGGCATTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGATAGTTAAAAATAAGTTGACTGCCGGCAATTAAAAGGATTAAGATTTAAAATGCCAGAGCAATCtggcggtggcggttttatgcagcctgaaaggctgagtgttgaagcaaacaaagcttaactgc > 1:746604‑M1/1‑171 (MQ=255) gaATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATAGAGATGAGGCATTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGATAGTTAAAAATAAGTTGACTGCCGGCAATTAAAAGGATTAAGATTTAAAATGCCAGAGCAATCTGGCGGTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGcaaacaa < 1:136009/222‑1 (MQ=255) aaTGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATAGAGATGAGGCATTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGATAGTTAAAAATAAGTTGACTGCCGGCAATTAAAAGGATTAAGATTTAAAATGCCAGAGCAATCtggcggtggcggttttatgcagcctgaaaggctgagtgttgaagcaaacaaagcttaactgctgaataagcagcttagaaa > 1:709535‑M1/1‑170 (MQ=255) 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ctaCAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATAGAGATGAGGCATTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGATAGTTAAAAATAAGTTGACTGCCGGCAATTAAAAGGATTAAGATTTAAAATGCCAGAGCAATCtggcggtggcggttttatgcagcctgaaaggctgagtgttgaagcaaacaaagcttaactgctgaataagcagcttagaaaatggtagctcttactgaaagttca > 1:652735‑M1/2‑144 (MQ=255) ctaCAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATAGAGATGAGGCATTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGATAGTTAAAAATAAGTTGACTGCCGGCAATTAAAAGGATTAAGATTTAAAATGCCAGAGCAATCtggcggtggcggttttatgcagcctgaaaggctgagtgttgaagcaaacaaagcttaactgctgaataagcagcttagaaa > 1:368206‑M1/2‑144 (MQ=255) ctaCAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATAGAGATGAGGCATTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGATAGTTAAAAATAAGTTGACTGCCGGCAATTAAAAGGATTAAGATTTAAAATGCCAGAGCAATCtggcggtggcggttttatgcagcctaaaaggctgagtgttgaagcaaacaaagcttaactgctgaataagc > 1:453487‑M1/2‑144 (MQ=255) aTGCGGGAGCTAAATTTAATAGAGATGAGGCATTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGATAGTTAAAAATAAGTTGACTGCCGGCAATTAAAAGGATTAAGATTTAAAATGCCAGAGCAATCtggcggtggcggttttatgcagcctgaaaggctgagtgttgaagcaaacaaagcttaactgctgaataagcagcttagaaaatggtagctcttactgaaagttcactgccgaac < 1:729806‑M1/251‑115 (MQ=255) | GCATATACGTGATTAACGCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATGAAAAAAACACTTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTTTACAAGATGCTGGAGCTAAATTTAATAGAGATGGGGCGTTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGACAGTTAAAAATAAGTTGGCTGCCGGCAATTAAAAGGAGTAAGATTTAAAACGCCAGAGCAATC‑‑‑‑‑‑TAGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAAC > 1/602355‑602836 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |